当前蛋白身份：Q13480
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4QSY SHP2 SH2 domain in complex with GAB1 peptide 提交 2014-07-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
621–633（13 aa）
片段：phospho peptide, UNP residues 621-633
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；25% PEG3000, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
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分辨率 2.10 Å R-free 0.229 |
| 9EHD Crystal structure of N-SH2 domain of SHP2 bound to GAB1 tyrosine phosphorylated peptide (624-633) QVEpYLDLDLD 提交 2024-11-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
624–633（10 aa）
片段：residues 624-633 (Uniprot Isoform 1 numbering)
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；500 nL of 10 mg/mL SHP2 N-SH2 in 50 mM Bis-Tris pH 6.5, 50 mM NaCl, 1 mM TCEP, with GAB1 (QVEpYLDLDLD) 1:1.05 molar ratio;
500 nL of 6% v/v Tacsimate pH 6.0,
0.1 M MES monohydrate pH 6.0, and 25% w/v polyethylene glycol 4,000
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分辨率 1.59 Å R-free 0.240 |
| 9EIK Crystal structure of N-SH2 domain of SHP2 with T42A mutation bound to GAB1 tyrosine phosphorylated peptide (624-633) QVEpYLDLDLD 提交 2024-11-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
624–633（10 aa）
片段：residues 624-633 (Uniprot Isoform 1 numbering)
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；500 nL 10 mg/mL SHP2 N-SH2 with GAB1 peptide QVEpYLDLDLD (1:1.05 molar ratio) with 500 nL 0.2 M potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, and 2.0 M Ammonium sulfate
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分辨率 1.25 Å R-free 0.225 |
| 9QA5 Structure of the N-SH2 domain of SHP2 in complex with the phosphoY627-Gab1 (613-651) peptide 提交 2025-02-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
613–651（39 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；5 % PEG3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M BisTris, pH 5.5
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分辨率 2.08 Å R-free 0.273 |
| 9QCD Micro-ED structure of the NSH2-CSH2 tandem domain of SHP2 in complex with the bis-phosphorylated pY627-pY659-Gab1 (613-694) peptide 提交 2025-03-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
617–683（67 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY |
cryo-EM缓冲液
pH 8.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.20 Å R-free 0.353 |