当前蛋白身份:Q15796 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1DEV CRYSTAL STRUCTURE OF SMAD2 MH2 DOMAIN BOUND TO THE SMAD-BINDING DOMAIN OF SARA 提交 1999-11-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 261–456(196 aa) 片段:SMAD2 MH2 DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;277 K;TRIS, DIOXANE, AMMONIUM SULFATE, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4K
分辨率 2.20 Å R-free 0.276
1DEV CRYSTAL STRUCTURE OF SMAD2 MH2 DOMAIN BOUND TO THE SMAD-BINDING DOMAIN OF SARA 提交 1999-11-15 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 261–456(196 aa) 片段:SMAD2 MH2 DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;277 K;TRIS, DIOXANE, AMMONIUM SULFATE, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4K
分辨率 2.20 Å R-free 0.276
1KHX Crystal structure of a phosphorylated Smad2 提交 2001-12-01 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 241–467(227 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;dioxane, potassium phosphate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.241
1U7V Crystal Structure of the phosphorylated Smad2/Smad4 heterotrimeric complex 提交 2004-08-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 270–466(197 aa) 片段:MH2 and Linker domains
链 C 270–466(197 aa) 片段:MH2 and Linker domains
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;50 mM Tris-HCl, 0-15 mM magnesium chloride, 5-15% ethanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.70 Å R-free 0.279
2LB3 Structure of the WW domain of PIN1 in complex with a human phosphorylated Smad3 derived peptide 提交 2011-03-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 217–224(8 aa) 片段:residues 176-183
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;285 K;离子强度(mmCIF原始值)0.420;压力 ambient
NMR样品组成 1 mM NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
5XOD Crystal structure of human Smad2-Ski complex 提交 2017-05-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 262–458(197 aa) 片段:UNP residues 262-458
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;293 K;0.1 M sodium acetate tri-hydrate pH 4.6 and 1.85 M sodium formate
分辨率 1.85 Å R-free 0.254
5ZOJ Crystal structure of human SMAD2-MAN1 complex 提交 2018-04-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 262–458(197 aa) 片段:UNP residues 262-458
链 B 262–458(197 aa) 片段:UNP residues 262-458
链 C 262–458(197 aa) 片段:UNP residues 262-458
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.1;277 K;0.1M acetate, 7.5% PEG4000, 10% 2-propanol
分辨率 2.79 Å R-free 0.269
6M64 Crystal structure of SMAD2 in complex with CBP 提交 2020-03-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 262–464(203 aa)
链 C 262–464(203 aa)
链 E 262–464(203 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.2;293 K;0.1 M HEPES pH 7.2, 0.2 M NaCl and 31% PEG3350
分辨率 1.45 Å R-free 0.189
6ZVQ Complex between SMAD2 MH2 domain and peptide from Ski corepressor 提交 2020-07-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 241–467(227 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 24 TAR D(-)-TARTARIC ACID × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;1.5M Ammonium Sulphate, 0.15M Sodium Potassium Tartrate, 0.08M Tri-Sodium Citrate pH 5.6, 25% v/v Glycerol
分辨率 2.03 Å R-free 0.210
7CO1 Crystal structure of SMAD2 in complex with wild-type CBP 提交 2020-08-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 262–467(206 aa)
链 C 262–467(206 aa)
链 E 262–467(206 aa)
突变:S465E, S467E 突变:S465E, S467E 突变:S465E, S467E 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.2;293 K;1 M sodium phosphate monobasic monohydrate-potassium phosphate dibasic
分辨率 3.30 Å R-free 0.283