当前蛋白身份：Q08465
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2JMI NMR solution structure of PHD finger fragment of Yeast Yng1 protein in free state 提交 2006-11-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
141–219（79 aa）
片段：PHD finger
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.5；20 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient
NMR样品组成
0.54 mM [U-13C, U-15N] YNG1_PHD, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6 mM [U-15N] YNG1_PHD, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.54 mM [U-13C, U-15N] YNG1_PHD, 100% D2O | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 2JMJ NMR solution structure of the PHD domain from the yeast YNG1 protein in complex with H3(1-9)K4me3 peptide 提交 2006-11-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
141–219（79 aa）
片段：PHD finger
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.5；20 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient
NMR样品组成
0.52 mM [U-15N] YNG1_PHD, 2.5 mM H3(1-9)K4me3, 2 mM DTT, 50 mM potassium chloride, 20 mM sodium phosphate, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.48 mM [U-13C; U-15N] YNG1_PHD, 2.5 mM H3(1-9)K4me3, 2 mM DTT, 50 mM potassium chloride, 20 mM sodium phosphate, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 8U77 Crystal structure of Taf14 in complex with Yng1 提交 2023-09-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
113–124（12 aa）
片段：UNP residues 113-124
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；40% PEG 400, 0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M LiSO4
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.221 |
| 8U77 Crystal structure of Taf14 in complex with Yng1 提交 2023-09-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
113–124（12 aa）
片段：UNP residues 113-124
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；40% PEG 400, 0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M LiSO4
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.221 |
| 8U77 Crystal structure of Taf14 in complex with Yng1 提交 2023-09-14 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
113–124（12 aa）
片段：UNP residues 113-124
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；40% PEG 400, 0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M LiSO4
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.221 |
| 8U77 Crystal structure of Taf14 in complex with Yng1 提交 2023-09-14 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
113–124（12 aa）
片段：UNP residues 113-124
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；40% PEG 400, 0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M LiSO4
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.221 |
| 9UUO The NuA3 histone acetyltransferase complex 提交 2025-05-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
1–219（219 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.68 Å |
| 9UUS The NuA3 histone acetyltransferase complex bound to acetyl-CoA and H3 tail 提交 2025-05-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
1–219（219 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 5 ACO ACETYL COENZYME *A × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.20 Å |
| 9VKW Cryo-EM structure of the NuA3 complex bound to Ace-coenzyme A 提交 2025-06-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
1–219（219 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ACO ACETYL COENZYME *A × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.13 Å |