当前蛋白身份:Q13309 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

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PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1FQV Insights into scf ubiquitin ligases from the structure of the skp1-skp2 complex 提交 2000-09-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 89–424(336 aa) 片段:101-436
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;PEG 4000, Tris-Cl, ammonium acetate, DTT, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.314
1FQV Insights into scf ubiquitin ligases from the structure of the skp1-skp2 complex 提交 2000-09-06 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 89–424(336 aa) 片段:101-436
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;PEG 4000, Tris-Cl, ammonium acetate, DTT, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.314
1FQV Insights into scf ubiquitin ligases from the structure of the skp1-skp2 complex 提交 2000-09-06 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 89–424(336 aa) 片段:101-436
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;PEG 4000, Tris-Cl, ammonium acetate, DTT, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.314
1FQV Insights into scf ubiquitin ligases from the structure of the skp1-skp2 complex 提交 2000-09-06 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 G 89–424(336 aa) 片段:101-436
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;PEG 4000, Tris-Cl, ammonium acetate, DTT, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.314
1FQV Insights into scf ubiquitin ligases from the structure of the skp1-skp2 complex 提交 2000-09-06 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 I 89–424(336 aa) 片段:101-436
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;PEG 4000, Tris-Cl, ammonium acetate, DTT, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.314
1FQV Insights into scf ubiquitin ligases from the structure of the skp1-skp2 complex 提交 2000-09-06 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 K 89–424(336 aa) 片段:101-436
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;PEG 4000, Tris-Cl, ammonium acetate, DTT, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.314
1FQV Insights into scf ubiquitin ligases from the structure of the skp1-skp2 complex 提交 2000-09-06 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 M 89–424(336 aa) 片段:101-436
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;PEG 4000, Tris-Cl, ammonium acetate, DTT, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.314
1FQV Insights into scf ubiquitin ligases from the structure of the skp1-skp2 complex 提交 2000-09-06 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 O 89–424(336 aa) 片段:101-436
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;PEG 4000, Tris-Cl, ammonium acetate, DTT, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.314
1FS1 INSIGHTS INTO SCF UBIQUITIN LIGASES FROM THE STRUCTURE OF THE SKP1-SKP2 COMPLEX 提交 2000-09-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 101–153(53 aa) 片段:RESIDUES 101-153
链 C 101–153(53 aa) 片段:RESIDUES 101-153
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;277 K;PEG 1500, sodium acetate, ammonium acetate, DTT, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.274
1FS2 INSIGHTS INTO SCF UBIQUITIN LIGASES FROM THE STRUCTURE OF THE SKP1-SKP2 COMPLEX 提交 2000-09-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 89–398(310 aa) 片段:RESIDUES 101-153; 193-410 (F-BOX + 8 LRRS)
链 C 89–398(310 aa) 片段:RESIDUES 101-153; 193-410 (F-BOX + 8 LRRS)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.90 Å R-free 0.287
1LDK Structure of the Cul1-Rbx1-Skp1-F boxSkp2 SCF Ubiquitin Ligase Complex 提交 2002-04-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 E 97–137(41 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;peg4k, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.10 Å R-free 0.331
1LDK Structure of the Cul1-Rbx1-Skp1-F boxSkp2 SCF Ubiquitin Ligase Complex 提交 2002-04-08 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 E 97–137(41 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;peg4k, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.10 Å R-free 0.331
2ASS Crystal structure of the Skp1-Skp2-Cks1 complex 提交 2005-08-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 89–424(336 aa)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 3 BEN BENZAMIDINE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;277 K;BTP, sodium/potassium phosphate, benzamidine, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.242
2ASS Crystal structure of the Skp1-Skp2-Cks1 complex 提交 2005-08-24 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 B 89–424(336 aa)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 6 BEN BENZAMIDINE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;277 K;BTP, sodium/potassium phosphate, benzamidine, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.242
2ASS Crystal structure of the Skp1-Skp2-Cks1 complex 提交 2005-08-24 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 B 89–424(336 aa)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 6 BEN BENZAMIDINE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;277 K;BTP, sodium/potassium phosphate, benzamidine, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.242
2AST Crystal structure of Skp1-Skp2-Cks1 in complex with a p27 peptide 提交 2005-08-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 89–424(336 aa)
未记录 BEN BENZAMIDINE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;PEG8K, 5% benzamidine, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.221
