当前蛋白身份：Q06121
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1A53 COMPLEX OF INDOLE-3-GLYCEROLPHOSPHATE SYNTHASE FROM SULFOLOBUS SOLFATARICUS WITH INDOLE-3-GLYCEROLPHOSPHATE AT 2.0 A RESOLUTION 提交 1998-02-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–248（247 aa）
|
未记录 | IGP INDOLE-3-GLYCEROL PHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.212 |
| 1IGS INDOLE-3-GLYCEROLPHOSPHATE SYNTHASE FROM SULFOLOBUS SOLFATARICUS AT 2.0 A RESOLUTION 提交 1995-08-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–248（248 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5；pH 5.
|
分辨率 2.00 Å |
| 1JUK INDOLE-3-GLYCEROLPHOSPHATE SYNTHASE FROM SULFOLOBUS SOLFATARICUS IN A TRIGONAL CRYSTAL FORM 提交 1996-05-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–248（248 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；pH 6.0
|
分辨率 2.50 Å |
| 1JUL INDOLE-3-GLYCEROLPHOSPHATE SYNTHASE FROM SULFOLOBUS SOLFATARICUS IN A SECOND ORTHORHOMBIC CRYSTAL FORM 提交 1996-05-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–248（248 aa）
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未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.5
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分辨率 2.00 Å |
| 1LBF CRYSTAL STRUCTURE OF INDOLE-3-GLYCEROL PHOSPHATE SYNTASE (IGPS)WITH REDUCED 1-(O-CABOXYPHENYLAMINO)-1-DEOXYRIBULOSE 5-PHOSPHATE (RCDRP) 提交 2002-04-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–248（247 aa）
|
未记录 | 137 1-(O-CARBOXY-PHENYLAMINO)-1-DEOXY-D-RIBULOSE-5-PHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；30% ammonium sulphate, 50 mM phosphate buffer, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.225 |
| 1LBL Crystal structure of indole-3-glycerol phosphate synthase (IGPS) in complex with 1-(o-carboxyphenylamino)-1-deoxyribulose 5'-phosphate (CdRP) 提交 2002-04-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–248（247 aa）
|
未记录 | 137 1-(O-CARBOXY-PHENYLAMINO)-1-DEOXY-D-RIBULOSE-5-PHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；1.2M ammonium sulphate, 50 mM potassium phosphate buffer, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.247 |
| 2C3Z Crystal structure of a truncated variant of indole-3-glycerol phosphate synthase from Sulfolobus solfataricus 提交 2005-10-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
27–248（222 aa）
片段：DELTA(1-26), RESIDUES 27-248
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
30% PEG8000 0.2 M AMMONIUM SULFATE 0.1 M MES, PH 6.5
|
分辨率 2.80 Å |
| 3NYZ Crystal Structure of Kemp Elimination Catalyst 1A53-2 提交 2010-07-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–248（248 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 bis-tris, 0.2 M ammonium acetate, 25% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.251 |
| 3NYZ Crystal Structure of Kemp Elimination Catalyst 1A53-2 提交 2010-07-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–248（248 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 bis-tris, 0.2 M ammonium acetate, 25% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.251 |
| 3NZ1 Crystal Structure of Kemp Elimination Catalyst 1A53-2 Complexed with Transition State Analog 5-Nitro Benzotriazole 提交 2010-07-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–248（248 aa）
|
突变：E51A, S81A, L83A, K110W, L131A, L157A, E159V, G178E, N180A, E210W, S211Q, L231G | 3NY 5-nitro-1H-benzotriazole × 1 SO4 SULFATE ION × 6 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；0.2 potassium sodium tartrate, 2M ammonium sulfate, 0.1 M sodium citrate/citric acid, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.210 |
| 3TC6 Crystal Structure of Engineered Protein. Northeast Structural Genomics Consortium Target OR63. 提交 2011-08-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–247（247 aa）
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未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
Microbatch crystallization under oil；pH 5；277 K；40% PEG 400, 0.1 M Sodium phosphate monobasic, 0.1 M Sodium acetate, pH 5.0, Microbatch crystallization under oil, temperature 277K
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分辨率 1.60 Å R-free 0.198 |
| 3TC7 Crystal Structure of Engineered Protein. Northeast Structural Genomics Consortium Target OR62. 提交 2011-08-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–247（247 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 3 ACY ACETIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
Microbatch crystallization under oil；pH 5；277 K；40 % PEG 400, 0.1 M Ammonium phosphate monobasic, 0.1 M Sodium acetate, pH 5.0, Microbatch crystallization under oil, temperature 277K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.193 |
| 4A2R Structure of the engineered retro-aldolase RA95.5-5 提交 2011-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–245（245 aa）
片段：TIM-BARREL FOLD, RESIDUES 1-245
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突变：YES | 3NK 1-(6-METHOXYNAPHTHALEN-2-YL)BUTANE-1,3-DIONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；301 K；0.1 M TRIS PH 8.5, 0.2 M NA2HPO4, 23% W/V PEG3350, 28 DEGREES CELSIUS.
