当前蛋白身份：P97287
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1WSX Solution structure of MCL-1 提交 2004-11-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
152–308（157 aa）
片段：residues 152-308
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
1mM U-15N Mcl-1 | 50mM Sodium Phoshate; 70mM Sodium Chloride; 0.04% Sodium Azide; 95% H2O, 5% D2O
NMR样品组成
1mM U-13C,15N Mcl-1 | 50mM Sodium Phoshate; 70mM Sodium Chloride; 0.04% Sodium Azide; 95% H2O, 5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2JM6 Solution structure of MCL-1 complexed with NOXAB 提交 2006-10-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
152–308（157 aa）
片段：residues 152-308
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-99% 13C, U-99% 15N] MCL_1, 0.5 mM NOXAB, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.5 mM MCL-1, 0.5 mM [U-100% 13C, U-100% 15N] NOXAB, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-15N] MCL-1, 0.5 mM NOXAB, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2NL9 Crystal structure of the Mcl-1:Bim BH3 complex 提交 2006-10-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
152–189（38 aa）
片段：residues 171-208 and residues 209-327
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 7 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.75；298 K；0.2M zinc acetate, 0.2M imidazole, 2mM TCEP, pH 5.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.203 |
| 2NL9 Crystal structure of the Mcl-1:Bim BH3 complex 提交 2006-10-19 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
152–189（38 aa）
片段：residues 171-208 and residues 209-327
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 28 CL CHLORIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.75；298 K；0.2M zinc acetate, 0.2M imidazole, 2mM TCEP, pH 5.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.203 |
| 2NL9 Crystal structure of the Mcl-1:Bim BH3 complex 提交 2006-10-19 | Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
152–189（38 aa）
片段：residues 171-208 and residues 209-327
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 28 CL CHLORIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.75；298 K；0.2M zinc acetate, 0.2M imidazole, 2mM TCEP, pH 5.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.203 |
| 2NLA Crystal structure of the Mcl-1:mNoxaB BH3 complex 提交 2006-10-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
152–189（38 aa）
片段：residues 171-208 and residues 209-327
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；12% PEG 4K, 4% isopropanol, 5% dioxane, 0.1M tris-HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.291 |
| 2ROC Solution structure of Mcl-1 Complexed with Puma 提交 2008-03-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
152–308（157 aa）
片段：residues 152-308
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120 mM；压力 ambient
NMR样品组成
0.5mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Mcl-1; 0.5mM Puma; 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.5mM Mcl-1; 0.5mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Puma; 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2ROD Solution Structure of MCL-1 Complexed with NoxaA 提交 2008-03-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
152–308（157 aa）
片段：residues 152-308
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120 mM；压力 ambient
NMR样品组成
0.5mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Mcl-1; 0.5mM NoxaA; 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.5mM Mcl-1; 0.5mM [U-100% 13C; U-100% 15N] NoxaA; 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3D7V Crystal structure of Mcl-1 in complex with an Mcl-1 selective BH3 ligand 提交 2008-05-22 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
152–189（38 aa）
片段：Bcl-2 like domain, Myeloid Cell Leukemia 1
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.75；298 K；0.2M Zinc Acetate, 0.2M Imidazole, pH 5.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.241 |
| 3IO9 BimL12Y in complex with Mcl-1 提交 2009-08-14 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
152–189（38 aa）
片段：Fusion protein of mouse Mcl-1 residues 152-189 and human Mcl-1 residues 209-327
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.75；298 K；0.15M zinc acetate, 0.15 M imidizole, pH 5.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.251 |
| 4BPI Mcl-1 bound to alpha beta Puma BH3 peptide 2 提交 2013-05-27 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
152–189（38 aa）
片段：FUSION PROTEIN OF MOUSE MCL-1, RESIDUES 152-189 AND HUMAN MCL-1, RESIDUES 209-327
|
未记录 | CD CADMIUM ION × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；0.1M HEPES, PH7.5 1M SODIUM ACETATE, 0.05M CADMIUM SULPHATE
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.243 |
| 4BPJ Mcl-1 bound to alpha beta Puma BH3 peptide 3 提交 2013-05-27 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
152–308（157 aa）
片段：FUSION PROTEIN OF MOUSE MCL-1, RESIDUES 152-189 AND HUMAN MCL-1 RESIDUES, 209-327
|
未记录 | ZN ZINC ION × 10 CL CHLORIDE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；0.2M IMADAZOLE, PH7.0 0.2M ZINC ACETATE
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分辨率 1.60 Å R-free 0.230 |
| 4G35 Mcl-1 in complex with a biphenyl cross-linked Noxa peptide. 提交 2012-07-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
152–308（157 aa）
片段：residues 152-308
|
未记录 | 4BP 4,4'-bis(bromomethyl)biphenyl × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；15% Peg 8000, 225 mM CaCl2, 2% Ethylene Glycol,50 mM Epps (pH 8.5), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.239 |
