当前蛋白身份：Q15382
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1XTQ Structure of small GTPase human Rheb in complex with GDP 提交 2004-10-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–169（169 aa）
片段：GTPase domain
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；277 K；potassium dihydrogenphosphate, PEG 8000, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.257 |
| 1XTR Structure of small GTPase human Rheb in complex with GppNHp 提交 2004-10-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–169（169 aa）
片段：GTPase domain
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；277 K；potassium dihydrogenphosphate, PEG 8000, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.270 |
| 1XTS Structure of small GTPase human Rheb in complex with GTP 提交 2004-10-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–169（169 aa）
片段：GTPase domain
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；277 K；ammonium dihydrogenphosphate, pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.277 |
| 3SEA Structure of Rheb-Y35A mutant in GDP- and GMPPNP-bound forms 提交 2011-06-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–169（167 aa）
片段：G-domain
|
突变：Y35A | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris hydrochloride, 200 mM Sodium acetate trihydrate, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.214 |
| 3SEA Structure of Rheb-Y35A mutant in GDP- and GMPPNP-bound forms 提交 2011-06-10 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
3–169（167 aa）
片段：G-domain
|
突变：Y35A | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris hydrochloride, 200 mM Sodium acetate trihydrate, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.214 |
| 3SEA Structure of Rheb-Y35A mutant in GDP- and GMPPNP-bound forms 提交 2011-06-10 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3–169（167 aa）
片段：G-domain
链 B
3–169（167 aa）
片段：G-domain
|
突变：Y35A 突变：Y35A | MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris hydrochloride, 200 mM Sodium acetate trihydrate, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.214 |
| 3T5G Structure of fully modified farnesylated Rheb in complex with PDE6D 提交 2011-07-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–181（181 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FAR FARNESYL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；0.1 M Tris 8.5, and 12.5 % PEG8000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.235 |
| 5YXH Structure of Rheb-GDP 提交 2017-12-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–169（168 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；25% w/v PEG 1500
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.299 |
| 5YXH Structure of Rheb-GDP 提交 2017-12-05 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–169（168 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；25% w/v PEG 1500
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.299 |
| 5YXH Structure of Rheb-GDP 提交 2017-12-05 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
2–169（168 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；25% w/v PEG 1500
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.299 |
| 5YXH Structure of Rheb-GDP 提交 2017-12-05 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
2–169（168 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；25% w/v PEG 1500
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.299 |
| 6BCU Cryo-EM structure of the activated RHEB-mTORC1 refined to 3.4 angstrom 提交 2017-10-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 R
1–184（184 aa）
链 S
1–184（184 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6BSX CRYSTAL STRUCTURE OF RHEB IN COMPLEX WITH COMPOUND 1 AT 1.65A RESOLUTION 提交 2017-12-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–169（169 aa）
片段：RHEB VCID 10367
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 E7S (5,6-dimethyl-1H-benzimidazol-2-yl)methanol × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8.8；293 K；28% PEG4000, 0.2M SODIUM ACETATE, 0.1M TRIS-HCL, PH 8.8, SITTING DROP, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.244 |
| 6BSX CRYSTAL STRUCTURE OF RHEB IN COMPLEX WITH COMPOUND 1 AT 1.65A RESOLUTION 提交 2017-12-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–169（169 aa）
片段：RHEB VCID 10367
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 E7S (5,6-dimethyl-1H-benzimidazol-2-yl)methanol × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8.8；293 K；28% PEG4000, 0.2M SODIUM ACETATE, 0.1M TRIS-HCL, PH 8.8, SITTING DROP, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.244 |
| 6BSX CRYSTAL STRUCTURE OF RHEB IN COMPLEX WITH COMPOUND 1 AT 1.65A RESOLUTION 提交 2017-12-04 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–169（169 aa）
片段：RHEB VCID 10367
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 E7S (5,6-dimethyl-1H-benzimidazol-2-yl)methanol × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8.8；293 K；28% PEG4000, 0.2M SODIUM ACETATE, 0.1M TRIS-HCL, PH 8.8, SITTING DROP, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.244 |
