当前蛋白身份:Q13509 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
22AJ GDP human alpha1A/beta3 S239C microtubule 提交 2026-01-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–450(450 aa)
突变:S239C MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.48 Å
22AK GDP human alpha1A/beta3 microtubule 提交 2026-01-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–450(450 aa)
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.41 Å
5IJ0 Cryo EM density of microtubule assembled from human TUBB3 提交 2016-03-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–426(426 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
5IJ9 Cryo EM density of microtubule assembled from human TUBB3-D417H mutant 提交 2016-03-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–426(426 aa)
突变:D417H GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
5JCO Structure and dynamics of single-isoform recombinant neuronal human tubulin 提交 2016-04-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 C 1–426(426 aa)
链 D 1–426(426 aa)
链 I 1–426(426 aa)
链 J 1–426(426 aa)
链 K 1–426(426 aa)
链 L 1–426(426 aa)
未记录 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 6 MG MAGNESIUM ION × 12 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
6E7B 13-pf 3-start GMPCPP-human alpha1B/beta3 microtubules 提交 2018-07-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–426(426 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6S8L Structure, Thermodynamics, and Kinetics of Plinabulin Binding to two Tubulin Isotypes 提交 2019-07-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 1–450(450 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 PN6 (3Z,6Z)-3-benzylidene-6-[(5-tert-butyl-1H-imidazol-4-yl)methylidene]piperazine-2,5-dione × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;100 mM Bis-TrisMethane, pH 5.5, supplemented with 200 mM ammonium sulfate and 25% PEG3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.266
6WSL Cryo-EM structure of VASH1-SVBP bound to microtubules 提交 2020-05-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 1–450(450 aa)
链 F 1–450(450 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7LXB HeLa-tubulin in complex with cryptophycin 52 提交 2021-03-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致
链 B 1–450(450 aa)
链 D 1–450(450 aa)
链 F 1–450(450 aa)
链 H 1–450(450 aa)
链 J 1–450(450 aa)
链 L 1–450(450 aa)
链 N 1–450(450 aa)
链 P 1–450(450 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 YGY Cryptophycin 52 × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.26 Å
7M18 HeLa-tubulin in complex with cryptophycin 1 提交 2021-03-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致
链 B 1–450(450 aa)
链 D 1–450(450 aa)
链 F 1–450(450 aa)
链 H 1–450(450 aa)
链 J 1–450(450 aa)
链 L 1–450(450 aa)
链 N 1–450(450 aa)
链 P 1–450(450 aa)
未记录 YNP Cryptophycin 1 × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
7M20 18-mer HeLa-tubulin rings in complex with Cryptophycin 1 提交 2021-03-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致
链 B 1–450(450 aa)
链 D 1–450(450 aa)
链 F 1–450(450 aa)
链 H 1–450(450 aa)
链 J 1–450(450 aa)
链 L 1–450(450 aa)
链 N 1–450(450 aa)
链 P 1–450(450 aa)
链 R 1–450(450 aa)
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 YNP Cryptophycin 1 × 9 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.84 Å
7PJF Inhibiting parasite proliferation using a rationally designed anti-tubulin agent 提交 2021-08-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 1–450(450 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 5.5;293 K;100 mM Bis-TrisMethane, pH 5.5, supplemented with 200 mM ammonium sulfate and 25% PEG3350
分辨率 1.86 Å R-free 0.218
7SJ7 Undecorated 13pf wildtype microtubule from recombinant human tubulin 提交 2021-10-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 B 1–450(450 aa)
链 D 1–450(450 aa)
链 F 1–450(450 aa)
链 G 1–450(450 aa)
链 H 1–450(450 aa)
链 I 1–450(450 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 5 mM MgCl2, 2 mM GTP, pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
7SJ8 13pf wildtype microtubule from recombinant human tubulin decorated with kinesin 提交 2021-10-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 B 1–450(450 aa)
链 D 1–450(450 aa)
链 F 1–450(450 aa)
链 G 1–450(450 aa)
链 H 1–450(450 aa)
链 I 1–450(450 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 5 mM MgCl2, 2 mM GTP, pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE;30 second adsorption time onto grid. blot force 15, 4 second blot time, 37 degrees, and 100 percent humidity. 0.5 second drain time.
