当前蛋白身份:Q15025
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7EAL The structure of the A20-Binding Inhibitor of NF-kB 1 in complex with di-ubiquitin 提交 2021-03-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
405–513(109 aa)
链 C
405–513(109 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;255 K;0.1M Citrate pH 5.5, 10% Iso-propanol, 20% PEG 400
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.224 |
| 7EAL The structure of the A20-Binding Inhibitor of NF-kB 1 in complex with di-ubiquitin 提交 2021-03-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 E
405–513(109 aa)
链 F
405–513(109 aa)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;255 K;0.1M Citrate pH 5.5, 10% Iso-propanol, 20% PEG 400
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.224 |
| 7EAO The structure of the A20-binding inhibitor of NF-kB 1 in complex with tri-ubiquitin 提交 2021-03-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
415–513(99 aa)
链 C
415–513(99 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.2 M Potassium citrate tribasic, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.283 |
| 7EB9 The structure of the A20-binding inhibitor of NF-kB 1 in complex with tetra-ubiquitin 提交 2021-03-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
415–513(99 aa)
链 C
415–513(99 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;0.1 M Sodium malonate pH 6.0, 10% PEG 3350
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.264 |
| 8YFK Crystal structure of FIP200 claw/TNIP1_FIR_pS123 提交 2024-02-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
118–128(11 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289 K;0.018M magnesium chloride hexahydrate, 0.018M calcium chloride dehydrate, 0.1M imidazole, 0.1M MES, 0.1M monohydrate, 10% v/v MPD, 10% PEG 1000, 10% v/v PEG 3350, pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.220 |
| 8YFK Crystal structure of FIP200 claw/TNIP1_FIR_pS123 提交 2024-02-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 H
118–128(11 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289 K;0.018M magnesium chloride hexahydrate, 0.018M calcium chloride dehydrate, 0.1M imidazole, 0.1M MES, 0.1M monohydrate, 10% v/v MPD, 10% PEG 1000, 10% v/v PEG 3350, pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.220 |
| 8YFK Crystal structure of FIP200 claw/TNIP1_FIR_pS123 提交 2024-02-24 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 D
118–128(11 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289 K;0.018M magnesium chloride hexahydrate, 0.018M calcium chloride dehydrate, 0.1M imidazole, 0.1M MES, 0.1M monohydrate, 10% v/v MPD, 10% PEG 1000, 10% v/v PEG 3350, pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.220 |
| 8YFK Crystal structure of FIP200 claw/TNIP1_FIR_pS123 提交 2024-02-24 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 F
118–128(11 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289 K;0.018M magnesium chloride hexahydrate, 0.018M calcium chloride dehydrate, 0.1M imidazole, 0.1M MES, 0.1M monohydrate, 10% v/v MPD, 10% PEG 1000, 10% v/v PEG 3350, pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.220 |
| 8YFM Crystal structure of FIP200 claw/TNIP1_FIR_pS122 提交 2024-02-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
118–128(11 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;25% v/v PEG smear medium, 0.1M sodium cacodylate, 0.2M ammonium sulfate, pH 5.5
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.209 |
| 8YFM Crystal structure of FIP200 claw/TNIP1_FIR_pS122 提交 2024-02-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 E
118–128(11 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;25% v/v PEG smear medium, 0.1M sodium cacodylate, 0.2M ammonium sulfate, pH 5.5
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.209 |
| 8YFN Crystal structure of FIP200 claw in complex with TNIP1_FIR_pS123 peptide with an elongated C terminus 提交 2024-02-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
118–133(16 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2M imidazole malate, pH 5.5, 42% PEG 600
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.236 |
| 8YFN Crystal structure of FIP200 claw in complex with TNIP1_FIR_pS123 peptide with an elongated C terminus 提交 2024-02-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 D
118–133(16 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2M imidazole malate, pH 5.5, 42% PEG 600
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.236 |
| 9D34 FIP200 C-terminal CLAW domain (resid. 1490-1594) in complex with phosphorylated TNIP1 FIP200 interacting peptide 提交 2024-08-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
120–132(13 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;Morpheus E4 (12.5% w/v PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350, 12.5% v/v MPD, 0.03 M of each ethylene glycol, 0.1 M MES/imidazole pH 6.5)
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分辨率 1.42 Å R-free 0.234 |