当前蛋白身份:Q04656 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1AW0 FOURTH METAL-BINDING DOMAIN OF THE MENKES COPPER-TRANSPORTING ATPASE, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1997-10-08 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 375–446(72 aa) 片段:FOURTH METAL-BINDING DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8;300 K
分辨率未提供
1KVI Solution Structure of the Reduced Form of the First Heavy Metal Binding Motif of the Menkes Protein 提交 2002-01-26 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–79(79 aa) 片段:RESIDUES 1-79
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;298 K;压力 1
NMR样品组成 20 mM NaAcetate buffer, 10 mM DTT, 1 mM EDTA, 0.01% Na Azide, 1 mM Protein | H2O/D2O
分辨率未提供
1KVJ Solution Structure of the Cu(I) bound form of the first heavy metal binding motif of the Menkes protein 提交 2002-01-26 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–79(79 aa) 片段:RESIDUES 1-79
未记录 CU1 COPPER (I) ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;295 K;压力 1
NMR样品组成 20 mM Na Acetate buffer, 10 mM DTT, 1 mM EDTA, 0.01% Na Azide, 1 mM Protein | H2O/D2O
分辨率未提供
1Q8L Second Metal Binding Domain of the Menkes ATPase 提交 2003-08-21 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 164–246(83 aa) 片段:Second Copper Binding Domain (residues 164-246)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)30mM;压力 ambient
NMR样品组成 0.5mM MNKr2, U-15N, 20mM potassium phosphate, 10 mM Sodium Chloride, pH6.5. | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
1S6O Solution structure and backbone dynamics of the apo-form of the second metal-binding domain of the Menkes protein ATP7A 提交 2004-01-26 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 169–240(72 aa) 片段:Second soluble domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)phosphate 100 mM;压力 ambient
NMR样品组成 1 mM protein, pH 7 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM protein U-15N, pH 7 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM protein U-15N,13C, pH 7 | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
1S6U Solution structure and backbone dynamics of the Cu(I) form of the second metal-binding domain of the Menkes protein ATP7A 提交 2004-01-27 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 169–240(72 aa) 片段:Second domain of ATP7A
未记录 CU1 COPPER (I) ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100 mM phosphate;压力 ambient
NMR样品组成 1 mM protein, 1:1 copper(I) | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM protein U-15N, 1:1 copper(I) | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM protein U-15N,13C, 1:1 copper(I) | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
1Y3J Solution structure of the copper(I) form of the fifth domain of Menkes protein 提交 2004-11-25 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 486–558(73 aa) 片段:fifth domain of the menkes protein
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50mM sodium phosphate;压力 ambient
NMR样品组成 1mM MNK5 domain U-15N,13C; 50mM phosphate buffer NA | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
1Y3K Solution structure of the apo form of the fifth domain of Menkes protein 提交 2004-11-25 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 486–558(73 aa) 片段:fifth domain of the menkes protein
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50mM sodium phosphate;压力 ambient
NMR样品组成 1mM MNK5 domain U-15N,13C; 50mM phosphate buffer NA | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
1YJR Solution structure of the apo form of the sixth soluble domain A69P mutant of Menkes protein 提交 2005-01-15 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 562–633(72 aa) 片段:Sixth soluble domain
突变:A69P 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100 mM phosphate buffer;压力 ambient
NMR样品组成 0.8mM 15N labeled sample; 5mM DTT; 100mM phosphate buffer | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8mM 15N 13C labeled sample; 5mM DTT; 100mM phosphate buffer | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.0mM unlabeled sample; 5mM DTT; 100mM phosphate buffer | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
1YJT Solution structure of the Cu(I) form of the sixth soluble domain A69P mutant of Menkes protein 提交 2005-01-15 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 562–633(72 aa) 片段:Sixth soluble domain
突变:A69P CU1 COPPER (I) ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100mM phosphate buffer;压力 ambient
NMR样品组成 0.8mM 15N labeled sample; 5mM DTT; 100mM phosphate buffer | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8mM 15N 13C labeled sample; 5mM DTT; 100mM phosphate buffer | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.0mM unlabeled sample; 5mM DTT; 100mM phosphate buffer | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
1YJU Solution structure of the apo form of the sixth soluble domain of Menkes protein 提交 2005-01-15 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 562–633(72 aa) 片段:Sixth soluble domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100mM phosphate buffer;压力 ambient
NMR样品组成 0.8mM 15N labeled sample; 5mM DTT; 100mM phosphate buffer | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8mM 15N 13C labeled sample; 5mM DTT; 100mM phosphate buffer | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.0mM unlabeled sample; 5mM DTT; 100mM phosphate buffer | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
1YJV Solution structure of the Cu(I) form of the sixth soluble domain of Menkes protein 提交 2005-01-15 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 562–633(72 aa) 片段:Sixth soluble domain
