当前蛋白身份:Q07478
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5SUP Crystal structure of the Sub2-Yra1 complex in association with RNA 提交 2016-08-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致 |
链 A
61–446(386 aa)
片段:residues 61-446
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 5.5;277 K;100 mM Bis-Tris (pH 5.5), 20% PEG3350, 0.2 M ammonium acetate
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.268 |
| 5SUP Crystal structure of the Sub2-Yra1 complex in association with RNA 提交 2016-08-03 | Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致 |
链 B
61–446(386 aa)
片段:residues 61-446
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 5.5;277 K;100 mM Bis-Tris (pH 5.5), 20% PEG3350, 0.2 M ammonium acetate
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.268 |
| 5SUP Crystal structure of the Sub2-Yra1 complex in association with RNA 提交 2016-08-03 | Assembly 3 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致 |
链 C
61–446(386 aa)
片段:residues 61-446
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 5.5;277 K;100 mM Bis-Tris (pH 5.5), 20% PEG3350, 0.2 M ammonium acetate
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.268 |
| 5SUQ Crystal structure of the THO-Sub2 complex 提交 2016-08-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 A
1–446(446 aa)
链 C
1–446(446 aa)
|
未记录 | KEG 12-TUNGSTOPHOSPHATE × 11 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 8.4;289 K;100 mM Tris-HCl (pH 8.4), 17.5% PEG3350, 2% methanol, 0.3 M NDSB-195
|
分辨率 6.00 Å R-free 0.434 |
| 7APX yeast THO-Sub2 complex 提交 2020-10-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 F
48–446(399 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 3.40 Å |
| 7LUV Cryo-EM structure of the yeast THO-Sub2 complex 提交 2021-02-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 M
1–446(446 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.70 Å |
| 7V2Y cryo-EM structure of yeast THO complex with Sub2 提交 2021-08-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 F
1–446(446 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8U8C Crystal structure of the TREX-2 complex in complex with the N-terminal motif of Sub2 提交 2023-09-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 D
1–55(55 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M MES, pH 6.5, and 20% PEG3350
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分辨率 2.40 Å R-free 0.231 |