| 6BSX CRYSTAL STRUCTURE OF RHEB IN COMPLEX WITH COMPOUND 1 AT 1.65A RESOLUTION 提交 2017-12-04 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–169（169 aa）
片段：RHEB VCID 10367
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 E7S (5,6-dimethyl-1H-benzimidazol-2-yl)methanol × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8.8；293 K；28% PEG4000, 0.2M SODIUM ACETATE, 0.1M TRIS-HCL, PH 8.8, SITTING DROP, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.244 |
| 6BT0 CRYSTAL STRUCTURE OF RHEB IN COMPLEX WITH COMPOUND NR1 提交 2017-12-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–169（169 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；19% PEG 1500, 0.1M Na acetate pH 5.0
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.316 |
| 6BT0 CRYSTAL STRUCTURE OF RHEB IN COMPLEX WITH COMPOUND NR1 提交 2017-12-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–169（169 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 E7V 4-bromo-6-[(3,4-dichlorophenyl)sulfanyl]-1-{[4-(dimethylcarbamoyl)phenyl]methyl}-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；19% PEG 1500, 0.1M Na acetate pH 5.0
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.316 |
| 6BT0 CRYSTAL STRUCTURE OF RHEB IN COMPLEX WITH COMPOUND NR1 提交 2017-12-04 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–169（169 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；19% PEG 1500, 0.1M Na acetate pH 5.0
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.316 |
| 6BT0 CRYSTAL STRUCTURE OF RHEB IN COMPLEX WITH COMPOUND NR1 提交 2017-12-04 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–169（169 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；19% PEG 1500, 0.1M Na acetate pH 5.0
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.316 |
| 7BTA Crystal structure of Rheb D60K mutant bound to GDP 提交 2020-03-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–169（169 aa）
片段：GTPase domain
|
突变：D60K | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8；290 K；0.2 M NaH2PO4: 16% PEG 3350
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.256 |
| 7BTA Crystal structure of Rheb D60K mutant bound to GDP 提交 2020-03-31 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–169（169 aa）
片段：GTPase domain
|
突变：D60K | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8；290 K；0.2 M NaH2PO4: 16% PEG 3350
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.256 |
| 7BTC Crystal structure of Rheb Y35N mutant bound to GDP 提交 2020-04-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–169（169 aa）
片段：GTPase domain
|
突变：Y35N | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.5；290 K；0.10% n-Octyl-beta-D-glucoside: 0.1 M Sodium citrate tribasic, pH 5.5: 22% PEG 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.233 |
| 7BTC Crystal structure of Rheb Y35N mutant bound to GDP 提交 2020-04-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–169（169 aa）
片段：GTPase domain
|
突变：Y35N | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.5；290 K；0.10% n-Octyl-beta-D-glucoside: 0.1 M Sodium citrate tribasic, pH 5.5: 22% PEG 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.233 |
| 7BTC Crystal structure of Rheb Y35N mutant bound to GDP 提交 2020-04-01 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–169（169 aa）
片段：GTPase domain
|
突变：Y35N | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.5；290 K；0.10% n-Octyl-beta-D-glucoside: 0.1 M Sodium citrate tribasic, pH 5.5: 22% PEG 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.233 |
| 7BTC Crystal structure of Rheb Y35N mutant bound to GDP 提交 2020-04-01 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–169（169 aa）
片段：GTPase domain
|
突变：Y35N | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.5；290 K；0.10% n-Octyl-beta-D-glucoside: 0.1 M Sodium citrate tribasic, pH 5.5: 22% PEG 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.233 |
| 7BTD Crystal structure of Rheb Y35N mutant bound to GppNHp 提交 2020-04-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–169（169 aa）
片段：GTPase domain
|
突变：Y35N | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 7.5；290 K；0.2 M Ammonium acetate: 0.1 M HEPES, pH 7.5: 25% PEG 3350.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.208 |
| 9ED4 A composite map of mTORC1-Rag-Ragultor-4EBP1 on membrane 提交 2024-11-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 L
1–184（184 aa）
链 N
1–184（184 aa）
|
未记录 | GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.23 Å |
| 9ED7 Active state of mTOR on membrane 提交 2024-11-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 L
1–184（184 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.16 Å |
| 9ED8 Intermediate state of mTOR on membrane 提交 2024-11-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 L
1–184（184 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.61 Å |