当前蛋白身份:Q14241 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4HFX Crystal structure of a transcription elongation factor B polypeptide 3 from Homo sapiens, Northeast Structural Genomics consortium target id HR4748B. 提交 2012-10-05 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 597–682(86 aa) 片段:F-box domain residues 597-682
链 D 597–682(86 aa) 片段:F-box domain residues 597-682
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch under oil method;pH 9;277 K;1.88M Na2s2o3, 0.1M TAPS PH9, Microbatch under oil method, temperature 277K
分辨率 2.54 Å R-free 0.263
4HFX Crystal structure of a transcription elongation factor B polypeptide 3 from Homo sapiens, Northeast Structural Genomics consortium target id HR4748B. 提交 2012-10-05 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 597–682(86 aa) 片段:F-box domain residues 597-682
链 C 597–682(86 aa) 片段:F-box domain residues 597-682
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch under oil method;pH 9;277 K;1.88M Na2s2o3, 0.1M TAPS PH9, Microbatch under oil method, temperature 277K
分辨率 2.54 Å R-free 0.263
6ZUZ TFIIS N-terminal domain (TND) from human Elongin-A 提交 2020-07-23 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 26–108(83 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4;298 K;离子强度(mmCIF原始值)225;压力 1
NMR样品组成 0.5 mM [U-13C; U-15N] ELOA, 25 mM deuterated TRIS, 200 mM sodium chloride, 1 mM TCEP, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
8OEV Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, lacking ELOA latch (composite structure, structure 3) 提交 2023-03-13 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:nonadecameric(19) 与全部聚合物一致
链 M 1–798(798 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8OEW Structure of the mammalian Pol II-Elongin complex, lacking the ELOA latch (composite structure, structure 2) 提交 2023-03-13 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:octadecameric(18) 与全部聚合物一致
链 M 1–798(798 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8OF0 Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, Structure 1 提交 2023-03-13 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:nonadecameric(19) 与全部聚合物一致
链 M 1–798(798 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å