2AST Crystal structure of Skp1-Skp2-Cks1 in complex with a p27 peptide 提交 2005-08-24 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 89–424(336 aa)
未记录 BEN BENZAMIDINE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;PEG8K, 5% benzamidine, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.221
2AST Crystal structure of Skp1-Skp2-Cks1 in complex with a p27 peptide 提交 2005-08-24 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 89–424(336 aa)
未记录 BEN BENZAMIDINE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;PEG8K, 5% benzamidine, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.221
7B5L Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: NEDD8-CUL1-RBX1-SKP1-SKP2-CKSHS1-Cyclin A-CDK2-p27-UBE2L3~Ub~ARIH1. Transition State 1 提交 2020-12-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 T 1–424(424 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 9 SY8 5-azanylpentan-2-one × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7B5M Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: CUL1-RBX1-SKP1-SKP2-CKSHS1-p27~Ub~ARIH1. Transition State 2 提交 2020-12-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 T 1–424(424 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.91 Å
7B5R Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: CUL1-RBX1-SKP1-SKP2-CKSHS1-Cyclin A-CDK2-p27 提交 2020-12-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 T 1–424(424 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7LUO N-terminus of Skp2 bound to Cyclin A 提交 2021-02-22 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 17–83(67 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.2;293 K;1.7 M Sodium-potassium phosphate
分辨率 3.17 Å R-free 0.277
7LUO N-terminus of Skp2 bound to Cyclin A 提交 2021-02-22 Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 C 17–83(67 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.2;293 K;1.7 M Sodium-potassium phosphate
分辨率 3.17 Å R-free 0.277
7Z8T CAND1-SCF-SKP2 CAND1 engaged SCF rocked 提交 2022-03-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 F 1–424(424 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7Z8V CAND1-SCF-SKP2 (SKP1deldel) CAND1 engaged SCF rocked 提交 2022-03-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 F 1–424(424 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7ZBW CAND1-SCF-SKP2 CAND1 rolling-2 SCF engaged 提交 2022-03-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 F 1–424(424 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7ZBZ CAND1 delhairpin-SCF-SKP2 CAND1 partly engaged SCF partly rocked 提交 2022-03-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 F 1–424(424 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BYA Cryo-EM structure of SKP1-SKP2-CKS1-CDK2-CyclinA-p27KIP1 Complex 提交 2022-12-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 E 1–424(424 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
8BYL Cryo-EM structure of SKP1-SKP2-CKS1 from the SCFSKP2 E3 ligase complex 提交 2022-12-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 1–424(424 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8CDJ CAND1 b-hairpin++-SCF-SKP2 CAND1 rolling SCF engaged 提交 2023-01-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 F 1–424(424 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8CDK CAND1 b-hairpin++-SCF-SKP2 CAND1 partly engaged SCF partly rocked 提交 2023-01-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 F 1–424(424 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.32 Å
8OR0 CAND1-CUL1-RBX1-SKP1-SKP2-CKS1-CDK2 提交 2023-04-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 E 1–424(424 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8OR3 CAND1-CUL1-RBX1-SKP1-SKP2-DCNL1 提交 2023-04-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 E 1–424(424 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8OR4 Partially dissociated CAND1-CUL1-RBX1-SKP1-SKP2-CKS1-CDK2 提交 2023-04-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 E 1–424(424 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9QO0 Pre-activated 9-subunit COP9 signalosome and neddylated SCF (Skp1-Skp2-Cks1) complex structure 提交 2025-03-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:15-meric(15) 与蛋白数一致
链 M 1–424(424 aa)
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;15 mM Hepes pH 7.5, 120 mM NaCl, 0.5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.26 Å
9QO2 Dissociation-state-1 of 9-subunit CSN and SCF (SKP1-SKP2-CKS1) complex 提交 2025-03-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:14-meric(14) 与蛋白数一致
链 M 1–424(424 aa)
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;15 mM Hepes pH 7.5, 120 mM NaCl, 0.5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9QO3 Dissociation-state-2 of 9-subunit CSN and SCF (SKP1-SKP2-CKS1) complex 提交 2025-03-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:13-meric(13) 与蛋白数一致
链 M 1–424(424 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;15 mM Hepes pH 7.5, 120 mM NaCl, 0.5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
9QO4 Dissociation-state-3 of 9-subunit CSN and SCF (SKP1-SKP2-CKS1) complex 提交 2025-03-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:14-meric(14) 与蛋白数一致
链 M 1–424(424 aa)
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;15 mM Hepes pH 7.5, 120 mM NaCl, 0.5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.95 Å
9QO5 Dissociation-state-4 of 9-subunit CSN and SCF (SKP1-SKP2-CKS1) complex 提交 2025-03-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:14-meric(14) 与蛋白数一致
链 M 1–424(424 aa)
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;15 mM Hepes pH 7.5, 120 mM NaCl, 0.5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å