当前蛋白身份:Q12692 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2JSS NMR structure of chaperone Chz1 complexed with histone H2A.Z-H2B 提交 2007-07-11 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 23–119(97 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6;308 K;离子强度(mmCIF原始值)200 mM KCl;压力 ambient
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-35%2H]/[U-100% 2H] H2A.Z-H2B/Chz1 | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 13C;U-35%2H]/[U-100% 2H] Chz1/H2A.Z-H2B, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100%15N;U-100% 2H] Chz1/H2a.Z-H2B, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N;U-100%2H] H2A.Z-H2B/Chz1, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-10% 13C; U-100% 15N]/[U-100% 2H] Chz1/H2A.Z-H2B, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 15N;U-100%2H]/[U-30%2H] H2A.Z-H2B/Chz1, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 13C;U-30%2H]/[U-100% 2H] H2A.Z-H2B/Chz1, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-13C; U-15N; U-2H]/[U-100% 2H] H2A.Z-H2B/Chz1, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 15N;U-30%2H]/[U-100% 2H] H2A.Z-H2B/Chz1, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 13C;U-35%2H]/[U-100% 2H] H2A.Z-H2B/Chz1, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 15N;U-100%2H]/[U-30%2H] H2A.Z-H2B/Chz1, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 13C;U-35%2H]/[U-100% 2H] Chz1/H2A.Z-H2B, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 15N;U-30%2H]/[U-100% 2H] Chz1/H2A.Z-H2B, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
分辨率未提供
4M6B Crystal structure of yeast Swr1-Z domain in complex with H2A.Z-H2B dimer 提交 2013-08-09 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 23–119(97 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;10% (w/v) PEG 2000 MME, 100 mM HEPES, pH 7.5, 50 mM Calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.78 Å R-free 0.220
4M6B Crystal structure of yeast Swr1-Z domain in complex with H2A.Z-H2B dimer 提交 2013-08-09 Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 23–119(97 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;10% (w/v) PEG 2000 MME, 100 mM HEPES, pH 7.5, 50 mM Calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.78 Å R-free 0.220
6AE8 Structure insight into histone chaperone Chz1-mediated H2A.Z recognition and replacement 提交 2018-08-03 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 23–119(97 aa) 片段:UNP residues 37-131, UNP residues 23-119
未记录 BCN BICINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;Bicine,1,4-Dioxane,PEG 20000
分辨率 1.65 Å R-free 0.216
6AE8 Structure insight into histone chaperone Chz1-mediated H2A.Z recognition and replacement 提交 2018-08-03 Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 23–119(97 aa) 片段:UNP residues 37-131, UNP residues 23-119
未记录 BCN BICINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;Bicine,1,4-Dioxane,PEG 20000
分辨率 1.65 Å R-free 0.216
8QZ0 SWR1-hexasome-dimer complex 提交 2023-10-26 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:22-meric(22) 与全部聚合物一致
链 L 1–134(134 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å