当前蛋白身份:Q03132
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11SZ Antibody (1B2) Bound Rifamycin Synthetase Module 2 提交 2026-03-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 A
3489–3567(79 aa)
链 B
3489–3567(79 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.94 Å |
| 1PZQ Structure of fused docking domains from the erythromycin polyketide synthase (DEBS), a model for the interaction between DEBS 2 and DEBS 3: The A domain 提交 2003-07-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
3490–3547(58 aa)
片段:C-terminal fragment
链 B
3490–3547(58 aa)
片段:C-terminal fragment
|
突变:L1G, F2S 突变:L1G, F2S | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100mM phosphate buffer NA;压力 ambient
NMR样品组成
1mM DOCK23 U-15N,13C: 100mM phosphate buffer NA: trace amounts of sodium azide, AEBSF protease inhibitor cocktail and TSP 1H shift reference: 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1mM DOCK23 (50% U-15N,13C: 50% unlabeled): 100mM phosphate buffer NA: trace amounts of sodium azide, AEBSF protease inhibitor cocktail and TSP 1H shift reference: 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1PZR Structure of fused docking domains from the erythromycin polyketide synthase (DEBS), a model for the interaction between DEBS2 and DEBS3: the B domain 提交 2003-07-14 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
3548–3567(20 aa)
片段:RESIDUES 61-120
链 B
3548–3567(20 aa)
片段:RESIDUES 61-120
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100mM phosphate buffer NA;压力 ambient
NMR样品组成
1mM DOCK23 U-15N,13C: 100mM phosphate buffer NA: trace amounts of sodium azide, AEBSF protease inhibitor cocktail and TSP 1H shift reference: 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1mM DOCK23 (50% U-15N,13C: 50% unlabeled): 100mM phosphate buffer NA: trace amounts of sodium azide, AEBSF protease inhibitor cocktail and TSP 1H shift reference: 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 3EL6 Crystal Structure of the Erythromycin Dehydratase 提交 2008-09-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
2362–2653(292 aa)
片段:EryDH4 (UNP residues 2362 to 2653)
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.4;295 K;2.15 M ammonium sulfate, 100 mM sodium cacodylate pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.227 |
| 6C9U Crystal structure of [KS3][AT3] didomain from module 3 of 6-deoxyerthronolide B synthase in complex with antibody fragment (Fab) 提交 2018-01-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 A
2–922(921 aa)
片段:[KS3][AT3] didomain from module 3
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | K POTASSIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;285 K;200 mM potassium citrate, 20%(w/v) PEG 3,350 and 12% ethylene glycol)
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.210 |
| 7M7E 6-Deoxyerythronolide B synthase (DEBS) hybrid module (M3/1) in complex with antibody fragment 1B2 提交 2021-03-28 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
2–922(921 aa)
片段:EryA2 (UNP residues 2-922) + EryA1 (UNP residues 1457-2015) + EryA3 (UNP residues 2896-3172)
链 B
2–922(921 aa)
片段:EryA2 (UNP residues 2-922) + EryA1 (UNP residues 1457-2015) + EryA3 (UNP residues 2896-3172)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7S6C CryoEM structure of modular PKS holo-Lsd14 stalled at the condensation step and bound to antibody fragment 1B2, composite structure 提交 2021-09-13 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致 |
链 A
2–30(29 aa)
链 B
2–30(29 aa)
链 C
2–30(29 aa)
链 D
2–30(29 aa)
|
未记录 | ATR 2'-MONOPHOSPHOADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 5 seconds before plunging in liquid ethane.
|
分辨率 3.10 Å |
| 7S6D CryoEM structure of modular PKS holo-Lsd14 bound to antibody fragment 1B2, composite structure 提交 2021-09-13 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致 |
链 A
2–30(29 aa)
链 B
2–30(29 aa)
链 C
2–30(29 aa)
|
未记录 | ATR 2'-MONOPHOSPHOADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 5 seconds before plunging in liquid ethane.
|
分辨率 3.10 Å |