当前蛋白身份:Q24117
重新检索
差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1RHW The solution structure of the pH-induced monomer of dynein light chain LC8 from Drosophila 提交 2003-11-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 3;303 K;离子强度(mmCIF原始值)50mM NaCl;压力 ambient
NMR样品组成
0.8-1.4mM LC8 protein | 50mM citrate phosphate, pH 3.0, 50mM NaCl, 1mM sodium Azide, 10%D20, 3% glycerol
|
分辨率未提供 |
| 2P2T Crystal structure of dynein light chain LC8 bound to residues 123-138 of intermediate chain IC74 提交 2007-03-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 2 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å R-free 0.296 |
| 2PG1 Structural analysis of a cytoplasmic dynein Light Chain-Intermediate Chain complex 提交 2007-04-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 B
1–89(89 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;277 K;1.8 M - 2.2 M Ammonium Sulfate, 0 - 20 % glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.253 |
| 2PG1 Structural analysis of a cytoplasmic dynein Light Chain-Intermediate Chain complex 提交 2007-04-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 C
1–89(89 aa)
链 D
1–89(89 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;277 K;1.8 M - 2.2 M Ammonium Sulfate, 0 - 20 % glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.253 |
| 2PG1 Structural analysis of a cytoplasmic dynein Light Chain-Intermediate Chain complex 提交 2007-04-06 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 B
1–89(89 aa)
链 C
1–89(89 aa)
链 D
1–89(89 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;277 K;1.8 M - 2.2 M Ammonium Sulfate, 0 - 20 % glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.253 |
| 3BRI Crystal Structure of apo-LC8 提交 2007-12-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;Potassium tartrate 0.2M, sodium citrate 0.1M, ammonium sulfate 2.0M, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.212 |
| 3BRL Crystal Structure of LC8 S88E / Swa 提交 2007-12-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
|
突变:S88E | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;Calcium acetate 0.2M, sodium cacodylate 0.1M, 15% PEG8000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.254 |
| 3DVH LC8 Point mutant K36P 提交 2008-07-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
1–89(89 aa)
|
突变:K36P | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;50 mM CaCl2, 100 mM HEPES, 28% (w/v) PEG MME 2000, 10% glycerol, 10 mM DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.244 |
| 3DVH LC8 Point mutant K36P 提交 2008-07-18 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 B
1–89(89 aa)
|
突变:K36P 突变:K36P | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;50 mM CaCl2, 100 mM HEPES, 28% (w/v) PEG MME 2000, 10% glycerol, 10 mM DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.244 |
| 3DVP Pak1 peptide bound LC8 提交 2008-07-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 B
1–89(89 aa)
|
突变:K36P 突变:K36P | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;100 mM MES, 200 mM NaCl, 27% (w/v) PEG 4000, and 10% 0.1 M (NH4)6CoCl3, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.263 |
| 3DVT Biochemical and structural characterization of the PAK1- LC8 interaction 提交 2008-07-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 E
1–89(89 aa)
链 F
1–89(89 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;50 mM MgCl2, 100 mM MES, 32% (w/v) PEG 4000, and 20% xylitol, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.258 |
| 3DVT Biochemical and structural characterization of the PAK1- LC8 interaction 提交 2008-07-20 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
1–89(89 aa)
链 D
1–89(89 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;50 mM MgCl2, 100 mM MES, 32% (w/v) PEG 4000, and 20% xylitol, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.258 |
| 3DVT Biochemical and structural characterization of the PAK1- LC8 interaction 提交 2008-07-20 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 B
1–89(89 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;50 mM MgCl2, 100 mM MES, 32% (w/v) PEG 4000, and 20% xylitol, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.258 |
| 3E2B Crystal structure of Dynein Light chain LC8 in complex with a peptide derived from Swallow 提交 2008-08-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;0.2M sodium potassium tartrate, 0.1M sodium citrate, 2.0M ammonium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.266 |
| 3FM7 Quaternary Structure of Drosophila melanogaster IC/Tctex-1/LC8; Allosteric Interactions of Dynein Light Chains with Dynein Intermediate Chain 提交 2008-12-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 E
1–89(89 aa)
链 F
1–89(89 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
Hanging Drop;pH 6.5;277.15 K;16% PEG 8K, 100 mM sodium cacodylate, 200 mM calcium acetate, pH 6.5, Hanging Drop, temperature 277.15K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.275 |
| 3GLW Quaternary Structure of Drosophila melanogaster IC/Tctex-1/LC8; Allosteric Interactions of Dynein Light Chains with Dynein Intermediate Chain 提交 2009-03-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277.15 K;30% PEG 400, 100 mM Hepes, 200 mM magnesium chloride at pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.271 |
| 4QH7 LC8 - Ana2 (159-168) Complex 提交 2014-05-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
片段:LC8
链 B
1–89(89 aa)
片段:LC8
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;0.3M magnesium acetate, 0.1M sodium cacodylate, 26% PEG 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.207 |
| 4QH7 LC8 - Ana2 (159-168) Complex 提交 2014-05-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 E
1–89(89 aa)
片段:LC8
链 F
1–89(89 aa)
片段:LC8
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;0.3M magnesium acetate, 0.1M sodium cacodylate, 26% PEG 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.207 |
| 4QH8 LC8 - Ana2 (237-246) Complex 提交 2014-05-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
片段:LC8
链 B
1–89(89 aa)
片段:LC8
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;293.15 K;0.19M ammonium acetate, 0.1M sodium acetate, 0.1% beta-mercaptoethanol, and 27% PEG 4000, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.236 |
| 4QH8 LC8 - Ana2 (237-246) Complex 提交 2014-05-27 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 E
1–89(89 aa)
片段:LC8
链 F
1–89(89 aa)
片段:LC8
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;293.15 K;0.19M ammonium acetate, 0.1M sodium acetate, 0.1% beta-mercaptoethanol, and 27% PEG 4000, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.236 |
| 4QH8 LC8 - Ana2 (237-246) Complex 提交 2014-05-27 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 G
1–89(89 aa)
片段:LC8
链 H
1–89(89 aa)
片段:LC8
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;293.15 K;0.19M ammonium acetate, 0.1M sodium acetate, 0.1% beta-mercaptoethanol, and 27% PEG 4000, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.236 |
| 5E0L LC8 - Chica (415-424) Complex 提交 2015-09-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
3–89(87 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;0.1 M calcium acetate, 0.1 M sodium cacodylate, 15% polyethylene glycol 8000
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.202 |
| 5E0M LC8 - Chica (468-476) Complex 提交 2015-09-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Bis-Tris, 25% polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.232 |
| 7K3J Crystal structure of dLC8 in complex with Panoramix TQT+TQ peptide 提交 2020-09-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 G
1–89(89 aa)
链 I
1–89(89 aa)
链 K
1–89(89 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.2 M Li2SO4, 0.1 M Tris pH 8.5, 40% (v/v) PEG 400
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.272 |
| 7K3J Crystal structure of dLC8 in complex with Panoramix TQT+TQ peptide 提交 2020-09-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
1–89(89 aa)
链 E
1–89(89 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.2 M Li2SO4, 0.1 M Tris pH 8.5, 40% (v/v) PEG 400
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.272 |
| 7K3K Crystal structure of dLC8 in complex with Panoramix TQT peptide 提交 2020-09-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M NH4Ac, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 17% (w/v) PEG 10000
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.201 |
| 7K3L Crystal structure of dLC8 in complex with Panoramix TQ peptide 提交 2020-09-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M KSCN, 30% (w/v) PEG 2000 MME
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.209 |