当前蛋白身份:Q13111 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7Y5K Crystal structure of human CAF-1 core complex in spacegroup C2221 提交 2022-06-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 442–714(273 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;7% Tacsimate, pH 6.0, 18% (w/v) PEG 3350, 0.12 M lithium citrate and 0.13 M sodium tartrate
分辨率 3.48 Å R-free 0.257
7Y5L Crystal structure of human CAF-1 core complex in spacegroup C2 提交 2022-06-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 442–714(273 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;7% Tacsimate, pH 6.0, 18% (w/v) PEG 3350, 0.12 M lithium citrate and 0.13 M sodium tartrate
分辨率 3.42 Å R-free 0.237
7Y5L Crystal structure of human CAF-1 core complex in spacegroup C2 提交 2022-06-17 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 D 442–714(273 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;7% Tacsimate, pH 6.0, 18% (w/v) PEG 3350, 0.12 M lithium citrate and 0.13 M sodium tartrate
分辨率 3.42 Å R-free 0.237
7Y5O Crystal structure of human CAF-1 core complex in spacegroup P21 提交 2022-06-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 442–714(273 aa)
链 D 442–714(273 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;7% Tacsimate, pH 6.0, 18% (w/v) PEG 3350, 0.12 M lithium citrate and 0.13 M sodium tartrate
分辨率 3.57 Å R-free 0.232
7Y5U Cryo-EM structure of the monomeric human CAF1LC-H3-H4 complex 提交 2022-06-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 442–853(412 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7Y5V Cryo-EM structure of the dimeric human CAF1LC-H3-H4 complex 提交 2022-06-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 442–853(412 aa)
链 F 442–853(412 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
7Y60 Cryo-EM structure of human CAF1LC bound right-handed Di-tetrasome 提交 2022-06-18 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致
链 K 442–853(412 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7Y61 Cryo-EM structure of the two CAF1LCs bound right-handed Di-tetrasome 提交 2022-06-18 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:tetradecameric(14) 与全部聚合物一致
链 K 442–853(412 aa)
链 M 442–853(412 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.60 Å
8IQF Cryo-EM structure of the dimeric human CAF1-H3-H4 complex 提交 2023-03-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–956(956 aa)
链 F 1–956(956 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8IQG Cryo-EM structure of the monomeric human CAF1-H3-H4 complex 提交 2023-03-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 1–956(956 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8J6S Cryo-EM structure of the single CAF-1 bound right-handed Di-tetrasome 提交 2023-04-26 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致
链 K 1–956(956 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8J6T Cryo-EM structure of the double CAF-1 bound right-handed Di-tetrasome 提交 2023-04-26 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:tetradecameric(14) 与全部聚合物一致
链 K 1–956(956 aa)
链 M 1–956(956 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å