当前蛋白身份:P98052 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1XME Structure of Recombinant Cytochrome ba3 Oxidase from Thermus thermophilus 提交 2004-10-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 1–168(168 aa)
未记录 BNG nonyl beta-D-glucopyranoside × 1 CU COPPER (II) ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 HAS HEME-AS × 1 GOL GLYCEROL × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;297 K;Peg 2000, Bis-tris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
分辨率 2.30 Å R-free 0.236
2CUA THE CUA DOMAIN OF CYTOCHROME BA3 FROM THERMUS THERMOPHILUS 提交 1999-02-18 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 34–168(135 aa) 片段:SOLUBLE CUA-CONTAINING DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5;0.2-20% MPEG 5K 100MM NA CACODYLATE PH 6.5 1MM ZNCL2
分辨率 1.60 Å R-free 0.296
2CUA THE CUA DOMAIN OF CYTOCHROME BA3 FROM THERMUS THERMOPHILUS 提交 1999-02-18 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 34–168(135 aa) 片段:SOLUBLE CUA-CONTAINING DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5;0.2-20% MPEG 5K 100MM NA CACODYLATE PH 6.5 1MM ZNCL2
分辨率 1.60 Å R-free 0.296
2FWL The cytochrome c552/CuA complex from Thermus thermophilus 提交 2006-02-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–135(135 aa)
未记录 HEC HEME C × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)20mM phosphate buffer;压力 ambient
NMR样品组成 0.5mM cytochrome c552 U-15N, 20mM phosphate buffer, 2mM CuA domain, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.5mM CuA domain U-15N, 20mM phosphate buffer, 2mM cytochrome c552, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
2LLN Solution structure of Thermus thermophilus apo-CuA 提交 2011-11-15 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 11–135(125 aa) 片段:UNP residues 11-135
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.1;压力 ambient
NMR样品组成 0.8 -1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein, 100 mM potassium phosphate, 2 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8 -1 mM [U-99% 15N] protein, 100 mM potassium phosphate, 2 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8 - 1 mM protein, 100 mM potassium phosphate, 2 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
5U7N CRYSTAL STRUCTURE OF A CHIMERIC CUA DOMAIN (SUBUNIT II) OF CYTOCHROME BA3 FROM THERMUS THERMOPHILUS WITH THE AMICYANIN LOOP 提交 2016-12-12 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 11–116(106 aa) 片段:UNP residues 11-116,127-135
链 A 127–135(9 aa) 片段:UNP residues 11-116,127-135
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;295 K;60 % (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
分辨率 2.30 Å R-free 0.226
5U7N CRYSTAL STRUCTURE OF A CHIMERIC CUA DOMAIN (SUBUNIT II) OF CYTOCHROME BA3 FROM THERMUS THERMOPHILUS WITH THE AMICYANIN LOOP 提交 2016-12-12 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 11–116(106 aa) 片段:UNP residues 11-116,127-135
链 B 127–135(9 aa) 片段:UNP residues 11-116,127-135
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;295 K;60 % (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
分辨率 2.30 Å R-free 0.226
5U7N CRYSTAL STRUCTURE OF A CHIMERIC CUA DOMAIN (SUBUNIT II) OF CYTOCHROME BA3 FROM THERMUS THERMOPHILUS WITH THE AMICYANIN LOOP 提交 2016-12-12 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 11–116(106 aa) 片段:UNP residues 11-116,127-135
链 C 127–135(9 aa) 片段:UNP residues 11-116,127-135
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;295 K;60 % (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
分辨率 2.30 Å R-free 0.226
5U7N CRYSTAL STRUCTURE OF A CHIMERIC CUA DOMAIN (SUBUNIT II) OF CYTOCHROME BA3 FROM THERMUS THERMOPHILUS WITH THE AMICYANIN LOOP 提交 2016-12-12 Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 D 11–116(106 aa) 片段:UNP residues 11-116,127-135
链 D 127–135(9 aa) 片段:UNP residues 11-116,127-135
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;295 K;60 % (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
分辨率 2.30 Å R-free 0.226
5U7N CRYSTAL STRUCTURE OF A CHIMERIC CUA DOMAIN (SUBUNIT II) OF CYTOCHROME BA3 FROM THERMUS THERMOPHILUS WITH THE AMICYANIN LOOP 提交 2016-12-12 Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 E 11–116(106 aa) 片段:UNP residues 11-116,127-135
链 E 127–135(9 aa) 片段:UNP residues 11-116,127-135
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;295 K;60 % (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
分辨率 2.30 Å R-free 0.226
5U7N CRYSTAL STRUCTURE OF A CHIMERIC CUA DOMAIN (SUBUNIT II) OF CYTOCHROME BA3 FROM THERMUS THERMOPHILUS WITH THE AMICYANIN LOOP 提交 2016-12-12 Assembly 6 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 F 11–116(106 aa) 片段:UNP residues 11-116,127-135
链 F 127–135(9 aa) 片段:UNP residues 11-116,127-135
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;295 K;60 % (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
分辨率 2.30 Å R-free 0.226
5U7N CRYSTAL STRUCTURE OF A CHIMERIC CUA DOMAIN (SUBUNIT II) OF CYTOCHROME BA3 FROM THERMUS THERMOPHILUS WITH THE AMICYANIN LOOP 提交 2016-12-12 Assembly 7 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 G 11–116(106 aa) 片段:UNP residues 11-116,127-135
链 G 127–135(9 aa) 片段:UNP residues 11-116,127-135
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;295 K;60 % (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
分辨率 2.30 Å R-free 0.226
5U7N CRYSTAL STRUCTURE OF A CHIMERIC CUA DOMAIN (SUBUNIT II) OF CYTOCHROME BA3 FROM THERMUS THERMOPHILUS WITH THE AMICYANIN LOOP 提交 2016-12-12 Assembly 8 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 H 11–116(106 aa) 片段:UNP residues 11-116,127-135
链 H 127–135(9 aa) 片段:UNP residues 11-116,127-135
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;295 K;60 % (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
分辨率 2.30 Å R-free 0.226
6PTT Soluble model of Arabidopsis thaliana CuA (Tt3LAt) 提交 2019-07-16 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 11–135(125 aa)
未记录 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;291 K;100 mM Hepes, 1.5 M LiSO4, pH 7.5
分辨率 1.84 Å R-free 0.214
6PTT Soluble model of Arabidopsis thaliana CuA (Tt3LAt) 提交 2019-07-16 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 11–135(125 aa)
未记录 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;291 K;100 mM Hepes, 1.5 M LiSO4, pH 7.5
分辨率 1.84 Å R-free 0.214
6PTY Soluble model of human CuA (Tt3Lh) 提交 2019-07-16 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 11–135(125 aa)
未记录 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;291 K;100 mM Hepes, 1.6 M (NH4)2SO4, 0.1 mM NaCl, pH 7.5
分辨率 1.98 Å R-free 0.238
6PTY Soluble model of human CuA (Tt3Lh) 提交 2019-07-16 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 11–135(125 aa)
未记录 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;291 K;100 mM Hepes, 1.6 M (NH4)2SO4, 0.1 mM NaCl, pH 7.5
分辨率 1.98 Å R-free 0.238