当前蛋白身份:Q24117 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1RHW The solution structure of the pH-induced monomer of dynein light chain LC8 from Drosophila 提交 2003-11-14 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 3;303 K;离子强度(mmCIF原始值)50mM NaCl;压力 ambient
NMR样品组成 0.8-1.4mM LC8 protein | 50mM citrate phosphate, pH 3.0, 50mM NaCl, 1mM sodium Azide, 10%D20, 3% glycerol
分辨率未提供
2P2T Crystal structure of dynein light chain LC8 bound to residues 123-138 of intermediate chain IC74 提交 2007-03-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
未记录 ACT ACETATE ION × 2 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å R-free 0.296
2PG1 Structural analysis of a cytoplasmic dynein Light Chain-Intermediate Chain complex 提交 2007-04-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 B 1–89(89 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;277 K;1.8 M - 2.2 M Ammonium Sulfate, 0 - 20 % glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.253
2PG1 Structural analysis of a cytoplasmic dynein Light Chain-Intermediate Chain complex 提交 2007-04-06 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 C 1–89(89 aa)
链 D 1–89(89 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;277 K;1.8 M - 2.2 M Ammonium Sulfate, 0 - 20 % glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.253
2PG1 Structural analysis of a cytoplasmic dynein Light Chain-Intermediate Chain complex 提交 2007-04-06 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 B 1–89(89 aa)
链 C 1–89(89 aa)
链 D 1–89(89 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;277 K;1.8 M - 2.2 M Ammonium Sulfate, 0 - 20 % glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.253
3BRI Crystal Structure of apo-LC8 提交 2007-12-21 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
未记录 ACT ACETATE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;Potassium tartrate 0.2M, sodium citrate 0.1M, ammonium sulfate 2.0M, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.70 Å R-free 0.212
3BRL Crystal Structure of LC8 S88E / Swa 提交 2007-12-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
突变:S88E 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;Calcium acetate 0.2M, sodium cacodylate 0.1M, 15% PEG8000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.90 Å R-free 0.254
3DVH LC8 Point mutant K36P 提交 2008-07-18 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–89(89 aa)
突变:K36P 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;50 mM CaCl2, 100 mM HEPES, 28% (w/v) PEG MME 2000, 10% glycerol, 10 mM DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.244
3DVH LC8 Point mutant K36P 提交 2008-07-18 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 B 1–89(89 aa)
突变:K36P 突变:K36P 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;50 mM CaCl2, 100 mM HEPES, 28% (w/v) PEG MME 2000, 10% glycerol, 10 mM DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.244
3DVP Pak1 peptide bound LC8 提交 2008-07-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 B 1–89(89 aa)
突变:K36P 突变:K36P 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;100 mM MES, 200 mM NaCl, 27% (w/v) PEG 4000, and 10% 0.1 M (NH4)6CoCl3, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.263
3DVT Biochemical and structural characterization of the PAK1- LC8 interaction 提交 2008-07-20 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 1–89(89 aa)
链 F 1–89(89 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;50 mM MgCl2, 100 mM MES, 32% (w/v) PEG 4000, and 20% xylitol, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.258
3DVT Biochemical and structural characterization of the PAK1- LC8 interaction 提交 2008-07-20 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–89(89 aa)
链 D 1–89(89 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;50 mM MgCl2, 100 mM MES, 32% (w/v) PEG 4000, and 20% xylitol, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.258
3DVT Biochemical and structural characterization of the PAK1- LC8 interaction 提交 2008-07-20 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 B 1–89(89 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;50 mM MgCl2, 100 mM MES, 32% (w/v) PEG 4000, and 20% xylitol, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.258
