当前蛋白身份：Q16543
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1US7 Complex of Hsp90 and P50 提交 2003-11-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
127–378（252 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 125-378
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；CRYSTALS OF THE COMPLEX WERE GROWN FROM A MIXTURE OF N-HSP90 AND C-P50 AT A FINAL CONCENTRATION OF 0.5MM AND 0.4MM RESPECTIVELY, IN A SOLUTION CONTAINING 12% POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 16% ISOPROPANOL AND 100MM SODIUM CITRATE, PH 6.0. CRYSTAL DROPS WERE SET UP USING THE HANGING-DROP VAPOUR DIFFUSION METHOD, INITIALLY AT 4 DEGREES C FOR 48 HOURS AND THEN TRANSFERRED TO 14 DEGREES C.
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分辨率 2.30 Å R-free 0.241 |
| 2K5B Human CDC37-HSP90 docking model based on NMR 提交 2008-06-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
148–276（129 aa）
片段：residues 148-276
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 ambient
NMR样品组成
0.8mM [U-100% 15N] human HSP90, 0.8mM [U-100% 15N] human CDC37, 50mM HEPES, 100mM sodium chloride, 1mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.8mM [U-100% 15N, U-100% 2H] human HSP90, 0.8mM human CDC37, 50mM HEPES, 100mM sodium chloride, 1mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.8mM human HSP90, 0.8mM [U-100% 15N, U-100% 2H] human CDC37, 50mM HEPES, 100mM sodium chloride, 1mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2N5X C-terminal domain of Cdc37 cochaperone 提交 2015-08-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
288–378（91 aa）
片段：C-terminal domain of Cdc37, UNP residues 288-378
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 ambient
NMR样品组成
0.3-0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Cdc37, 100 mM sodium chloride, 50 mM HEPES, 7 % [U-100% 2H] D2O, 93 % H2O, 2 mM DTT, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成
0.3-0.5 mM [U-100% 15N] Cdc37, 100 mM sodium chloride, 50 mM HEPES, 7 % [U-2H] D2O, 93 % H2O, 2 mM DTT, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成
0.3-0.5 mM [U-10% 13C; U-100% 15N] Cdc37, 100 mM sodium chloride, 5 mM HEPES, 7 % [U-2H] D2O, 93 % H2O, 2 mM DTT, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
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分辨率未提供 |
| 2NCA Structural Model for the N-terminal Domain of Human Cdc37 提交 2016-03-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–126（126 aa）
片段：N-terminal Domain residues 1-120
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 15N] N-Cdc37, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM U-2H; VILMA methyl 1H/13C N-Cdc37, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] N-Cdc37, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2W0G HSP90 CO-CHAPERONE CDC37 提交 2008-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
148–276（129 aa）
片段：RESIDUES 148-276
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.88 Å R-free 0.246 |
| 5FWK Atomic cryoEM structure of Hsp90-Cdc37-Cdk4 complex 提交 2016-02-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–378（378 aa）
片段：FULL LENGTH
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20MM TRIS-HCL (PH 7.5), 150 MM NACL, 10 MM KCL, 10 MM MGCL2, 20 MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM；pH 7.5；20MM TRIS-HCL (PH 7.5), 150 MM NACL, 10 MM KCL, 10 MM MGCL2, 20 MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
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分辨率 3.90 Å |
| 5FWL Atomic cryoEM structure of Hsp90-Cdc37-Cdk4 complex 提交 2016-02-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–378（378 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20MM TRIS-HCL, 150 MM NACL, 10MM KCL, 10MM MGCL2, 20MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM；pH 7.5；20MM TRIS-HCL, 150 MM NACL, 10MM KCL, 10MM MGCL2, 20MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 9.00 Å |
| 5FWM Atomic cryoEM structure of Hsp90-Cdc37-Cdk4 complex 提交 2016-02-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–378（378 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20MM TRIS-HCL (PH 7.5), 150 MM NACL, 10 MM KCL, 10 MM MGCL2, 20 MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM；pH 7.5；20MM TRIS-HCL (PH 7.5), 150 MM NACL, 10 MM KCL, 10 MM MGCL2, 20 MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
|
分辨率 8.00 Å |
| 5FWP Atomic cryoEM structure of Hsp90-Cdc37-Cdk4 complex 提交 2016-02-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–378（378 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20mM Tris-HCl (pH 7.5), 150 mM NaCl, 10 mM KCl, 10 mM MgCl2, 20 mM Na2MoO4, 2mM DTT, 0.085mM DDM
cryo-EM玻璃化条件
Single blot from 4 to 6 seconds, at 20C；95 K；冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
|
分辨率 7.20 Å |
| 7Z37 Structure of the RAF1-HSP90-CDC37 complex (RHC-II) 提交 2022-03-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 DP1
1–378（378 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds before plunging
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分辨率 3.67 Å |
| 7Z38 Structure of the RAF1-HSP90-CDC37 complex (RHC-I) 提交 2022-03-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
1–378（378 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds before plunging
|
分辨率 3.16 Å |
| 7ZR0 CryoEM structure of HSP90-CDC37-BRAF(V600E) complex. 提交 2022-05-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–378（378 aa）
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突变：V600E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7ZR5 CryoEM structure of HSP90-CDC37-BRAF(V600E)-PP5(closed) complex 提交 2022-05-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
1–378（378 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 7ZR6 CryoEM structure of HSP90-CDC37-BRAF(V600E)-PP5(open) complex 提交 2022-05-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
1–378（378 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 8GAE Hsp90 provides platform for CRaf dephosphorylation by PP5 提交 2023-02-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
1–378（378 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | K POTASSIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3UL OF SAMPLE
10C
100% HUMIDITY
30S WAIT TIME
3S BLOT TIME
-2 BLOT FORCE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8GFT Hsp90 provides platform for CRaf dephosphorylation by PP5 提交 2023-03-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
1–378（378 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 K POTASSIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3uL OF SAMPLE, 10C, 100%
HUMIDITY, 30S WAIT TIME, 3S
BLOT TIME, -2 BLOT FORCE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8U1L Cryo-EM structure of the RAF1-HSP90-CDC37 complex in the closed state 提交 2023-09-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
1–378（378 aa）
|
突变：0 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 4.5 seconds before plunging
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分辨率 3.70 Å |
| 9KQN Hsp90-Cdc37-PINK1 complex 提交 2024-11-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–378（378 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.84 Å |