当前蛋白身份:Q14241
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4HFX Crystal structure of a transcription elongation factor B polypeptide 3 from Homo sapiens, Northeast Structural Genomics consortium target id HR4748B. 提交 2012-10-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
597–682(86 aa)
片段:F-box domain residues 597-682
链 D
597–682(86 aa)
片段:F-box domain residues 597-682
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
Microbatch under oil method;pH 9;277 K;1.88M Na2s2o3, 0.1M TAPS PH9, Microbatch under oil method, temperature 277K
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.263 |
| 4HFX Crystal structure of a transcription elongation factor B polypeptide 3 from Homo sapiens, Northeast Structural Genomics consortium target id HR4748B. 提交 2012-10-05 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
597–682(86 aa)
片段:F-box domain residues 597-682
链 C
597–682(86 aa)
片段:F-box domain residues 597-682
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
Microbatch under oil method;pH 9;277 K;1.88M Na2s2o3, 0.1M TAPS PH9, Microbatch under oil method, temperature 277K
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.263 |
| 6ZUZ TFIIS N-terminal domain (TND) from human Elongin-A 提交 2020-07-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
26–108(83 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4;298 K;离子强度(mmCIF原始值)225;压力 1
NMR样品组成
0.5 mM [U-13C; U-15N] ELOA, 25 mM deuterated TRIS, 200 mM sodium chloride, 1 mM TCEP, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 8OEV Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, lacking ELOA latch (composite structure, structure 3) 提交 2023-03-13 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:nonadecameric(19) 与全部聚合物一致 |
链 M
1–798(798 aa)
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.86 Å |
| 8OEW Structure of the mammalian Pol II-Elongin complex, lacking the ELOA latch (composite structure, structure 2) 提交 2023-03-13 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:octadecameric(18) 与全部聚合物一致 |
链 M
1–798(798 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8OF0 Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, Structure 1 提交 2023-03-13 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:nonadecameric(19) 与全部聚合物一致 |
链 M
1–798(798 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.05 Å |