当前蛋白身份：Q15637
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1K1G STRUCTURAL BASIS FOR RECOGNITION OF THE INTRON BRANCH SITE RNA BY SPLICING FACTOR 1 提交 2001-09-25 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
133–260（128 aa）
片段：Residues 133-260, KH-QUA2 region
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；295 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NaCl；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.5；278 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NaCl；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM U-15N,13C SF1 KH-QUA2/unlabeled BPS in 20 mM phosphate buffer NA pH 6.5, 50 mM NaCl, 2 mM DTT | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM U-15N,13C SF1 KH-QUA2/unlabeled BPS in 20 mM phosphate buffer NA pH 6.5, 50 mM NaCl, 2 mM DTT | 100% D2O
NMR样品组成
1 mM U-15N SF1 KH-QUA2/unlabeled BPS in 20 mM phosphate buffer NA pH 6.5, 50 mM NaCl, 2 mM DTT | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 1OPI SOLUTION STRUCTURE OF THE THIRD RNA RECOGNITION MOTIF (RRM) OF U2AF65 IN COMPLEX WITH AN N-TERMINAL SF1 PEPTIDE 提交 2003-03-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
13–25（13 aa）
片段：N-TERMINAL PEPTIDE
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.4；295 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM SALT；压力 AMBIENT
NMR样品组成
1MM 15N,13C U2AF65-RRM3 + 1MM UNLABELED SF1_10-25, 30MM PHOSPHATE BUFFER, 20MM NACL, 3MM DTT | D2O
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分辨率未提供 |
| 2M09 Structure, phosphorylation and U2AF65 binding of the Nterminal Domain of splicing factor 1 during 3 splice site Recognition 提交 2012-10-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
27–145（119 aa）
片段：UNP residues 27-145
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）70；压力 ambient
NMR样品组成
100-600 uM [U-15N] protein, 100-600 uM [U-13C; U-15N] entity, 100-600 uM [U-13C; U-15N; U-2H] entity, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2M0G Structure, phosphorylation and U2AF65 binding of the Nterminal Domain of splicing factor 1 during 3 splice site Recognition 提交 2012-10-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–145（145 aa）
片段：UNP residues 1-145
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突变：S137C | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）70；压力 ambient
NMR样品组成
100-600 uM [U-15N] protein, 100-600 uM [U-13C; U-15N] entity, 100-600 uM [U-13C; U-15N; U-2H] entity, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 4FXW Structure of phosphorylated SF1 complex with U2AF65-UHM domain 提交 2012-07-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
14–132（119 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.2 M Lithium sulfate, 20% PEG 3350 and 0.1 M Tris pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.281 |
| 4FXW Structure of phosphorylated SF1 complex with U2AF65-UHM domain 提交 2012-07-03 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
14–132（119 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.2 M Lithium sulfate, 20% PEG 3350 and 0.1 M Tris pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.281 |
| 4FXX Structure of SF1 coiled-coil domain 提交 2012-07-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
26–132（107 aa）
片段：UNP Residues 26-132
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未记录 | IMD IMIDAZOLE × 1 MLI MALONATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；1.34 M sodium malonate pH 6.0, 0.1 M imidazole maleate pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.270 |
| 4FXX Structure of SF1 coiled-coil domain 提交 2012-07-03 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
26–132（107 aa）
片段：UNP Residues 26-132
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未记录 | IMD IMIDAZOLE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；1.34 M sodium malonate pH 6.0, 0.1 M imidazole maleate pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
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分辨率 2.48 Å R-free 0.270 |
| 4FXX Structure of SF1 coiled-coil domain 提交 2012-07-03 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
26–132（107 aa）
片段：UNP Residues 26-132
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未记录 | IMD IMIDAZOLE × 2 MLI MALONATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；1.34 M sodium malonate pH 6.0, 0.1 M imidazole maleate pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.270 |
| 4FXX Structure of SF1 coiled-coil domain 提交 2012-07-03 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
26–132（107 aa）
片段：UNP Residues 26-132
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未记录 | IMD IMIDAZOLE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；1.34 M sodium malonate pH 6.0, 0.1 M imidazole maleate pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.270 |
| 4FXX Structure of SF1 coiled-coil domain 提交 2012-07-03 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
26–132（107 aa）
片段：UNP Residues 26-132
链 B
26–132（107 aa）
片段：UNP Residues 26-132
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未记录 | IMD IMIDAZOLE × 3 MLI MALONATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；1.34 M sodium malonate pH 6.0, 0.1 M imidazole maleate pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.270 |
| 4FXX Structure of SF1 coiled-coil domain 提交 2012-07-03 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
26–132（107 aa）
片段：UNP Residues 26-132
链 D
26–132（107 aa）
片段：UNP Residues 26-132
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未记录 | IMD IMIDAZOLE × 5 MLI MALONATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；1.34 M sodium malonate pH 6.0, 0.1 M imidazole maleate pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.270 |
| 7VH9 Solution structure of the chimeric peptide of the first SURP domain of Human SF3A1 and the interacting region of SF1. 提交 2021-09-21 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
295–327（33 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1
NMR样品组成
1.4 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 7VPX The cryo-EM structure of the human pre-A complex 提交 2021-10-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：35-meric（35） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–639（639 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 6 SJT spliceostatin A (form II) × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.00 Å |
| 8PXX Structure of the WW domain tandem of PRPF40A in complex with SF1 提交 2023-07-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
575–590（16 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；308 K；离子强度（mmCIF原始值）133；压力 1
NMR样品组成
590 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] PRPF40A, 590 uM SF1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
590 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] PRPF40A, 590 uM SF1, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
900 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] SF1, 900 uM PRPF40A, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
900 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] SF1, 900 uM PRPF40A, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
150 uM [U-100% 15N] PRPF40A, 150 uM SF1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
150 uM [U-100% 15N] PRPF40A, 150 uM SF1, 10 mg/mL Pf1 phage, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |