当前蛋白身份：Q07960
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AM4 COMPLEX BETWEEN CDC42HS.GMPPNP AND P50 RHOGAP (H. SAPIENS) 提交 1997-06-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
233–431（199 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.9；pH 5.9
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.280 |
| 1AM4 COMPLEX BETWEEN CDC42HS.GMPPNP AND P50 RHOGAP (H. SAPIENS) 提交 1997-06-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
233–431（199 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.9；pH 5.9
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.280 |
| 1AM4 COMPLEX BETWEEN CDC42HS.GMPPNP AND P50 RHOGAP (H. SAPIENS) 提交 1997-06-22 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
233–431（199 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.9；pH 5.9
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.280 |
| 1GRN CRYSTAL STRUCTURE OF THE CDC42/CDC42GAP/ALF3 COMPLEX. 提交 1998-07-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
237–439（203 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN OF CDC42GAP
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；pH 6.0
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.259 |
| 1OW3 Crystal Structure of RhoA.GDP.MgF3-in Complex with RhoGAP 提交 2003-03-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
198–439（242 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；18% PEG2KMME, 100mM MES, 10mM MgCl2, 10mM NaF, 2mM deferoxamine, 114mM (NH4)2SO4, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.219 |
| 1RGP GTPASE-ACTIVATION DOMAIN FROM RHOGAP 提交 1996-12-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
198–439（242 aa）
片段：GTPASE ACTIVATION DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；10% PEG 6K, 5% MPD IN 0.1M HEPES PH 7.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.283 |
| 1TX4 RHO/RHOGAP/GDP(DOT)ALF4 COMPLEX 提交 1997-07-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
234–431（198 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 18% PEG 2000 MME 100MM MES PH6.0 10MM MGCL2, 3MM DTT, 3MM NAN3, 114MM AMMONIUM SULFATE 400UM PROTEIN COMPLEX WITH 1MM ALCL3 AND 10MM NAF.
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.215 |
| 2NGR TRANSITION STATE COMPLEX FOR GTP HYDROLYSIS BY CDC42: COMPARISONS OF THE HIGH RESOLUTION STRUCTURES FOR CDC42 BOUND TO THE ACTIVE AND CATALYTICALLY COMPROMISED FORMS OF THE CDC42-GAP. 提交 1998-07-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
206–439（234 aa）
片段：FULL-LENGTH CDC42 IN COMPLEX WITH A C-TERMINAL ACTIVE DOMAIN OF CDC42GAP(R305A) MUTANT.
|
突变：R305A | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；pH 6.0
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.293 |
| 5M6X Crystal Structure of human RhoGAP mutated in its arginine finger (R85A) in complex with RhoA.GDP.MgF3- human 提交 2016-10-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
198–437（240 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；293 K；100 mM Bis Tris
pH 5.5-6.5
20-25% (w/v) PEG3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.272 |
| 5M6X Crystal Structure of human RhoGAP mutated in its arginine finger (R85A) in complex with RhoA.GDP.MgF3- human 提交 2016-10-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
198–437（240 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；293 K；100 mM Bis Tris
pH 5.5-6.5
20-25% (w/v) PEG3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.272 |
| 5M70 Crystal Structure of human RhoGAP mutated in its arginin finger (R85A) in complex with RhoA.GDP.AlF4- human 提交 2016-10-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
198–437（240 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；293 K；100 mM Bis/Tris pH 5.8-6
PEG3350 23-26%
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.277 |
| 5M70 Crystal Structure of human RhoGAP mutated in its arginin finger (R85A) in complex with RhoA.GDP.AlF4- human 提交 2016-10-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
198–437（240 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；293 K；100 mM Bis/Tris pH 5.8-6
PEG3350 23-26%
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.277 |
| 6R3V Crystal Structure of RhoA-GDP-Pi in Complex with RhoGAP 提交 2019-03-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–439（439 aa）
片段：GTPASE ACTIVITING DOMAIN
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；Equal amounts of reservoir solution containing 18% PEG2000
MME, 100 mM MES, pH 6.0, 10 mM MgCl2, 3 mM DTT, 3 mM NaN3,
120 mM ammonium sulphate and stock solution of the RhoA/RhoGAP protein complex at 800 mM in 20 mM Tris.HCl, pH 7.4, with 2 mM AlCl3, 10 mM MgCl2, and 20 mM NaF.
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.207 |
| 7QSC GTPase IN COMPLEX WITH GDP.MGF3- 提交 2022-01-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
198–439（242 aa）
链 C
198–439（242 aa）
|
突变：R85A 突变：R85A | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；Protein stock of RhoA-Y34F3Y 0.7 mM, RhoGAP-R85A 0.7 mM in a buffer of BisTris-HCl, pH 6.0, NaCl 150 mM, MgCl2 5 mM, NaF 10 mM, DTT 1 mM mixed 1:1.2 ratio with the
precipitant solution of 0.1 M BisTris-HCl, pH 5.8, PEG3350 26% (w/v).
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.294 |
| 7QTM Transition state analogue of small G protein in complex with relevant GAP 提交 2022-01-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
198–439（242 aa）
链 H
198–439（242 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；A 1:1 ratio of protein buffer (RhoA 0.7 mM, RhoGAP-R85A 0.7 M, BisTris-HCl pH = 6.0, NaCl 150 mM, MgCl2 5 mM, NaF 10 mM, DTT 1 mM) to precipitant (0.1 M BisTris-HCl pH = 5.8, PEG3350 25% (w/v)) was used
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.304 |