当前蛋白身份:Q02647 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4DS1 The Structure of a Yeast Dyn2-Nup159 Complex and the Molecular Basis for the Dynein Light Chain - Nuclear Pore Interaction 提交 2012-02-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–92(92 aa)
链 C 1–92(92 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;0.3 M Ammonium acetate, 5% methyl pentanediol (v/v), 35% PEG 4000 (w/v), pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.85 Å R-free 0.187
4HT6 The Structure of a Yeast Dynein Dyn2-Pac11 Complex and Effect on Single Molecule Dynein Motor Activity 提交 2012-10-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–92(92 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.8;293 K;0.4M sodium phosphate monobasic, 0.1M 1,6-hexanediol, 25% PEG 3350 (w/v), pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.212
4HT6 The Structure of a Yeast Dynein Dyn2-Pac11 Complex and Effect on Single Molecule Dynein Motor Activity 提交 2012-10-31 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–92(92 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.8;293 K;0.4M sodium phosphate monobasic, 0.1M 1,6-hexanediol, 25% PEG 3350 (w/v), pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.212
4HT6 The Structure of a Yeast Dynein Dyn2-Pac11 Complex and Effect on Single Molecule Dynein Motor Activity 提交 2012-10-31 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 1–92(92 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.8;293 K;0.4M sodium phosphate monobasic, 0.1M 1,6-hexanediol, 25% PEG 3350 (w/v), pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.212
4HT6 The Structure of a Yeast Dynein Dyn2-Pac11 Complex and Effect on Single Molecule Dynein Motor Activity 提交 2012-10-31 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 E 1–92(92 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.8;293 K;0.4M sodium phosphate monobasic, 0.1M 1,6-hexanediol, 25% PEG 3350 (w/v), pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.212
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 448 PDB 声明:448-meric(448) 与蛋白数一致
链 o 1–92(92 aa)
链 p 1–92(92 aa)
链 q 1–92(92 aa)
链 r 1–92(92 aa)
链 s 1–92(92 aa)
链 t 1–92(92 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE;A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)
分辨率 37.00 Å
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 56 PDB 声明:56-meric(56) 与蛋白数一致
链 o 1–92(92 aa)
链 p 1–92(92 aa)
链 q 1–92(92 aa)
链 r 1–92(92 aa)
链 s 1–92(92 aa)
链 t 1–92(92 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE;A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)
分辨率 37.00 Å
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 56 PDB 声明:56-meric(56) 与蛋白数一致
链 o 1–92(92 aa)
链 p 1–92(92 aa)
链 q 1–92(92 aa)
链 r 1–92(92 aa)
链 s 1–92(92 aa)
链 t 1–92(92 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE;A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)
分辨率 37.00 Å