当前蛋白身份：Q15811
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1KI1 Guanine Nucleotide Exchange Region of Intersectin in Complex with Cdc42 提交 2001-12-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1229–1581（353 aa）
片段：Dbl homology and Pleckstrin homology domains (residues 1229-1580)
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 4000, ammonium sulfate, Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.247 |
| 1KI1 Guanine Nucleotide Exchange Region of Intersectin in Complex with Cdc42 提交 2001-12-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1229–1581（353 aa）
片段：Dbl homology and Pleckstrin homology domains (residues 1229-1580)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 4000, ammonium sulfate, Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.247 |
| 2KGR Solution structure of protein ITSN1 from Homo sapiens. Northeast Structural Genomics Consortium target HR5524A 提交 2009-03-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
210–312（103 aa）
片段：residues 210-312
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.2；压力 ambient
NMR样品组成
1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein-1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0 mM [U-5% 13C; U-99% 15N] protein-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2KHN NMR solution structure of the EH 1 domain from human intersectin-1 protein. Northeast Structural Genomics Consortium target HR3646E. 提交 2009-04-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–111（111 aa）
片段：UNP residues 1-111
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）430；压力 ambient
NMR样品组成
0.87 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] HR3646E-1, 20 mM MES-2, 200 mM sodium chloride-3, 5 mM calcium chloride-4, 10 mM DTT-5, 0.02 % sodium azide-6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.81 mM [U-5% 13C; U-98% 15N] HR3646E-7, 20 mM MES-8, 200 mM sodium chloride-9, 5 mM calcium chloride-10, 10 mM DTT-11, 0.02 % sodium azide-12, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 3FIA Crystal structure of the EH 1 domain from human intersectin-1 protein. Northeast Structural Genomics Consortium target HR3646e. 提交 2008-12-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–111（111 aa）
片段：residues 1-111
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突变：M1V, I14T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
microbatch under oil；pH 8.5；277 K；1.5M ammonium sulfate, 12% glycerol, 0.1M TrisHCl, pH 8.5, microbatch under oil , temperature 277K
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分辨率 1.45 Å R-free 0.176 |
| 3QBV Structure of designed orthogonal interaction between CDC42 and nucleotide exchange domains of intersectin 提交 2011-01-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1229–1579（351 aa）
片段：DH AND PH DOMAINS (UNP Residues 1229-1571)
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突变：S1373E | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；100mm TRIS pH 7.5, 25% PEG 3350, 150mm ammonium sulfate, and 1mM DTT, temperature 295k, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.284 |
| 3QBV Structure of designed orthogonal interaction between CDC42 and nucleotide exchange domains of intersectin 提交 2011-01-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1229–1579（351 aa）
片段：DH AND PH DOMAINS (UNP Residues 1229-1571)
|
突变：S1373E | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；100mm TRIS pH 7.5, 25% PEG 3350, 150mm ammonium sulfate, and 1mM DTT, temperature 295k, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.284 |
| 4IIM Crystal structure of the Second SH3 Domain of ITSN1 bound with a synthetic peptide 提交 2012-12-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
916–970（55 aa）
链 B
916–970（55 aa）
|
未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 11 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；1.2 M NaCitrate and 0.1 M Tris, pH 8.5, vapor diffusion hanging drop, temperature 291K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.243 |
| 4IIM Crystal structure of the Second SH3 Domain of ITSN1 bound with a synthetic peptide 提交 2012-12-20 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
916–970（55 aa）
链 B
916–970（55 aa）
|
未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 11 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；1.2 M NaCitrate and 0.1 M Tris, pH 8.5, vapor diffusion hanging drop, temperature 291K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.243 |
| 5HZI Crystal structure of photoinhibitable Intersectin1 containing C450M mutant LOV2 domain 提交 2016-02-02 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1230–1308（79 aa）
链 A
1238–1509（272 aa）
|
未记录 | FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 9% (w/v) PEG 8000, 9% (v/v) ethylene glycol
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.285 |
| 5HZI Crystal structure of photoinhibitable Intersectin1 containing C450M mutant LOV2 domain 提交 2016-02-02 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1230–1308（79 aa）
链 B
1238–1509（272 aa）
|
未记录 | FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 9% (w/v) PEG 8000, 9% (v/v) ethylene glycol
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.285 |
| 5HZJ Crystal structure of photoinhibitable Intersectin1 containing wildtype LOV2 domain 提交 2016-02-02 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1230–1308（79 aa）
链 A
1309–1580（272 aa）
|
未记录 | FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 9% (w/v) PEG 8000, 9% (v/v) ethylene glycol
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.281 |
| 5HZJ Crystal structure of photoinhibitable Intersectin1 containing wildtype LOV2 domain 提交 2016-02-02 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1230–1308（79 aa）
链 B
1309–1580（272 aa）
|
未记录 | FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 9% (w/v) PEG 8000, 9% (v/v) ethylene glycol
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.281 |
| 5HZK Crystal structure of photoinhibitable Intersectin1 containing wildtype LOV2 domain in complex with Cdc42 提交 2016-02-02 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1230–1308（79 aa）
链 B
1309–1580（272 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；0.1 M MES, 20% (w/v) PEG 6000
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分辨率 3.30 Å R-free 0.257 |
| 5HZK Crystal structure of photoinhibitable Intersectin1 containing wildtype LOV2 domain in complex with Cdc42 提交 2016-02-02 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1230–1308（79 aa）
链 D
1309–1580（272 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；0.1 M MES, 20% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.257 |
| 6GBU Crystal structure of the second SH3 domain of FCHSD2 (SH3-2) in complex with the fourth SH3 domain of ITSN1 (SH3d) 提交 2018-04-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
1069–1133（65 aa）
链 D
1069–1133（65 aa）
链 F
1069–1133（65 aa）
链 H
1069–1133（65 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.5M ammonium sulfate, 10% Glycerol, Tris pH8.5
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分辨率 3.44 Å R-free 0.247 |
| 6H5T Intersectin SH3A short isoform 提交 2018-07-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
741–835（95 aa）
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未记录 | 7PG 2,5,8,11,14,17,20,23-OCTAOXAPENTACOSAN-25-OL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；25% (v/v) polyethylene glycol 550 mono-methyl ether, 100 mM MES-NaOH at pH 6.5, and 10 mM ZnSO4
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分辨率 1.69 Å R-free 0.191 |
| 6H5T Intersectin SH3A short isoform 提交 2018-07-25 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
741–835（95 aa）
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未记录 | 7PG 2,5,8,11,14,17,20,23-OCTAOXAPENTACOSAN-25-OL × 1 ZN ZINC ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；25% (v/v) polyethylene glycol 550 mono-methyl ether, 100 mM MES-NaOH at pH 6.5, and 10 mM ZnSO4
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分辨率 1.69 Å R-free 0.191 |