当前蛋白身份:Q13112
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7Y5K Crystal structure of human CAF-1 core complex in spacegroup C2221 提交 2022-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
1–419(419 aa)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;7% Tacsimate, pH 6.0, 18% (w/v) PEG 3350, 0.12 M lithium citrate and 0.13 M sodium tartrate
|
分辨率 3.48 Å R-free 0.257 |
| 7Y5L Crystal structure of human CAF-1 core complex in spacegroup C2 提交 2022-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
1–419(419 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;7% Tacsimate, pH 6.0, 18% (w/v) PEG 3350, 0.12 M lithium citrate and 0.13 M sodium tartrate
|
分辨率 3.42 Å R-free 0.237 |
| 7Y5L Crystal structure of human CAF-1 core complex in spacegroup C2 提交 2022-06-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 E
1–419(419 aa)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;7% Tacsimate, pH 6.0, 18% (w/v) PEG 3350, 0.12 M lithium citrate and 0.13 M sodium tartrate
|
分辨率 3.42 Å R-free 0.237 |
| 7Y5O Crystal structure of human CAF-1 core complex in spacegroup P21 提交 2022-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 B
1–419(419 aa)
链 E
1–419(419 aa)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;7% Tacsimate, pH 6.0, 18% (w/v) PEG 3350, 0.12 M lithium citrate and 0.13 M sodium tartrate
|
分辨率 3.57 Å R-free 0.232 |
| 7Y5U Cryo-EM structure of the monomeric human CAF1LC-H3-H4 complex 提交 2022-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 B
1–419(419 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7Y5V Cryo-EM structure of the dimeric human CAF1LC-H3-H4 complex 提交 2022-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致 |
链 B
1–419(419 aa)
链 G
1–419(419 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.10 Å |
| 7Y60 Cryo-EM structure of human CAF1LC bound right-handed Di-tetrasome 提交 2022-06-18 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致 |
链 L
1–419(419 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7Y61 Cryo-EM structure of the two CAF1LCs bound right-handed Di-tetrasome 提交 2022-06-18 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:tetradecameric(14) 与全部聚合物一致 |
链 L
1–419(419 aa)
链 N
1–419(419 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.60 Å |
| 8IQF Cryo-EM structure of the dimeric human CAF1-H3-H4 complex 提交 2023-03-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致 |
链 B
1–559(559 aa)
链 G
1–559(559 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |
| 8IQG Cryo-EM structure of the monomeric human CAF1-H3-H4 complex 提交 2023-03-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 B
1–559(559 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8J6S Cryo-EM structure of the single CAF-1 bound right-handed Di-tetrasome 提交 2023-04-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致 |
链 L
1–559(559 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8J6T Cryo-EM structure of the double CAF-1 bound right-handed Di-tetrasome 提交 2023-04-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:tetradecameric(14) 与全部聚合物一致 |
链 L
1–559(559 aa)
链 N
1–559(559 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.60 Å |