当前蛋白身份：P9WGY9
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5UH5 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 3 nt of RNA 提交 2017-01-10 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；400 ul 50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
|
分辨率 3.75 Å R-free 0.248 |
| 5UH6 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 2ntRNA in complex with Rifampin 提交 2017-01-11 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
|
分辨率 3.84 Å R-free 0.264 |
| 5UH8 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 4nt RNA 提交 2017-01-11 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
|
分辨率 4.18 Å R-free 0.257 |
| 5UH9 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 2nt RNA 提交 2017-01-11 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.3, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
|
分辨率 4.40 Å R-free 0.332 |
| 5UHA Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex 提交 2017-01-11 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
|
分辨率 3.91 Å R-free 0.279 |
| 5UHB Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex in complex with Rifampin 提交 2017-01-11 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
|
分辨率 4.29 Å R-free 0.267 |
| 5UHC Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 3nt RNA in complex with Rifampin 提交 2017-01-11 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.5, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.267 |
| 5UHD Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 4nt RNA in complex with Rifampin 提交 2017-01-11 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
|
分辨率 4.01 Å R-free 0.264 |
| 5UHE Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex in complex with D-AAP1 提交 2017-01-11 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 88G Nalpha-(benzenecarbonyl)-N-(2-methylphenyl)-D-phenylalaninamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.3, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
|
分辨率 4.04 Å R-free 0.259 |
| 5UHF Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex in complex with D-IX336 提交 2017-01-11 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 88D N-(2-methylphenyl)-Nalpha-(selenophene-2-carbonyl)-D-phenylalaninamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.4, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
|
分辨率 4.34 Å R-free 0.267 |
| 5UHG Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex in complex with D-AAP1 and Rifampin 提交 2017-01-11 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 88G Nalpha-(benzenecarbonyl)-N-(2-methylphenyl)-D-phenylalaninamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
|
分辨率 3.97 Å R-free 0.260 |
| 5ZX2 Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase transcription initiation complex with ECF sigma factor sigma H and 7nt RNA 提交 2018-05-17 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 C
7–1178（1172 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；2% Tacsimate pH 5.0, 0.1 M Sodium citrate pH5.6, 16 % PEG3350
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.255 |
| 5ZX3 Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase holoenzyme with ECF sigma factor sigma H 提交 2018-05-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
7–1178（1172 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；0.2 M NaAc, 0.1 M sodium citrate pH5.5, 10% PEG4000
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.258 |
| 6DV9 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) containing 5nt RNA with 4nt spacer 提交 2018-06-23 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.5, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.232 |
| 6DVB Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) containing 5nt RNA with 5nt spacer 提交 2018-06-23 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.7, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.241 |
| 6DVC Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) containing 5nt RNA with 6nt spacer 提交 2018-06-23 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 6.0, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.235 |
| 6DVD Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) with 6 nt spacer and bromine labelled in position "-11 提交 2018-06-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 6.2, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
|
分辨率 3.90 Å R-free 0.246 |
| 6DVE Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF selenomethionine-labelled sigma factor L) with 6 nt spacer 提交 2018-06-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.5, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
|
分辨率 3.81 Å R-free 0.248 |
| 6FBV Single particle cryo em structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase in complex with Fidaxomicin 提交 2017-12-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 FI8 Fidaxomicin × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；3.5 microliter 1 microM Mtb RNAP-Lpm and 50 microMolar Lpm in 20 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 5 mM MgCl2, 5 mM dithiothreitol, and 0.1% n-octyl-beta-D-glucopyranoside