未记录 CU1 COPPER (I) ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100mM phosphate buffer;压力 ambient
NMR样品组成 0.8mM 15N labeled sample; 5mM DTT; 100mM phosphate buffer | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8mM 15N 13C labeled sample; 5mM DTT; 100mM phosphate buffer | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.0mM unlabeled sample; 5mM DTT; 100mM phosphate buffer | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2AW0 FOURTH METAL-BINDING DOMAIN OF THE MENKES COPPER-TRANSPORTING ATPASE, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1997-10-08 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 375–446(72 aa) 片段:FOURTH METAL-BINDING DOMAIN
未记录 AG SILVER ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8;300 K
分辨率未提供
2G9O Solution structure of the apo form of the third metal-binding domain of ATP7A protein (Menkes Disease protein) 提交 2006-03-07 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 275–352(78 aa) 片段:sixth soluble domain, residues 275-352
突变:K46V 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100mM phosphate buffer;压力 ambient
NMR样品组成 1.5mM Apo-MNK3 unlabelled sample, 100mM phosphate buffer, pH 7.0, 1mM DTT,90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM Apo-MNK3 15N labelled sample, 100mM phosphate buffer, pH 7.0, 1mM DTT, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM Apo-MNK3 15N, 13C labelled sample, 100mM phosphate buffer, pH 7.0, 1mM DTT, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2GA7 Solution structure of the copper(I) form of the third metal-binding domain of ATP7A protein (menkes disease protein) 提交 2006-03-08 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 275–352(78 aa) 片段:Third soluble domain, residues 275-352
突变:K46V CU1 COPPER (I) ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100mM phosphate buffer;压力 ambient
NMR样品组成 1mM copper(I)MNK3 unlabelled sample, 100mM phosphate buffer, pH 7.0, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5mM copper(I)MNK3 15N labeled sample, 100mM phosphate buffer, pH 7.0, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5mM copper(I)MNK3 15N,13C labeled sample, 100mM phosphate buffer, pH 7.0, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2K1R The solution NMR structure of the complex between MNK1 and HAH1 mediated by Cu(I) 提交 2008-03-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 5–77(73 aa) 片段:HMA 1 domain: Residues 5-77
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;压力 ambient
NMR测量条件 pH 7;298 K;压力 ambient
NMR测量条件 pH 7;298 K;压力 ambient
NMR测量条件 pH 7;298 K;压力 ambient
NMR样品组成 0.6 mM MNK1, 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HAH1, 0.6 mM COPPER(I) ION, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] MNK1, 0.6 mM HAH1, 0.6 mM COPPER(I) ION, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] MNK1, 1.0 mM HAH1, 1.0 mM COPPER(I) ION, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.0 mM MNK1, 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HAH1, 1.0 mM COPPER(I) ION, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2KIJ Solution structure of the Actuator domain of the copper-transporting ATPase ATP7A 提交 2009-05-06 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 806–924(119 aa) 片段:actuator domain, UNP residues 806-924
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)phosphate, arginine, glutamate;压力 ambient
NMR样品组成 0.3 mM Actd-1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.3 mM [U-13C; U-15N] Actd-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.3 mM [U-15N] Actd-3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2KMV Solution structure of the nucleotide binding domain of the human Menkes protein in the ATP-free form 提交 2009-08-05 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1051–1231(181 aa) 片段:nucleotide binding domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)phospate 0.05;压力 ambient
NMR样品组成 1.5 mM [U-99% 15N] ATPfree N-MNK-1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8 mM [U-95% 13C; U-95% 15N] ATPfree N-MNK-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2KMX Solution structure of the nucleotide binding domain of the human Menkes protein in the ATP-bound form 提交 2009-08-05 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1051–1231(181 aa) 片段:nucleotide binding domain
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)phospate 0.05;压力 ambient
NMR样品组成 1.5 mM [U-99% 15N] ATPfree N-MNK-1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8 mM [U-95% 13C; U-95% 15N] ATPfree N-MNK-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3CJK Crystal structure of the adduct HAH1-Cd(II)-MNK1. 提交 2008-03-13 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 7–77(71 aa)
未记录 CD CADMIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.7;298 K;0.1 M sodium citrate, 20% PEG-6000, pH 4.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.283
5T7L Pt(II)-mediated copper-dependent interactions between ATOX1 and MNK1 提交 2016-09-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 7–77(71 aa) 片段:UNP residues 7-77
未记录 PT PLATINUM (II) ION × 2 CU COPPER (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;PEG-6000 10 to 30 % w/v and sodium citrate 0.1M at pH 4.7
分辨率 2.83 Å R-free 0.273
7LU8 Structure of the cryptic HMA domain of the human copper transporter ATP7A 提交 2021-02-21 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 84–156(73 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4;298 K;离子强度(mmCIF原始值)210;压力 1
NMR样品组成 0.35 mM [U-13C; U-15N] HMA2A, 50 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 5 mM TCEP, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供