当前蛋白身份:Q03513 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6HBA Crystal Structure of the small subunit-like domain 1 of CcmM from Synechococcus elongatus (strain PCC 7942), thiol-oxidized form 提交 2018-08-10 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 225–313(89 aa) 片段:SSUL domain 1
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.5;277 K;25.5% PEG-3350 and 0.1 M Na-acetate pH 4.5
分辨率 1.65 Å R-free 0.241
6HBA Crystal Structure of the small subunit-like domain 1 of CcmM from Synechococcus elongatus (strain PCC 7942), thiol-oxidized form 提交 2018-08-10 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 225–313(89 aa) 片段:SSUL domain 1
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.5;277 K;25.5% PEG-3350 and 0.1 M Na-acetate pH 4.5
分辨率 1.65 Å R-free 0.241
6HBB Crystal Structure of the small subunit-like domain 1 of CcmM from Synechococcus elongatus (strain PCC 7942) 提交 2018-08-10 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 225–313(89 aa) 片段:SSUL domain 1
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.5;277 K;1.95 M ammonium sulfate and 0.1 M Na-acetate pH 4.5
分辨率 1.20 Å R-free 0.195
6HBB Crystal Structure of the small subunit-like domain 1 of CcmM from Synechococcus elongatus (strain PCC 7942) 提交 2018-08-10 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 225–313(89 aa) 片段:SSUL domain 1
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.5;277 K;1.95 M ammonium sulfate and 0.1 M Na-acetate pH 4.5
分辨率 1.20 Å R-free 0.195
6HBC Structure of the repeat unit in the network formed by CcmM and Rubisco from Synechococcus elongatus 提交 2018-08-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致
链 A 225–313(89 aa) 片段:SSUL domain 1
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;Solutions were made fresh
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot for 3 seconds before plunging
分辨率 2.78 Å
7D6C Crystal structure of CcmM N-terminal domain in complex with CcmN 提交 2020-09-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 1 1–209(209 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;287.15 K;PEG 8000, N-(2-acetamido) iminodiacetic acid
分辨率 2.89 Å R-free 0.272
7D6C Crystal structure of CcmM N-terminal domain in complex with CcmN 提交 2020-09-30 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 2 1–209(209 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;287.15 K;PEG 8000, N-(2-acetamido) iminodiacetic acid
分辨率 2.89 Å R-free 0.272
7O4Z Crystal structure of the carbonic anhydrase-like domain of CcmM from Synechococcus elongatus (strain PCC 7942) 提交 2021-04-07 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–181(181 aa)
未记录 NI NICKEL (II) ION × 3 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;25% PEG-3350 and 0.1 M HEPES pH 7.5
分辨率 1.67 Å R-free 0.200
7O54 Crystal structure of the carbonic anhydrase-like domain of CcmM in complex with the C-terminal 17 residues of CcaA from Synechococcus elongatus (strain PCC 7942) 提交 2021-04-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–181(181 aa)
未记录 NI NICKEL (II) ION × 3 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;25% PEG-3350 and 0.1 M HEPES pH 7.5
分辨率 1.63 Å R-free 0.200
9FWV Rubisco in native beta-carboxysomes 提交 2024-07-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:20-meric(20) 与蛋白数一致
链 A 225–310(86 aa)
链 B 225–310(86 aa)
链 F 225–310(86 aa)
链 T 225–310(86 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å