3E2B Crystal structure of Dynein Light chain LC8 in complex with a peptide derived from Swallow 提交 2008-08-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
未记录 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;0.2M sodium potassium tartrate, 0.1M sodium citrate, 2.0M ammonium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.266
3FM7 Quaternary Structure of Drosophila melanogaster IC/Tctex-1/LC8; Allosteric Interactions of Dynein Light Chains with Dynein Intermediate Chain 提交 2008-12-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 E 1–89(89 aa)
链 F 1–89(89 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Hanging Drop;pH 6.5;277.15 K;16% PEG 8K, 100 mM sodium cacodylate, 200 mM calcium acetate, pH 6.5, Hanging Drop, temperature 277.15K
分辨率 3.50 Å R-free 0.275
3GLW Quaternary Structure of Drosophila melanogaster IC/Tctex-1/LC8; Allosteric Interactions of Dynein Light Chains with Dynein Intermediate Chain 提交 2009-03-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277.15 K;30% PEG 400, 100 mM Hepes, 200 mM magnesium chloride at pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
分辨率 3.15 Å R-free 0.271
4QH7 LC8 - Ana2 (159-168) Complex 提交 2014-05-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa) 片段:LC8
链 B 1–89(89 aa) 片段:LC8
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;0.3M magnesium acetate, 0.1M sodium cacodylate, 26% PEG 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
分辨率 1.83 Å R-free 0.207
4QH7 LC8 - Ana2 (159-168) Complex 提交 2014-05-27 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 E 1–89(89 aa) 片段:LC8
链 F 1–89(89 aa) 片段:LC8
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;0.3M magnesium acetate, 0.1M sodium cacodylate, 26% PEG 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
分辨率 1.83 Å R-free 0.207
4QH8 LC8 - Ana2 (237-246) Complex 提交 2014-05-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa) 片段:LC8
链 B 1–89(89 aa) 片段:LC8
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;293.15 K;0.19M ammonium acetate, 0.1M sodium acetate, 0.1% beta-mercaptoethanol, and 27% PEG 4000, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
分辨率 1.90 Å R-free 0.236
4QH8 LC8 - Ana2 (237-246) Complex 提交 2014-05-27 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 1–89(89 aa) 片段:LC8
链 F 1–89(89 aa) 片段:LC8
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;293.15 K;0.19M ammonium acetate, 0.1M sodium acetate, 0.1% beta-mercaptoethanol, and 27% PEG 4000, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
分辨率 1.90 Å R-free 0.236
4QH8 LC8 - Ana2 (237-246) Complex 提交 2014-05-27 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 G 1–89(89 aa) 片段:LC8
链 H 1–89(89 aa) 片段:LC8
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;293.15 K;0.19M ammonium acetate, 0.1M sodium acetate, 0.1% beta-mercaptoethanol, and 27% PEG 4000, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
分辨率 1.90 Å R-free 0.236
5E0L LC8 - Chica (415-424) Complex 提交 2015-09-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 3–89(87 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;0.1 M calcium acetate, 0.1 M sodium cacodylate, 15% polyethylene glycol 8000
分辨率 1.31 Å R-free 0.202
5E0M LC8 - Chica (468-476) Complex 提交 2015-09-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Bis-Tris, 25% polyethylene glycol 3350
分辨率 1.65 Å R-free 0.232
7K3J Crystal structure of dLC8 in complex with Panoramix TQT+TQ peptide 提交 2020-09-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 G 1–89(89 aa)
链 I 1–89(89 aa)
链 K 1–89(89 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.2 M Li2SO4, 0.1 M Tris pH 8.5, 40% (v/v) PEG 400
分辨率 2.50 Å R-free 0.272
7K3J Crystal structure of dLC8 in complex with Panoramix TQT+TQ peptide 提交 2020-09-11 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 1–89(89 aa)
链 E 1–89(89 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.2 M Li2SO4, 0.1 M Tris pH 8.5, 40% (v/v) PEG 400
分辨率 2.50 Å R-free 0.272
7K3K Crystal structure of dLC8 in complex with Panoramix TQT peptide 提交 2020-09-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M NH4Ac, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 17% (w/v) PEG 10000
分辨率 1.42 Å R-free 0.201
7K3L Crystal structure of dLC8 in complex with Panoramix TQ peptide 提交 2020-09-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M KSCN, 30% (w/v) PEG 2000 MME
分辨率 1.79 Å R-free 0.209