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.52 Å R-free 0.331 |
| 6JCX Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex with ECF sigma factor sigma H and 6nt RNA 提交 2019-01-30 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 C
7–1178（1172 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.08M Magnesium acetate, 0.05M sodium cacodylate pH 6.5, 15% PEG 400
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.256 |
| 6JCY Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase transcription initiation open complex with a chimeric ECF sigma factor sigH/E 提交 2019-01-30 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 C
7–1178（1172 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.2M sodium acetate, 0.1M sodium citrate pH 5.5, 10% PEG4000
|
分辨率 3.11 Å R-free 0.238 |
| 6KON Mycobacterium tuberculosis initial transcription complex comprising sigma H and 5'-OH RNA of 5 nt 提交 2019-08-12 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 C
7–1178（1172 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.08 M Magnesium acetate, 0.05 M sodium cacodylate pH 6.5, 10% PEG 400
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.271 |
| 6KOO Mycobacterium tuberculosis initial transcription complex comprising sigma H and 5'-OH RNA of 7 nt 提交 2019-08-12 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 C
7–1178（1172 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.08 M Magnesium acetate, 0.05 M sodium cacodylate pH 6.5, 15% PEG 400
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.248 |
| 6KOP Mycobacterium tuberculosis initial transcription complex comprising sigma H and 5'-OH RNA of 9 nt 提交 2019-08-12 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 C
7–1178（1172 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.008 M magnesium acetate, 0.05 M sodium cacodylate pH6.5, 14% PEG 400
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.255 |
| 6KOQ Mycobacterium tuberculosis initial transcription complex comprising sigma H and 5'-OH RNA of 10 nt 提交 2019-08-12 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 C
7–1178（1172 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.08 M magnesium acetate, 0.05 M sodium cacodylated pH 6.5, 15% PEG 400
|
分辨率 3.35 Å R-free 0.260 |
| 7PP4 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase holoenzyme comprising sigma factor SigB 提交 2021-09-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 c
6–1178（1173 aa）
|
突变：L2E3G4C5 -> V | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.84 Å |
| 7Q4U Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase holoenzyme octamer comprising sigma factor SigB 提交 2021-11-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric（48） 与蛋白数一致 |
链 BA
6–1178（1173 aa）
链 C
6–1178（1173 aa）
链 HA
6–1178（1173 aa）
链 I
6–1178（1173 aa）
链 NA
6–1178（1173 aa）
链 O
6–1178（1173 aa）
链 TA
6–1178（1173 aa）
链 V
6–1178（1173 aa）
|
突变：L2E3G4C5 -> V 突变：L2E3G4C5 -> V 突变：L2E3G4C5 -> V 突变：L2E3G4C5 -> V 突变：L2E3G4C5 -> V 突变：L2E3G4C5 -> V 突变：L2E3G4C5 -> V 突变：L2E3G4C5 -> V | ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.39 Å |
| 7Q59 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase holoenzyme dimer comprising sigma factor SigB 提交 2021-11-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 C
6–1178（1173 aa）
链 c
6–1178（1173 aa）
|
突变：L2E3G4C5 -> V 突变：L2E3G4C5 -> V | ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.36 Å |
| 7Z8Q Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase core 提交 2022-03-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 c
6–1178（1173 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.08 Å |
| 8CWR Complex structure of WhiB3 and the SigmaAr4-RNAP Beta flap tip chimera in space group R3 提交 2022-05-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
815–829（15 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 SO4 SULFATE ION × 6 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 NI NICKEL (II) ION × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；10-20 mM NiCl2, 0.8-1.0 M Li2SO4
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.212 |
| 8CWT Complex structure of WhiB3 and the SigmaAr4-RNAP Beta flap tip chimera in space group P43212 提交 2022-05-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
815–829（15 aa）
链 D
815–829（15 aa）
链 F
815–829（15 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 SO4 SULFATE ION × 25 NI NICKEL (II) ION × 7 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；10-20 mM NiCl2, 0.8-1.0 M Li2SO4
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.174 |
| 8D5V WhiB6 bound to the SigmaAr4-RNAP Beta flap tip chimera 提交 2022-06-06 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
815–829（15 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；0.1 M Na Citrate pH 5.5, 20% PEG3000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.231 |
| 8D5V WhiB6 bound to the SigmaAr4-RNAP Beta flap tip chimera 提交 2022-06-06 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
815–829（15 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；0.1 M Na Citrate pH 5.5, 20% PEG3000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.231 |
