当前蛋白身份：P94692
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1B0P CRYSTAL STRUCTURE OF PYRUVATE-FERREDOXIN OXIDOREDUCTASE FROM DESULFOVIBRIO AFRICANUS 提交 1998-11-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–1232（1231 aa）
链 B
2–1232（1231 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 TPP THIAMINE DIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；CRYSTALLIZATION CONDITIONS:
PEG6000 11%
MGCL2 100MM
CACODYLATE 100MM PH 6.0
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.271 |
| 1KEK Crystal Structure of the Free Radical Intermediate of Pyruvate:Ferredoxin Oxidoreductase 提交 2001-11-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–1232（1231 aa）
链 B
2–1232（1231 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 HTL 2-ACETYL-THIAMINE DIPHOSPHATE × 2 CO2 CARBON DIOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；PEG 6000 10-15%, pH 9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.227 |
| 2C3M Crystal Structure Of Pyruvate-Ferredoxin Oxidoreductase From Desulfovibrio africanus 提交 2005-10-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–1232（1231 aa）
链 B
2–1232（1231 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 TPP THIAMINE DIPHOSPHATE × 2 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 9；10% PEG6000, 100MM MGCL2, 100MM TRIS-HCL PH9, pH 9.00
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.222 |
| 2C3O CRYSTAL STRUCTURE OF THE FREE RADICAL INTERMEDIATE OF PYRUVATE:FERREDOXIN OXIDOREDUCTASE FROM Desulfovibrio africanus 提交 2005-10-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–1232（1231 aa）
链 B
2–1232（1231 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 TPP THIAMINE DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 PYR PYRUVIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；10% PEG6000, 100MM MGCL2, 100 MM NA CACODYLATE PH 6
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.268 |
| 2C3P CRYSTAL STRUCTURE OF THE FREE RADICAL INTERMEDIATE OF PYRUVATE:FERREDOXIN OXIDOREDUCTASE FROM Desulfovibrio africanus 提交 2005-10-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–1232（1231 aa）
链 B
2–1232（1231 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 1TP 1-(2-{(2S,4R,5R)-3-[(4-AMINO-2-METHYLPYRIMIDIN-5-YL)METHYL]-2-[(1S)-1-CARBOXY-1-HYDROXYETHYL]-4-METHYL-1,3-THIAZOLIDIN-5-YL}ETHOXY)-1,1,3,3-TETRAHYDROXY-1LAMBDA~5~-DIPHOSPHOX-1-EN-2-IUM 3-OXIDE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；10% PEG6000, 100MM MGCL2, 100MM NA CACODYLATE PH 6
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.223 |
| 2C3U Crystal Structure Of Pyruvate-Ferredoxin Oxidoreductase From Desulfovibrio africanus, Oxygen inhibited form 提交 2005-10-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–1232（1231 aa）
链 B
2–1232（1231 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 2TP 2-(3-{[4-(HYDROXYAMINO)-2-METHYLPYRIMIDIN-5-YL]METHYL}-4-METHYL-2,3-DIHYDRO-1,3-THIAZOL-5-YL)ETHYL TRIHYDROGEN DIPHOSPHATE × 2 PYR PYRUVIC ACID × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 9；10% PEG6000, 100MM MGCL2, 100MM TRIS-HCL PH 9
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.238 |
| 2C3Y CRYSTAL STRUCTURE OF THE RADICAL FORM OF PYRUVATE:FERREDOXIN OXIDOREDUCTASE FROM Desulfovibrio africanus 提交 2005-10-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–1232（1231 aa）
链 B
2–1232（1231 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 HTL 2-ACETYL-THIAMINE DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 CO2 CARBON DIOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 9；10% PEG6000, 100MM MGCL2, 100MM TRIS-HCL PH 9
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.228 |
| 2C42 Crystal Structure Of Pyruvate-Ferredoxin Oxidoreductase From Desulfovibrio africanus 提交 2005-10-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–1232（1231 aa）
链 B
2–1232（1231 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 TPP THIAMINE DIPHOSPHATE × 2 PYR PYRUVIC ACID × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；10% PEG6000, 100MM MGCL2, 100MM NA CACODYLATE, 5% DTT, pH 6.00
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.219 |
| 2PDA CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN PYRUVATE-FERREDOXIN OXIDOREDUCTASE FROM DESULFOVIBRIO AFRICANUS AND PYRUVATE. 提交 1998-11-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–1232（1231 aa）
链 B
2–1232（1231 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 TPP THIAMINE DIPHOSPHATE × 2 PYR PYRUVIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.2；PEG6000 11%
MGCL2 100MM
CACODYLATE 100MM PH 6.2
PYRUVATE 100MM
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.297 |
| 2UZA CRYSTAL STRUCTURE OF THE FREE RADICAL INTERMEDIATE OF PYRUVATE:FERREDOXIN OXIDOREDUCTASE FROM DESULFOVIBRIO AFRICANUS 提交 2007-04-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–1232（1231 aa）
片段：RESIDUES 2-1232
链 B
2–1232（1231 aa）
片段：RESIDUES 2-1232
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 HTL 2-ACETYL-THIAMINE DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 CO2 CARBON DIOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；10% PEG6000, 100MM MGCL2, 100MM NA CACODYLATE PH 6
|
分辨率 2.42 Å R-free 0.226 |
| 7PLM CryoEM reconstruction of pyruvate ferredoxin oxidoreductase (PFOR) in anaerobic conditions 提交 2021-08-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1232（1232 aa）
链 B
1–1232（1232 aa）
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未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 TPP THIAMINE DIPHOSPHATE × 2 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 PROPANE
|
分辨率 2.90 Å |