当前蛋白身份：Q03708
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AYI COLICIN E7 IMMUNITY PROTEIN IM7 提交 1997-11-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–87（87 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；USING THE HANGING DROP METHOD, PROTEIN (10MG/ML) WAS CRYSTALLISED BY MIXING AN EQUAL VOLUME OF PROTEIN WITH A SOLUTION CONTAINING 55% SATURATED DI-AMMONIUM PHOSPHATE AND 200MM TRIS PH7.2. THE DROP WAS EQUILIBRATED AGAINST A WELL CONTAINING 100% SATURATED DI-AMMONIUM PHOSPHATE AT ROOM TEMPERATURE., vapor diffusion - hanging drop
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分辨率 2.00 Å R-free 0.247 |
| 1CEI STRUCTURE DETERMINATION OF THE COLICIN E7 IMMUNITY PROTEIN (IMME7) THAT BINDS SPECIFICALLY TO THE DNASE-TYPE COLICIN E7 AND INHIBITS ITS BACTERIOCIDAL ACTIVITY 提交 1996-03-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–87（87 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；pH 8.
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分辨率 1.80 Å |
| 1MZ8 CRYSTAL STRUCTURES OF THE NUCLEASE DOMAIN OF COLE7/IM7 IN COMPLEX WITH A PHOSPHATE ION AND A ZINC ION 提交 2002-10-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–87（87 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；298 K；PEG4000, sodium phosphate, ammonium acetate, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.00 Å R-free 0.230 |
| 1MZ8 CRYSTAL STRUCTURES OF THE NUCLEASE DOMAIN OF COLE7/IM7 IN COMPLEX WITH A PHOSPHATE ION AND A ZINC ION 提交 2002-10-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–87（87 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；298 K；PEG4000, sodium phosphate, ammonium acetate, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.230 |
| 1UJZ Crystal structure of the E7_C/Im7_C complex; a computationally designed interface between the colicin E7 DNase and the Im7 Immunity protein 提交 2003-08-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–87（87 aa）
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突变：D35Y, | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；PEGMME 2000, ammonium sulfate, Sodium Acetate, Glycerol, DMSO, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.10 Å R-free 0.270 |
| 1UNK STRUCTURE OF COLICIN E7 IMMUNITY PROTEIN 提交 1996-06-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–87（87 aa）
链 B
1–87（87 aa）
链 C
1–87（87 aa）
链 D
1–87（87 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å R-free 0.251 |
| 1ZNV How a His-metal finger endonuclease ColE7 binds and cleaves DNA with a transition metal ion cofactor 提交 2005-05-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–87（87 aa）
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未记录 | NI NICKEL (II) ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；298 K；0.3M phosphate buffer, 50mM NaCl, 20% PEG550 MME, 10% glycerol, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.235 |
| 1ZNV How a His-metal finger endonuclease ColE7 binds and cleaves DNA with a transition metal ion cofactor 提交 2005-05-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–87（87 aa）
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未记录 | NI NICKEL (II) ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；298 K；0.3M phosphate buffer, 50mM NaCl, 20% PEG550 MME, 10% glycerol, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.00 Å R-free 0.235 |
| 2ERH Crystal Structure of the E7_G/Im7_G complex; a designed interface between the colicin E7 DNAse and the Im7 immunity protein 提交 2005-10-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–87（87 aa）
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突变：D35Y, T51Q | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；30% PEG 4K, 0.6M ammonium acetate, 50mM Na acetate, 25% glycerol, 5% DMSO, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.00 Å R-free 0.271 |
| 2JAZ CRYSTAL STRUCTURE OF THE MUTANT N560D OF THE NUCLEASE DOMAIN OF COLE7 IN COMPLEX WITH IM7 提交 2006-12-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–87（87 aa）
链 C
1–87（87 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；20 % W/V PEG3350 AND 0.1 M DI-AMMONIUM HYDROGEN CITRATE, pH 7.00
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分辨率 2.03 Å R-free 0.249 |
| 2JB0 CRYSTAL STRUCTURE OF THE MUTANT H573A OF THE NUCLEASE DOMAIN OF COLE7 IN COMPLEX WITH IM7 提交 2006-12-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–87（87 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；20 % W/V PEG3350 AND 0.2 M DI-AMMONIUM HYDROGEN CITRATE, pH 7.00
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分辨率 1.91 Å R-free 0.250 |
| 2JBG crystal structure of the mutant N560A of the nuclease domain of ColE7 in complex with Im7 提交 2006-12-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–87（87 aa）
链 C
1–87（87 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.6；20 % W/V POLYETHYLENE GLYCOL MONOMETHYL ETHER 2000, 0.2 M AMMONIUM SULFATE, AND 0.1 M SODIUM ACETATE TRIHYDRATE AT PH 4.6
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分辨率 2.20 Å R-free 0.249 |
| 2K0D NMR structure of a mutant colicin e7 immunity protein im7 with an extended helix III 提交 2008-02-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 X
2–51（50 aa）
链 X
65–87（23 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient
NMR测量条件
298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient
NMR测量条件
298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] potassium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-99% 15N] potassium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] potassium phosphate, 100% D2O | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 4F37 Structure of the tethered N-terminus of Alzheimer's disease A peptide 提交 2012-05-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
2–87（86 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M Sodium malonate, 20% (w/v) PEG 3350, 0.1M Bis-tris propane pH 8.5, 0.2M 1-methylimidazolium formate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.57 Å R-free 0.269 |
| 4F37 Structure of the tethered N-terminus of Alzheimer's disease A peptide 提交 2012-05-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
2–87（86 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M Sodium malonate, 20% (w/v) PEG 3350, 0.1M Bis-tris propane pH 8.5, 0.2M 1-methylimidazolium formate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.269 |
| 5WNW Chaperone Spy bound to Im7 6-45 ensemble 提交 2017-08-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
6–45（40 aa）
片段：UNP residues 6-45
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未记录 | IMD IMIDAZOLE × 3 ZN ZINC ION × 8 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；PEG 3000, imidazole, zinc acetate
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分辨率 1.79 Å R-free 0.238 |
| 7CEI THE ENDONUCLEASE DOMAIN OF COLICIN E7 IN COMPLEX WITH ITS INHIBITOR IM7 PROTEIN 提交 1998-09-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–87（87 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；15 MG/ML PROTEIN COMPLEX, 5 MM NA CITRATE, 0.25 M NH4 ACETATE, 10% PEG4000, PH
6.0 VAPOR DIFFUSION AGAINST 22.5% PEG4000
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分辨率 2.30 Å R-free 0.270 |