当前蛋白身份：Q03405
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2FD6 Structure of Human Urokinase Plasminogen Activator in Complex with Urokinase Receptor and an anti-upar antibody at 1.9 A 提交 2005-12-13 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 U
23–297（275 aa）
片段：residues 23-297
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 ETX 2-ETHOXYETHANOL × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 NDG 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICRODIALYSIS；pH 6.5；298 K；4% PEG4000, 5% ethylene glycol, 5% methanol, 0.05% sodium azide, 50 mM cacodylate, pH 6.5, MICRODIALYSIS, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.276 |
| 2FD6 Structure of Human Urokinase Plasminogen Activator in Complex with Urokinase Receptor and an anti-upar antibody at 1.9 A 提交 2005-12-13 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 U
23–297（275 aa）
片段：residues 23-297
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 ETX 2-ETHOXYETHANOL × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 NDG 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICRODIALYSIS；pH 6.5；298 K；4% PEG4000, 5% ethylene glycol, 5% methanol, 0.05% sodium azide, 50 mM cacodylate, pH 6.5, MICRODIALYSIS, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.276 |
| 2I9B Crystal structure of ATF-urokinase receptor complex 提交 2006-09-05 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
23–299（277 aa）
片段：UPAR, residues 23-299
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突变：N162Q, N172Q, N200Q, N233Q | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；22.5% w/v PEG3350, 200 mM ammonium sulfate, 100 mM Bis-Tris, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.265 |
| 2I9B Crystal structure of ATF-urokinase receptor complex 提交 2006-09-05 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
23–299（277 aa）
片段：UPAR, residues 23-299
|
突变：N162Q, N172Q, N200Q, N233Q | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；22.5% w/v PEG3350, 200 mM ammonium sulfate, 100 mM Bis-Tris, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.265 |
| 2I9B Crystal structure of ATF-urokinase receptor complex 提交 2006-09-05 | Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
23–299（277 aa）
片段：UPAR, residues 23-299
|
突变：N162Q, N172Q, N200Q, N233Q | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；22.5% w/v PEG3350, 200 mM ammonium sulfate, 100 mM Bis-Tris, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.265 |
| 2I9B Crystal structure of ATF-urokinase receptor complex 提交 2006-09-05 | Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
23–299（277 aa）
片段：UPAR, residues 23-299
|
突变：N162Q, N172Q, N200Q, N233Q | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；22.5% w/v PEG3350, 200 mM ammonium sulfate, 100 mM Bis-Tris, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.265 |
| 3BT1 Structure of urokinase receptor, urokinase and vitronectin complex 提交 2007-12-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 U
23–303（281 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICRODIALYSIS；pH 7.5；295 K；12% PEG 3350, 50mM HEPES pH 7.5, MICRODIALYSIS, temperature 295K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.308 |
| 3BT2 Structure of urokinase receptor, urokinase and vitronectin complex 提交 2007-12-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 U
23–303（281 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICRODIALYSIS；pH 7.5；295 K；8% PEG 4000, 2.5% ethanol, 0.05% sodium azide, 50mM cacodylate pH 6.5, pH 7.5, MICRODIALYSIS, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.272 |
| 3BT2 Structure of urokinase receptor, urokinase and vitronectin complex 提交 2007-12-27 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 U
23–303（281 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICRODIALYSIS；pH 7.5；295 K；8% PEG 4000, 2.5% ethanol, 0.05% sodium azide, 50mM cacodylate pH 6.5, pH 7.5, MICRODIALYSIS, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.272 |
| 3U73 Crystal structure of stabilized human uPAR mutant in complex with ATF 提交 2011-10-13 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 U
23–305（283 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；295 K；0.2M NaCl, 100mM HEPES, pH7.4, 1.8 M ammonium sulfate, vapor diffusion, sitting drop, temperature 295.0K
|
分辨率 3.19 Å R-free 0.258 |
| 3U74 Crystal structure of stabilized human uPAR mutant 提交 2011-10-13 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 U
23–305（283 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；295 K；100 mM HEPES, pH 7.5, 2% (w/v) PEG400, 2 M ammonium sulfate, vapor diffusion, sitting drop, temperature 295.0K
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.252 |
| 4K24 Structure of anti-uPAR Fab ATN-658 in complex with uPAR 提交 2013-04-08 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 U
23–303（281 aa）
片段：UNP residues 23-303
|
未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 55%(v/v) Tacsimate, 2%(v/v) 2-methyl-1,3-propanediol, vapor diffusion, sitting drop, temperature 295K
|
分辨率 4.50 Å R-free 0.275 |
| 4QTI Crystal structure of human uPAR in complex with anti-uPAR Fab 8B12 提交 2014-07-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 U
23–305（283 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；48% MPD, 100mM Tris, 100mM NaCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.296 |
| 7E17 Structure of dimeric uPAR 提交 2021-02-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
23–299（277 aa）
链 B
23–299（277 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；295 K；1.8-2.2 M ammonium sulphate in 50 mM sodium acetate at pH 4.5oC5.2
|
分辨率 2.96 Å R-free 0.299 |
| 7V63 Structure of dimeric uPAR at low pH 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
23–299（277 aa）
链 B
23–299（277 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；295 K；1.8-2.2 M ammonium sulphate in 50 mM sodium acetate at pH 4.5-5.2
|
分辨率 2.91 Å R-free 0.273 |
| 9YC5 Human uPAR bound to the Fab fragment of targeted cancer therapeutic antibody FL1 提交 2025-09-18 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
23–305（283 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；20mM Tris, 150mM NaCl, 2.5% Glycerol, 1mM EDTA, pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.94 Å |
| 9YC6 Mutant human uPAR bound to the Fab fragment of the targeted cancer therapeutic antibody FL1 提交 2025-09-18 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 U
23–305（283 aa）
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突变：H47C, N259C | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；20mM Tris, 150mM NaCl, 2.5% Glycerol, 1mM EDTA, pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.80 Å |