当前蛋白身份：Q07381
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5IW7 Crystal structure of yeast Tsr1, a pre-40S ribosome synthesis factor 提交 2016-03-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
46–409（364 aa）
链 A
477–788（312 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；8-14% w/v PEG 3350
0.18-0.30 M sodium malonate pH 6.0
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.295 |
| 5IW7 Crystal structure of yeast Tsr1, a pre-40S ribosome synthesis factor 提交 2016-03-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
46–409（364 aa）
链 B
477–788（312 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；8-14% w/v PEG 3350
0.18-0.30 M sodium malonate pH 6.0
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.295 |
| 5IW7 Crystal structure of yeast Tsr1, a pre-40S ribosome synthesis factor 提交 2016-03-22 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
46–409（364 aa）
链 C
477–788（312 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；8-14% w/v PEG 3350
0.18-0.30 M sodium malonate pH 6.0
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.295 |
| 5IW7 Crystal structure of yeast Tsr1, a pre-40S ribosome synthesis factor 提交 2016-03-22 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
46–409（364 aa）
链 D
477–788（312 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；8-14% w/v PEG 3350
0.18-0.30 M sodium malonate pH 6.0
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.295 |
| 5WWN Crystal structure of Tsr1 提交 2017-01-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
80–788（709 aa）
片段：UNP residues 80-788
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M sodium chloride, 0.08M BIS-TRIS pH 5.5, 0.02M BIS-TRIS pH 6.5, 1.6M ammonium sulfate
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分辨率 2.81 Å R-free 0.274 |
| 6EML Cryo-EM structure of a late pre-40S ribosomal subunit from Saccharomyces cerevisiae 提交 2017-10-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric（31） 与蛋白数一致 |
链 t
1–788（788 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 6FAI Structure of a eukaryotic cytoplasmic pre-40S ribosomal subunit 提交 2017-12-15 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物一致 |
链 k
1–788（788 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 46 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 6RBD State 1 of yeast Tsr1-TAP Rps20-Deltaloop pre-40S particles 提交 2019-04-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric（35） 与全部聚合物一致 |
链 k
1–788（788 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot 1.7-1.9 seconds before plunging
|
分辨率 3.47 Å |
| 6WDR Subunit joining exposes nascent pre-40S rRNA for processing and quality control 提交 2020-04-01 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致 |
链 k
1–788（788 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6Y7C Early cytoplasmic yeast pre-40S particle (purified with Tsr1 as bait) 提交 2020-02-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric（34） 与全部聚合物一致 |
链 t
1–788（788 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7WTP Cryo-EM structure of a yeast pre-40S ribosomal subunit - State Tsr1-2 (with Rps2) 提交 2022-02-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：nonadecameric（19） 与全部聚合物一致 |
链 CC
1–788（788 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7WTQ Cryo-EM structure of a yeast pre-40S ribosomal subunit - State Tsr1-2 (without Rps2) 提交 2022-02-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：octadecameric（18） 与全部聚合物一致 |
链 CC
1–788（788 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 7WTR Cryo-EM structure of a yeast pre-40S ribosomal subunit - State Tsr1-3 提交 2022-02-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：nonadecameric（19） 与全部聚合物一致 |
链 CC
1–788（788 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8C00 Enp1TAP-S21_A population of yeast small ribosomal subunit precursors depleted of rpS21/eS21 提交 2022-12-15 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：26-meric（26） 与全部聚合物一致 |
链 t
1–788（788 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8C01 Enp1TAP_A population of yeast small ribosomal subunit precursors 提交 2022-12-15 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物一致 |
链 t
1–788（788 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |