当前蛋白身份:Q15025 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7EAL The structure of the A20-Binding Inhibitor of NF-kB 1 in complex with di-ubiquitin 提交 2021-03-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 405–513(109 aa)
链 C 405–513(109 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;255 K;0.1M Citrate pH 5.5, 10% Iso-propanol, 20% PEG 400
分辨率 2.50 Å R-free 0.224
7EAL The structure of the A20-Binding Inhibitor of NF-kB 1 in complex with di-ubiquitin 提交 2021-03-07 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 E 405–513(109 aa)
链 F 405–513(109 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;255 K;0.1M Citrate pH 5.5, 10% Iso-propanol, 20% PEG 400
分辨率 2.50 Å R-free 0.224
7EAO The structure of the A20-binding inhibitor of NF-kB 1 in complex with tri-ubiquitin 提交 2021-03-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 415–513(99 aa)
链 C 415–513(99 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.2 M Potassium citrate tribasic, 20% PEG 3350
分辨率 2.90 Å R-free 0.283
7EB9 The structure of the A20-binding inhibitor of NF-kB 1 in complex with tetra-ubiquitin 提交 2021-03-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 415–513(99 aa)
链 C 415–513(99 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;0.1 M Sodium malonate pH 6.0, 10% PEG 3350
分辨率 3.20 Å R-free 0.264
8YFK Crystal structure of FIP200 claw/TNIP1_FIR_pS123 提交 2024-02-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 118–128(11 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289 K;0.018M magnesium chloride hexahydrate, 0.018M calcium chloride dehydrate, 0.1M imidazole, 0.1M MES, 0.1M monohydrate, 10% v/v MPD, 10% PEG 1000, 10% v/v PEG 3350, pH 6.5
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
8YFK Crystal structure of FIP200 claw/TNIP1_FIR_pS123 提交 2024-02-24 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 H 118–128(11 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289 K;0.018M magnesium chloride hexahydrate, 0.018M calcium chloride dehydrate, 0.1M imidazole, 0.1M MES, 0.1M monohydrate, 10% v/v MPD, 10% PEG 1000, 10% v/v PEG 3350, pH 6.5
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
8YFK Crystal structure of FIP200 claw/TNIP1_FIR_pS123 提交 2024-02-24 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 118–128(11 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289 K;0.018M magnesium chloride hexahydrate, 0.018M calcium chloride dehydrate, 0.1M imidazole, 0.1M MES, 0.1M monohydrate, 10% v/v MPD, 10% PEG 1000, 10% v/v PEG 3350, pH 6.5
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
8YFK Crystal structure of FIP200 claw/TNIP1_FIR_pS123 提交 2024-02-24 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 F 118–128(11 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289 K;0.018M magnesium chloride hexahydrate, 0.018M calcium chloride dehydrate, 0.1M imidazole, 0.1M MES, 0.1M monohydrate, 10% v/v MPD, 10% PEG 1000, 10% v/v PEG 3350, pH 6.5
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
8YFM Crystal structure of FIP200 claw/TNIP1_FIR_pS122 提交 2024-02-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 118–128(11 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;25% v/v PEG smear medium, 0.1M sodium cacodylate, 0.2M ammonium sulfate, pH 5.5
分辨率 1.50 Å R-free 0.209
8YFM Crystal structure of FIP200 claw/TNIP1_FIR_pS122 提交 2024-02-24 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 118–128(11 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;25% v/v PEG smear medium, 0.1M sodium cacodylate, 0.2M ammonium sulfate, pH 5.5
分辨率 1.50 Å R-free 0.209
8YFN Crystal structure of FIP200 claw in complex with TNIP1_FIR_pS123 peptide with an elongated C terminus 提交 2024-02-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 118–133(16 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2M imidazole malate, pH 5.5, 42% PEG 600
分辨率 2.30 Å R-free 0.236
8YFN Crystal structure of FIP200 claw in complex with TNIP1_FIR_pS123 peptide with an elongated C terminus 提交 2024-02-24 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 118–133(16 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2M imidazole malate, pH 5.5, 42% PEG 600
分辨率 2.30 Å R-free 0.236
9D34 FIP200 C-terminal CLAW domain (resid. 1490-1594) in complex with phosphorylated TNIP1 FIP200 interacting peptide 提交 2024-08-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 120–132(13 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;Morpheus E4 (12.5% w/v PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350, 12.5% v/v MPD, 0.03 M of each ethylene glycol, 0.1 M MES/imidazole pH 6.5)
分辨率 1.42 Å R-free 0.234