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分辨率 1.30 Å R-free 0.165 |
| 4A2S Structure of the engineered retro-aldolase RA95.5 提交 2011-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–245（245 aa）
片段：TIM-BARREL FOLD, RESIDUES 1-245
|
突变：YES | 3NK 1-(6-METHOXYNAPHTHALEN-2-YL)BUTANE-1,3-DIONE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；301 K；0.1 M HEPES KOH PH 7.6, 23% W/V PEG 3350,20 MM NA2HPO4, 28 DEG. CELSIUS.
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分辨率 1.40 Å R-free 0.162 |
| 4IWW Computational Design of an Unnatural Amino Acid Metalloprotein with Atomic Level Accuracy 提交 2013-01-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–248（247 aa）
|
突变：K10E, F22V, S70A, K110M, I133BPA, N161T, N179T, R181Q, L183D, E209D, F246L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 6 CO COBALT (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.5；298 K；1.8 M ammonium sulfate, 5% PEG3350, pH 6.5, EVAPORATION, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.264 |
| 4IWW Computational Design of an Unnatural Amino Acid Metalloprotein with Atomic Level Accuracy 提交 2013-01-24 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–248（247 aa）
|
突变：K10E, F22V, S70A, K110M, I133BPA, N161T, N179T, R181Q, L183D, E209D, F246L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 3 CO COBALT (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.5；298 K；1.8 M ammonium sulfate, 5% PEG3350, pH 6.5, EVAPORATION, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.264 |
| 4IX0 Computational Design of an Unnatural Amino Acid Metalloprotein with Atomic Level Accuracy 提交 2013-01-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–248（247 aa）
|
突变：K10E, F22V, S70A, K110M, I133BPA, N161T, N179T, R181Q, L183D, E209D, F246L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.5；298 K；1.6 M ammonium sulfate, 3% PEG3350, pH 6.5, EVAPORATION, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.257 |
| 5AOU Structure of the engineered retro-aldolase RA95.5-8F apo 提交 2015-09-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–245（245 aa）
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突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.6；293 K；0.1M SODIUM ACETATE TRIHYDRATE, 2M AMMONIUM SULFATE, PH 4.6, 20DEGREE CELSIUS
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分辨率 1.10 Å R-free 0.219 |
| 5K7J Structure of designed zinc binding protein ZE2 bound to Zn2+ 提交 2016-05-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–248（247 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.10 M succinate
22% PEG 3350
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分辨率 1.39 Å R-free 0.230 |
| 5K7J Structure of designed zinc binding protein ZE2 bound to Zn2+ 提交 2016-05-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–248（247 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.10 M succinate
22% PEG 3350
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.230 |
| 6NW4 Evolution of a computationally designed Kemp eliminase 提交 2019-02-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–248（247 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 6NT 6-NITROBENZOTRIAZOLE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium citrate, 20 mM sodium sulfate, 43% v/v PEG 300, pH 5.6
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.295 |