当前蛋白身份：P84022
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1MHD CRYSTAL STRUCTURE OF A SMAD MH1 DOMAIN BOUND TO DNA 提交 1998-08-18 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–132（132 aa）
片段：MH1 DOMAIN, RESIDUES 1 - 144
链 B
1–132（132 aa）
片段：MH1 DOMAIN, RESIDUES 1 - 144
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；pH 5.6
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.288 |
| 1MJS MH2 domain of transcriptional factor SMAD3 提交 2002-08-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
229–425（197 aa）
片段：MH2 domain, residues 229-425
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.91 Å R-free 0.199 |
| 1MK2 SMAD3 SBD complex 提交 2002-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
220–425（206 aa）
片段：MH2 domain, residues 220-425
|
未记录 | ACY ACETIC ACID × 8 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.74 Å R-free 0.271 |
| 1MK2 SMAD3 SBD complex 提交 2002-08-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
220–425（206 aa）
片段：MH2 domain, residues 220-425
|
未记录 | ACY ACETIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.74 Å R-free 0.271 |
| 1OZJ Crystal structure of Smad3-MH1 bound to DNA at 2.4 A resolution 提交 2003-04-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–144（144 aa）
片段：DWA DOMAIN
链 B
1–144（144 aa）
片段：DWA DOMAIN
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；citrate, PEG2000, ammonium acetate, spermine, magnesium chloride, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.270 |
| 1U7F Crystal Structure of the phosphorylated Smad3/Smad4 heterotrimeric complex 提交 2004-08-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
228–424（197 aa）
片段：MH2 and Linker domains
链 C
228–424（197 aa）
片段：MH2 and Linker domains
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；50 mM Tris-HCl, 0-15 mM magnesium chloride, 5-15% ethanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.247 |
| 2LAJ Third WW domain of human Nedd4L in complex with doubly phosphorylated human smad3 derived peptide 提交 2011-03-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
202–211（10 aa）
片段：sequence database residues 202-211
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；285 K；离子强度（mmCIF原始值）0.420；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LB2 Structure of the second domain of human Nedd4L in complex with a phosphorylated pTPY motif derived from human Smad3 提交 2011-03-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
178–189（12 aa）
片段：residues 178-189
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；285 K；离子强度（mmCIF原始值）0.420；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 5OD6 Crystal structure of Smad3-MH1 bound to the GGCGC site. 提交 2017-07-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
11–135（125 aa）
链 B
11–135（125 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M lithium acetate, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.235 |
| 5ODG Crystal structure of Smad3-MH1 bound to the GGCT site. 提交 2017-07-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
11–135（125 aa）
片段：MH1 domain, UNP residues 11-135
链 B
11–135（125 aa）
片段：MH1 domain, UNP residues 11-135
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.02 M sodium potassium phosphate, 0.1 M BisTris propane pH 6.5, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.242 |
| 5ODG Crystal structure of Smad3-MH1 bound to the GGCT site. 提交 2017-07-05 | Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
11–135（125 aa）
片段：MH1 domain, UNP residues 11-135
链 B
11–135（125 aa）
片段：MH1 domain, UNP residues 11-135
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.02 M sodium potassium phosphate, 0.1 M BisTris propane pH 6.5, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.242 |
| 5XOC Crystal structure of human Smad3-FoxH1 complex 提交 2017-05-27 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
220–416（197 aa）
片段：UNP residues 220-416
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.4；293 K；0.1 M citrate pH 5.4, 0.8% ethylene imine polymer and 0.5 M NaCl
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.235 |
| 6ZMN Crystal structure of the Smad3-Smad5 MH1 domain chimera bound to the GGCGC site 提交 2020-07-03 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
10–136（127 aa）
链 B
10–136（127 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZN ZINC ION × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG 3350, 0.2 M sodium acetate
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.252 |