当前蛋白身份:Q13813 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2FOT Crystal structure of the complex between calmodulin and alphaII-spectrin 提交 2006-01-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1172–1211(40 aa) 片段:Calmodulin binding domain
突变:L1211R CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;50mM Tris,pH 8.00, 30% PEG 8000, 0.1M ammonium-sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.45 Å R-free 0.269
3F31 Crystal Structure of the N-terminal region of AlphaII-spectrin Tetramerization Domain 提交 2008-10-30 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–147(147 aa)
链 B 1–147(147 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;PEG8000:PEG1000 (1:2), 4% 1,4-butane-diol, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.280
3F31 Crystal Structure of the N-terminal region of AlphaII-spectrin Tetramerization Domain 提交 2008-10-30 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–147(147 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;PEG8000:PEG1000 (1:2), 4% 1,4-butane-diol, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.280
3F31 Crystal Structure of the N-terminal region of AlphaII-spectrin Tetramerization Domain 提交 2008-10-30 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–147(147 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;PEG8000:PEG1000 (1:2), 4% 1,4-butane-diol, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.280
3FB2 Crystal structure of the human brain alpha spectrin repeats 15 and 16. Northeast Structural Genomics Consortium target HR5563a. 提交 2008-11-18 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1337–1544(208 aa) 片段:Repeats 15 and 16
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 microbatch crystallization under oil;pH 5;277 K;12% PEG 20000, 0.1M magnesium sulfate, 0.1M sodium acetate, pH 5.0, microbatch crystallization under oil, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.248
3FB2 Crystal structure of the human brain alpha spectrin repeats 15 and 16. Northeast Structural Genomics Consortium target HR5563a. 提交 2008-11-18 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1337–1544(208 aa) 片段:Repeats 15 and 16
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 microbatch crystallization under oil;pH 5;277 K;12% PEG 20000, 0.1M magnesium sulfate, 0.1M sodium acetate, pH 5.0, microbatch crystallization under oil, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.248
5FW9 Human Spectrin SH3 domain D48G, E7Y, K60Y 提交 2016-02-12 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 965–1025(61 aa) 片段:SH3 DOMAIN, RESIDUES 965-1025
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.55 Å R-free 0.249
5FWB Human Spectrin SH3 domain D48G, E7F, K60F 提交 2016-02-12 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 965–1022(58 aa) 片段:SH3, UNP RESIDUES 965-1025
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.50 Å R-free 0.236
5FWC Human Spectrin SH3 domain D48G, E7A, K60A 提交 2016-02-12 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 965–1022(58 aa) 片段:SH3, RESIDUES 965-1022
突变:YES EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NH4 AMMONIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.40 Å R-free 0.238
6ZEH Structure of PP1-spectrin alpha II chimera [PP1(7-304) + linker (G/S)x9 + spectrin alpha II (1025-1039)] bound to Phactr1 (516-580) 提交 2020-06-16 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1025–1039(15 aa)
突变:N-terminal Vector derived sequence GHMGS MN MANGANESE (II) ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;20% (w/v) polyethylene glycol 3350, 0.2 M NaI and 0.1 M BIS-Tris propane pH 8.5
分辨率 1.30 Å R-free 0.169
6ZEH Structure of PP1-spectrin alpha II chimera [PP1(7-304) + linker (G/S)x9 + spectrin alpha II (1025-1039)] bound to Phactr1 (516-580) 提交 2020-06-16 Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1025–1039(15 aa)
突变:N-terminal Vector derived sequence GHMGS MN MANGANESE (II) ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;20% (w/v) polyethylene glycol 3350, 0.2 M NaI and 0.1 M BIS-Tris propane pH 8.5
分辨率 1.30 Å R-free 0.169