当前蛋白身份:Q07478 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5SUP Crystal structure of the Sub2-Yra1 complex in association with RNA 提交 2016-08-03 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致
链 A 61–446(386 aa) 片段:residues 61-446
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 5.5;277 K;100 mM Bis-Tris (pH 5.5), 20% PEG3350, 0.2 M ammonium acetate
分辨率 2.60 Å R-free 0.268
5SUP Crystal structure of the Sub2-Yra1 complex in association with RNA 提交 2016-08-03 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致
链 B 61–446(386 aa) 片段:residues 61-446
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 5.5;277 K;100 mM Bis-Tris (pH 5.5), 20% PEG3350, 0.2 M ammonium acetate
分辨率 2.60 Å R-free 0.268
5SUP Crystal structure of the Sub2-Yra1 complex in association with RNA 提交 2016-08-03 Assembly 3 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致
链 C 61–446(386 aa) 片段:residues 61-446
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 5.5;277 K;100 mM Bis-Tris (pH 5.5), 20% PEG3350, 0.2 M ammonium acetate
分辨率 2.60 Å R-free 0.268
5SUQ Crystal structure of the THO-Sub2 complex 提交 2016-08-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–446(446 aa)
链 C 1–446(446 aa)
未记录 KEG 12-TUNGSTOPHOSPHATE × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 8.4;289 K;100 mM Tris-HCl (pH 8.4), 17.5% PEG3350, 2% methanol, 0.3 M NDSB-195
分辨率 6.00 Å R-free 0.434
7APX yeast THO-Sub2 complex 提交 2020-10-20 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 F 48–446(399 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7LUV Cryo-EM structure of the yeast THO-Sub2 complex 提交 2021-02-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 M 1–446(446 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7V2Y cryo-EM structure of yeast THO complex with Sub2 提交 2021-08-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 F 1–446(446 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8U8C Crystal structure of the TREX-2 complex in complex with the N-terminal motif of Sub2 提交 2023-09-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 D 1–55(55 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M MES, pH 6.5, and 20% PEG3350
分辨率 2.40 Å R-free 0.231