当前蛋白身份：Q14596
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1WJ6 Solution structure of RSGI RUH-024, a PB1 domain in human cDNA, KIAA0049 提交 2004-05-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–88（88 aa）
片段：PB1 domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM NaCl；压力 ambient
NMR样品组成
1.15mM PB1 domain U-15N,13C; 20mM Tris-HCl buffer (pH 7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2BKF Structure of the PB1 domain of NBR1 提交 2005-02-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–85（85 aa）
片段：RESIDUES 1-85 (PB1 INTERACTION DOMAIN)
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未记录 | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.1；1.6 M AMMONIUM SULFATE,0.1 M SODIUM ACETATE PH 4.1
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分辨率 1.56 Å R-free 0.226 |
| 2CP8 Solution structure of the RSGI RUH-046, a UBA domain from human Next to BRCA1 gene 1 protein (KIAA0049 protein) R923H variant 提交 2005-05-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
916–956（41 aa）
片段：UBA
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM NaCl；压力 ambient
NMR样品组成
2.62mM RSGI RUH-046 U-13C, 15N; 20mM Tris-HCl U-2H, 100mM NaCl, 1mM DTT U-2H, 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2G4S Anomalous substructure of NBR1PB1 提交 2006-02-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–85（85 aa）
片段：PB1 domain
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未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 ACY ACETIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.15 Å R-free 0.323 |
| 2L8J GABARAPL-1 NBR1-LIR complex structure 提交 2011-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
726–738（13 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成
0.6 mM [U-98% 15N] GABARAPL-1, 0.9 mM NBR1-LIR, 50 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 4.6 mM sodium azide, 1 mM protease inhibitor cocktail, 0.3 mM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.6 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] GABARAPL-1, 0.9 mM NBR1-LIR, 50 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 4.6 mM sodium azide, 1 mM protease inhibitor cocktail, 0.3 mM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.9 mM GABARAPL-1, 0.6 mM [U-98% 15N] NBR1-LIR, 50 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 4.6 mM sodium azide, 1 mM protease inhibitor cocktail, 0.3 mM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.9 mM GABARAPL-1, 0.6 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] NBR1-LIR, 50 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 4.6 mM sodium azide, 1 mM protease inhibitor cocktail, 0.3 mM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2MGW Solution Structure of the UBA Domain of Human NBR1 提交 2013-11-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
913–959（47 aa）
片段：UNP residues 913-959
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.6；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
20 mM potassium phosphate-1, 5 mM potassium chloride-2, 1 mM EDTA-3, 1 mM benzamidine-4, 1 mM DTT-5, 0.02 % sodium azide-6, 1.2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] NBR1 residues 913-959-7, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
20 mM potassium phosphate-8, 5 mM potassium chloride-9, 1 mM EDTA-10, 1 mM benzamidine-11, 1 mM DTT-12, 0.02 % sodium azide-13, 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] NBR1 residues 913-959-14, 12.5 mg/mL Pf1 phage-15, 150 mM sodium chloride-16, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
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分辨率未提供 |
| 2MJ5 Structure of the UBA Domain of Human NBR1 in Complex with Ubiquitin 提交 2013-12-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
913–959（47 aa）
片段：UNP residues 916-959
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.6；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
20 mM potassium phosphate-1, 5 mM potassium chloride-2, 1 mM EDTA-3, 1 mM benzamidine-4, 1 mM DTT-5, 0.02 % sodium azide-6, 1.2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] NBR1 residues 913-959-7, 95 % H2O-8, 5 % D2O-9, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
20 mM potassium phosphate-10, 5 mM potassium chloride-11, 1 mM EDTA-12, 1 mM benzamidine-13, 1 mM DTT-14, 0.02 % sodium azide-15, 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] NBR1 residues 913-959-16, 12.5 mg/mL Pf1 phage-17, 150 mM sodium chloride-18, 95 % H2O-19, 5 % D2O-20, 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] NBR1_UBA-21, 2 mM Ubiquitin-22, 12.5 mg/mL Pf1 phage-23, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
20 mM potassium phosphate-24, 5 mM potassium chloride-25, 1 mM EDTA-26, 1 mM benzamidine-27, 1 mM DTT-28, 0.02 % sodium azide-29, 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] NBR1 residues 913-959-30, 12.5 mg/mL Pf1 phage-31, 150 mM sodium chloride-32, 95 % H2O-33, 5 % D2O-34, 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] NBR1_UBA-35, 2 mM Ubiquitin-36, 12.5 mg/mL Pf1 phage-37, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
2 mM NBR1_UBA-38, 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ubiquitin-39, 12.5 mg/mL Pf1 phage-40, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 15N] NBR1_UBA-41, 4.5 mM Ubiquitin-42, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 4OLE Crystal structure of a neighbor of BRCA1 gene 1 (NBR1) from Homo sapiens at 2.52 A resolution 提交 2014-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
365–485（121 aa）
片段：UNP residues 365-485
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.33；277 K；2.35M ammonium sulfate, 0.1M TRIS pH 8.33, 0.01M Adenosine-5'-triphosphate disodium salt hydrate, NANODROP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.188 |
| 4OLE Crystal structure of a neighbor of BRCA1 gene 1 (NBR1) from Homo sapiens at 2.52 A resolution 提交 2014-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
365–485（121 aa）
片段：UNP residues 365-485
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.33；277 K；2.35M ammonium sulfate, 0.1M TRIS pH 8.33, 0.01M Adenosine-5'-triphosphate disodium salt hydrate, NANODROP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.188 |
| 4OLE Crystal structure of a neighbor of BRCA1 gene 1 (NBR1) from Homo sapiens at 2.52 A resolution 提交 2014-01-23 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
365–485（121 aa）
片段：UNP residues 365-485
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.33；277 K；2.35M ammonium sulfate, 0.1M TRIS pH 8.33, 0.01M Adenosine-5'-triphosphate disodium salt hydrate, NANODROP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.188 |
| 4OLE Crystal structure of a neighbor of BRCA1 gene 1 (NBR1) from Homo sapiens at 2.52 A resolution 提交 2014-01-23 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
365–485（121 aa）
片段：UNP residues 365-485
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.33；277 K；2.35M ammonium sulfate, 0.1M TRIS pH 8.33, 0.01M Adenosine-5'-triphosphate disodium salt hydrate, NANODROP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.188 |
| 4OLE Crystal structure of a neighbor of BRCA1 gene 1 (NBR1) from Homo sapiens at 2.52 A resolution 提交 2014-01-23 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
365–485（121 aa）
片段：UNP residues 365-485
链 B
365–485（121 aa）
片段：UNP residues 365-485
链 C
365–485（121 aa）
片段：UNP residues 365-485
链 D
365–485（121 aa）
片段：UNP residues 365-485
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 28 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 36 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.33；277 K；2.35M ammonium sulfate, 0.1M TRIS pH 8.33, 0.01M Adenosine-5'-triphosphate disodium salt hydrate, NANODROP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.188 |