分辨率 3.60 Å
7SJ9 13pf E254A microtubule from recombinant human tubulin decorated with EB3 提交 2021-10-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric(14) 与蛋白数一致
链 B 1–450(450 aa)
链 D 1–450(450 aa)
链 F 1–450(450 aa)
链 G 1–450(450 aa)
链 H 1–450(450 aa)
链 I 1–450(450 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 5 mM MgCl2, 2 mM GTP, pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
7SJA Undecorated 13pf E254N microtubule from recombinant human tubulin 提交 2021-10-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 B 1–450(450 aa)
链 D 1–450(450 aa)
链 F 1–450(450 aa)
链 G 1–450(450 aa)
链 H 1–450(450 aa)
链 I 1–450(450 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 5 mM MgCl2, 2 mM GTP, pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
7Z6S MATCAP bound to a human 14 protofilament microtubule 提交 2022-03-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:Hexameric(6) 与蛋白数一致
链 B 1–450(450 aa)
链 H 1–450(450 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VRJ Rigid body fitted model for gamma tubulin ring complex capped microtubule 提交 2024-01-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致
链 2 1–450(450 aa)
链 o 1–450(450 aa)
链 p 1–450(450 aa)
链 q 1–450(450 aa)
链 r 1–450(450 aa)
链 s 1–450(450 aa)
链 t 1–450(450 aa)
链 u 1–450(450 aa)
链 v 1–450(450 aa)
链 w 1–450(450 aa)
链 x 1–450(450 aa)
链 y 1–450(450 aa)
链 z 1–450(450 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
8VRK Rigid body fitted model for refined density map of gamma tubulin ring complex capped microtubule 提交 2024-01-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致
链 2 1–450(450 aa)
链 o 1–450(450 aa)
链 p 1–450(450 aa)
链 q 1–450(450 aa)
链 r 1–450(450 aa)
链 s 1–450(450 aa)
链 t 1–450(450 aa)
链 u 1–450(450 aa)
链 v 1–450(450 aa)
链 w 1–450(450 aa)
链 x 1–450(450 aa)
链 y 1–450(450 aa)
链 z 1–450(450 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.50 Å
8VT7 Structure of the gamma tubulin ring complex nucleated microtubule protofilament. 提交 2024-01-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–450(450 aa)
链 F 1–450(450 aa)
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.66 Å
9F3B Undecorated 13pf E254Q microtubule from recombinant human tubulin 提交 2024-04-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致
链 B 1–450(450 aa)
链 D 1–450(450 aa)
链 F 1–450(450 aa)
链 N 1–450(450 aa)
链 P 1–450(450 aa)
链 R 1–450(450 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9F3H Undecorated 13pf mosaic 20%E254Q - 80% E254QN microtubule from recombinant human tubulin 提交 2024-04-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致
链 B 1–450(450 aa)
链 D 1–450(450 aa)
链 F 1–450(450 aa)
链 N 1–450(450 aa)
链 P 1–450(450 aa)
链 R 1–450(450 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9F3R 13pf E254Q microtubule from recombinant human tubulin decorated with EB3 提交 2024-04-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:14-meric(14) 与蛋白数一致
链 B 1–450(450 aa)
链 D 1–450(450 aa)
链 F 1–450(450 aa)
链 N 1–450(450 aa)
链 P 1–450(450 aa)
链 R 1–450(450 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9F3S 13pf mosaic 20%E254Q - 80% E254N microtubule from recombinant human tubulin decorated with EB3 提交 2024-04-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:14-meric(14) 与蛋白数一致
链 B 1–450(450 aa)
链 D 1–450(450 aa)
链 F 1–450(450 aa)
链 N 1–450(450 aa)
链 P 1–450(450 aa)
链 R 1–450(450 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9SMX CM1-activated gTuRC in complex with nascent alpha-E254D mutant microtubules 提交 2025-09-09 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 73 PDB 声明:73-meric(73) 与蛋白数一致
链 BB 1–450(450 aa)
链 CB 1–450(450 aa)
链 DB 1–450(450 aa)
链 EB 1–450(450 aa)
链 FB 1–450(450 aa)
链 GB 1–450(450 aa)
链 HB 1–450(450 aa)
链 IB 1–450(450 aa)
链 JB 1–450(450 aa)
链 KB 1–450(450 aa)
链 LB 1–450(450 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.67 Å
9WD7 GMPCPP-stabilizsd human alpha1A/beta3 microtubule 提交 2025-08-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 b 1–450(450 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.34 Å
9WD9 GMPCPP-stabilized human alpha1A/beta3 S239C microtubule 提交 2025-08-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 b 1–450(450 aa)
突变:S239C GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.26 Å
9WDA Paclitaxel/GMPCPP-stabilized human alpha1A/beta3 microtubule 提交 2025-08-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 b 1–450(450 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.35 Å
9WDB Paclitaxel/GMPCPP-stabilized human alpha1A/beta3 S239C microtubule 提交 2025-08-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 b 1–450(450 aa)
突变:S239c GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 TA1 TAXOL × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.39 Å