| 5MES MCL1 FAB COMPLEX IN COMPLEX WITH COMPOUND 29 提交 2016-11-16 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
153–221（69 aa）
|
未记录 | 7LT (5~{R},13~{S},17~{S})-5-[[4-chloranyl-3-(2-phenylethyl)phenyl]methyl]-13-[(4-chlorophenyl)methyl]-8-methyl-1,4,8,12,16-pentazatricyclo[15.8.1.0^{20,25}]hexacosa-20(25),21,23-triene-3,7,15,26-tetrone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 8K 10%w/v, PEG 1500 10%w/v
|
分辨率 2.24 Å R-free 0.230 |
| 5MEV MCL1 FAB COMPLEX IN COMPLEX WITH COMPOUND 21 提交 2016-11-16 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
153–221（69 aa）
|
未记录 | 7LW (5~{R},13~{S},17~{S})-5-[(3,4-dichlorophenyl)methyl]-8-methyl-13-[(4-methylsulfonylphenyl)methyl]-1,4,8,12,16-pentazatricyclo[15.8.1.0^{20,25}]hexacosa-20,22,24-triene-3,7,15,26-tetrone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 8K 10%w/v, PEG 1500 10%w/v
|
分辨率 2.94 Å R-free 0.302 |
| 5VX2 Mcl-1 in complex with Bim-h3Pc-RT 提交 2017-05-23 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
152–189（38 aa）
片段：UNP P97287 residues 152-189, UNP Q07820 residues 209-327
链 C
152–189（38 aa）
片段：UNP P97287 residues 152-189, UNP Q07820 residues 209-327
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；281 K；20 % PEG 3000, 100 mM trisodium citrate buffered with citric acid pH 5.5
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.210 |
| 6DM8 Understanding the Species Selectivity of Myeloid cell leukemia-1 (Mcl-1) inhibitors 提交 2018-06-04 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
154–302（149 aa）
|
未记录 | 6AK 4-{8-chloro-11-[3-(4-chloro-3,5-dimethylphenoxy)propyl]-1-oxo-7-(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)-4,5-dihydro-1H-[1,4]diazepino[1,2-a]indol-2(3H)-yl}-1-methyl-1H-indole-6-carboxylic acid × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；PEG6000, Bicine
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.288 |
| 6DM8 Understanding the Species Selectivity of Myeloid cell leukemia-1 (Mcl-1) inhibitors 提交 2018-06-04 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
154–302（149 aa）
|
未记录 | 6AK 4-{8-chloro-11-[3-(4-chloro-3,5-dimethylphenoxy)propyl]-1-oxo-7-(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)-4,5-dihydro-1H-[1,4]diazepino[1,2-a]indol-2(3H)-yl}-1-methyl-1H-indole-6-carboxylic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；PEG6000, Bicine
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.288 |
| 6DM8 Understanding the Species Selectivity of Myeloid cell leukemia-1 (Mcl-1) inhibitors 提交 2018-06-04 | Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
154–302（149 aa）
|
未记录 | 6AK 4-{8-chloro-11-[3-(4-chloro-3,5-dimethylphenoxy)propyl]-1-oxo-7-(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)-4,5-dihydro-1H-[1,4]diazepino[1,2-a]indol-2(3H)-yl}-1-methyl-1H-indole-6-carboxylic acid × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；PEG6000, Bicine
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.288 |
| 6DM8 Understanding the Species Selectivity of Myeloid cell leukemia-1 (Mcl-1) inhibitors 提交 2018-06-04 | Assembly 4 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
154–302（149 aa）
|
未记录 | 6AK 4-{8-chloro-11-[3-(4-chloro-3,5-dimethylphenoxy)propyl]-1-oxo-7-(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)-4,5-dihydro-1H-[1,4]diazepino[1,2-a]indol-2(3H)-yl}-1-methyl-1H-indole-6-carboxylic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；PEG6000, Bicine
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.288 |
| 6DM8 Understanding the Species Selectivity of Myeloid cell leukemia-1 (Mcl-1) inhibitors 提交 2018-06-04 | Assembly 5 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
154–302（149 aa）
|
未记录 | 6AK 4-{8-chloro-11-[3-(4-chloro-3,5-dimethylphenoxy)propyl]-1-oxo-7-(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)-4,5-dihydro-1H-[1,4]diazepino[1,2-a]indol-2(3H)-yl}-1-methyl-1H-indole-6-carboxylic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；PEG6000, Bicine
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.288 |
| 6DM8 Understanding the Species Selectivity of Myeloid cell leukemia-1 (Mcl-1) inhibitors 提交 2018-06-04 | Assembly 6 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
154–302（149 aa）
|
未记录 | 6AK 4-{8-chloro-11-[3-(4-chloro-3,5-dimethylphenoxy)propyl]-1-oxo-7-(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)-4,5-dihydro-1H-[1,4]diazepino[1,2-a]indol-2(3H)-yl}-1-methyl-1H-indole-6-carboxylic acid × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；PEG6000, Bicine
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.288 |
| 6DM8 Understanding the Species Selectivity of Myeloid cell leukemia-1 (Mcl-1) inhibitors 提交 2018-06-04 | Assembly 7 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
154–302（149 aa）
|
未记录 | 6AK 4-{8-chloro-11-[3-(4-chloro-3,5-dimethylphenoxy)propyl]-1-oxo-7-(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)-4,5-dihydro-1H-[1,4]diazepino[1,2-a]indol-2(3H)-yl}-1-methyl-1H-indole-6-carboxylic acid × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；PEG6000, Bicine
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.288 |
| 6DM8 Understanding the Species Selectivity of Myeloid cell leukemia-1 (Mcl-1) inhibitors 提交 2018-06-04 | Assembly 8 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H
154–302（149 aa）
|
未记录 | 6AK 4-{8-chloro-11-[3-(4-chloro-3,5-dimethylphenoxy)propyl]-1-oxo-7-(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)-4,5-dihydro-1H-[1,4]diazepino[1,2-a]indol-2(3H)-yl}-1-methyl-1H-indole-6-carboxylic acid × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；PEG6000, Bicine
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.288 |