当前蛋白身份:Q08231
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3T5V Sac3:Thp1:Sem1 complex 提交 2011-07-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
1–455(455 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.2;292 K;see publication, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.231 |
| 3T5V Sac3:Thp1:Sem1 complex 提交 2011-07-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 E
1–455(455 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.2;292 K;see publication, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.231 |
| 4TRQ Crystal structure of Sac3/Thp1/Sem1 提交 2014-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:Hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 B
170–455(286 aa)
链 E
170–455(286 aa)
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;292 K;0.5M Li2SO4, 10% PEG-8.000
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分辨率 3.10 Å R-free 0.238 |
| 5G5P Structure of the Saccharomyces cerevisiae TREX-2 complex 提交 2016-05-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 B
1–455(455 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 MM HEPES, 300 MM NACL, 5 MM DTT;pH 8;20 mM HEPES, 300 mM NaCl, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
85 K;冷冻剂 ETHANE;LIQUID ETHANE
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分辨率 5.30 Å |
| 5L3T Structure of the Saccharomyces cerevisiae TREX-2 complex 提交 2016-05-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 B
1–455(455 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Precipitant: 20% PEG 3350, 0.2 M Mg formate; protein 16.5 mg/ml in 0.3 M NaCl, 50 mM HEPES, pH 8, 5 mM DTT.
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分辨率 4.93 Å R-free 0.370 |
| 5UBP TREX2 M-region 提交 2016-12-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
1–455(455 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;20 % PEG3350, 0.17 M MgFormate
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分辨率 2.30 Å R-free 0.217 |
| 8U8C Crystal structure of the TREX-2 complex in complex with the N-terminal motif of Sub2 提交 2023-09-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 B
1–455(455 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M MES, pH 6.5, and 20% PEG3350
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分辨率 2.40 Å R-free 0.231 |