| 8EHQ Mycobacterium tuberculosis paused transcription complex with Bacillus subtilis NusG 提交 2022-09-14 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
|
分辨率 3.00 Å |
| 8EJ3 M. tuberculosis RNAP pause escaped complex with Bacillus subtilis NusG and GMPCPP 提交 2022-09-16 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
|
分辨率 3.13 Å |
| 8EOE Mycobacterium tuberculosis transcription elongation complex with Bacillus subtilis NusG (EC_LG) 提交 2022-10-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
|
分辨率 3.20 Å |
| 8EOF Mycobacterium tuberculosis transcription elongation complex with Bacillus subtilis NusG (EC_PG) 提交 2022-10-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
|
分辨率 3.30 Å |
| 8EOS M. tuberculosis RNAP elongation complex with NusG and CMPCPP 提交 2022-10-04 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | 2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
|
分辨率 3.10 Å |
| 8EOT M. tuberculosis RNAP elongation complex with NusG 提交 2022-10-04 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
|
分辨率 3.30 Å |
| 8EXY M. tuberculosis RNAP paused complex with B. subtilis NusG and GMPCPP 提交 2022-10-26 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
|
分辨率 3.20 Å |
| 8HIH Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex with transcription factor GlnR 提交 2022-11-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric（13） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.66 Å |
| 9FJP Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis sigma-B RNA polymerase bound to -10 promoter element ssDNA oligo 提交 2024-05-31 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 c
6–1178（1173 aa）
|
突变：L2E3G4C5I6 -> V | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9；8 mM CHAPSO added before vitrificaion
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9FJR Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis sigma-B RNA polymerase bound to -10 promoter element ssDNA oligo - sigma-B docked conformation 提交 2024-05-31 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 c
6–1178（1173 aa）
|
突变：L2E3G4C5I6 -> V | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9；8 mM CHAPSO added before vitrificaion
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.43 Å |
| 9FJS Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis sigma-B RNA polymerase bound to -10 promoter element ssDNA oligo - sigma-B undocked conformation 提交 2024-05-31 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 c
6–1178（1173 aa）
|
突变：L2E3G4C5I6 -> V | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9；8 mM CHAPSO added before vitrificaion
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.48 Å |
| 9JI2 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with unphosphated PhoP 提交 2024-09-11 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.38 Å |
| 9JI3 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with two PhoP molecules 提交 2024-09-11 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.36 Å |
| 9JI4 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with four PhoP molecules 提交 2024-09-11 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric（12） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å |
| 9JI5 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with six PhoP molecules 提交 2024-09-11 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric（15） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9KET Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with two PhoP molecules(composite map) 提交 2024-11-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.46 Å |
| 9KEU Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with four PhoP molecules (composite map) 提交 2024-11-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric（12） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 9KEV Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with six PhoP molecules (composite map) 提交 2024-11-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric（15） 待复核 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.31 Å |
| 9M98 Structural Basis of Pausing During Transcription Initiation in Mycobacterium tuberculosis 提交 2025-03-13 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 C
7–1178（1172 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.47 Å |
| 9M9D Structural Basis of Pausing During Transcription Initiation in Mycobacterium tuberculosis 提交 2025-03-13 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.29 Å |
| 9M9E Structural Basis of Pausing During Transcription Initiation in Mycobacterium tuberculosis 提交 2025-03-13 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.31 Å |
| 9MRQ Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase elongation complex bound to inhibitor N-aroyl-N-aryl-phenylalanine amide (AAP)-SO2 提交 2025-01-08 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–1178（1178 aa）
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未记录 | A1BNV N-[2-(1,1-dioxo-1lambda~6~-thiomorpholin-4-yl)phenyl]-Nalpha-(2-fluorobenzoyl)-D-phenylalaninamide × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å |