当前蛋白身份:Q15628 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1F2H SOLUTION STRUCTURE OF THE N-TERMINAL DOMAIN OF THE TNFR1 ASSOCIATED PROTEIN, TRADD. 提交 2000-05-24 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–169(169 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)200mM NaCl;压力 1
NMR测量条件 pH 6.6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)200mM NaCl;压力 1
NMR测量条件 pH 6.6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)200mM NaCl;压力 1
NMR样品组成 1.0 mM 15N N-TRADD | 20mM Imidazole pH 6.6 200 mMNaCL 20 mM DTT 0.05%NaN3 90%H2O 10% D2O
NMR样品组成 1.1 mM 15N/13C N-TRADD | 20mM Imidazole pH 6.6 200 mMNaCL 20 mM DTT 0.05%NaN3 90%H2O 10% D2O
NMR样品组成 0.8 mM 15N/13C N-TRADD | 20mM Imidazole pH 6.6 200 mMNaCL 220 mM DTT 0.05%NaN3 100% D2O
分辨率未提供
1F3V Crystal structure of the complex between the N-terminal domain of TRADD and the TRAF domain of TRAF2 提交 2000-06-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–179(179 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;293 K;VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.261
5XME Solution structure of C-terminal domain of TRADD 提交 2017-05-15 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 199–312(114 aa) 片段:UNP RESIDUES 199-312
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5;301 K;压力 1
NMR样品组成 0.6 mM U-99% 13C; U-99% 15N;U-98% 2H TRADD DD, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
6AC0 Crystal structure of TRADD death domain GlcNAcylated by EPEC effector NleB 提交 2018-07-24 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 195–312(118 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;1.6 M Na/KPO4, pH 6.0
分辨率 1.45 Å R-free 0.224
7CSQ Solution structure of the complex between p75NTR-DD and TRADD-DD 提交 2020-08-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 199–312(114 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5;301 K;压力 1
NMR样品组成 0.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] p75 neurotrophin receptor death domain, 2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] tumor necrosis factor receptor1-associated death domain protein, 50% H2O/50% D2O | 50% H2O/50% D2O
分辨率未提供
9VGD Helical assembly of TRADD death domain 提交 2025-06-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白数一致
链 A 199–312(114 aa)
链 B 199–312(114 aa)
链 C 199–312(114 aa)
链 E 199–312(114 aa)
链 F 199–312(114 aa)
链 H 199–312(114 aa)
链 I 199–312(114 aa)
链 J 199–312(114 aa)
链 K 199–312(114 aa)
链 M 199–312(114 aa)
链 N 199–312(114 aa)
链 Q 199–312(114 aa)
链 R 199–312(114 aa)
链 S 199–312(114 aa)
链 T 199–312(114 aa)
链 V 199–312(114 aa)
链 W 199–312(114 aa)
链 Y 199–312(114 aa)
链 Z 199–312(114 aa)
链 b 199–312(114 aa)
链 c 199–312(114 aa)
链 e 199–312(114 aa)
链 f 199–312(114 aa)
链 g 199–312(114 aa)
链 h 199–312(114 aa)
链 j 199–312(114 aa)
链 k 199–312(114 aa)
链 l 199–312(114 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9VIN Ternary complex of TNFR1-DD, TRADD-DD and RIPK1-DD 提交 2025-06-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 31 PDB 声明:31-meric(31) 与蛋白数一致
链 E 199–312(114 aa)
链 F 199–312(114 aa)
链 N 199–312(114 aa)
链 V 199–312(114 aa)
链 W 199–312(114 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;100 mM NaCl, 20 mM Tris-HCl pH7.5, 1mM EDTA, 1mM DTT.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å