当前蛋白身份:Q27974 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1N4C NMR Structure of the J-Domain and Clathrin Substrate Binding Domain of Bovine Auxilin 提交 2002-10-30 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 737–910(174 aa) 片段:Residues (737-845), J-Domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 4.5;300 K;离子强度(mmCIF原始值)60mM NaCl;压力 ambient
NMR样品组成 1.5mM Auxilin (20kD C-terminal construct) U-15N | 90% H20, 10% D2O
NMR样品组成 1.5mM Auxilin (20kD C-terminal construct) U-15N,13C | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
1NZ6 Crystal Structure of Auxilin J-Domain 提交 2003-02-16 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 810–910(101 aa) 片段:J-Domain
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 microbatch under oil;pH 8;277 K;PEG 8000, Tris-Cl, TCEP, Glycerol, pH 8.0, microbatch under oil, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.268
1NZ6 Crystal Structure of Auxilin J-Domain 提交 2003-02-16 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 810–910(101 aa) 片段:J-Domain
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 microbatch under oil;pH 8;277 K;PEG 8000, Tris-Cl, TCEP, Glycerol, pH 8.0, microbatch under oil, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.268
1XI5 Clathrin D6 coat with auxilin J-domain 提交 2004-09-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 216 PDB 声明:216-MERIC(216) 与蛋白数一致
链 J 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
链 K 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
链 L 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
链 M 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
链 N 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
链 O 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
链 P 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
链 Q 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
链 R 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20MM HEPES;pH 7;20MM HEPES
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;VITRIFIED
分辨率 12.00 Å
1XI5 Clathrin D6 coat with auxilin J-domain 提交 2004-09-21 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致
链 J 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
链 K 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
链 L 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
链 M 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
链 N 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
链 O 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
链 P 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
链 Q 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
链 R 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20MM HEPES;pH 7;20MM HEPES
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;VITRIFIED
分辨率 12.00 Å
1XI5 Clathrin D6 coat with auxilin J-domain 提交 2004-09-21 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致
链 J 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
链 K 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
链 L 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
链 M 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
链 N 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
链 O 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
链 P 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
链 Q 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
链 R 797–910(114 aa) 片段:residues 797-910
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20MM HEPES;pH 7;20MM HEPES
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;VITRIFIED
分辨率 12.00 Å
2QWN Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-386aa)R171C and bovine Auxilin (810-910aa)D876C in the ADP*Pi state 提交 2007-08-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 812–905(94 aa)
突变:D876C PO4 PHOSPHATE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 microbatch under oil;pH 8;289 K;PEG3350, Ammonium Acetate, pH 8.0, microbatch under oil, temperature 289K
分辨率 2.40 Å R-free 0.279
2QWO Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)R171C and bovine Auxilin (810-910aa)D876C in the ADP*Pi form #1 提交 2007-08-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 813–904(92 aa)
突变:D876C PO4 PHOSPHATE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACY ACETIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 microbatch under oil;pH 8.5;289 K;PEG3350, Ammonium Acetate, pH 8.5, microbatch under oil, temperature 289K
分辨率 1.70 Å R-free 0.222
2QWP Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)R171C and bovine Auxilin (810-910aa)D876C in the ADP*Pi form #2 提交 2007-08-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 813–904(92 aa)
突变:D876C PO4 PHOSPHATE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACY ACETIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 microbatch under oil;pH 8.5;289 K;PEG3350, Ammonium Acetate, pH 8.5, microbatch under oil, temperature 289K
分辨率 1.75 Å R-free 0.243
2QWQ Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)R171C and bovine Auxilin (810-910aa)D876C in the AMPPNP hydrolyzed form 提交 2007-08-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 813–904(92 aa)
突变:D876C PO4 PHOSPHATE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACY ACETIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 microbatch under oil;pH 8.5;289 K;PEG3350, Ammonium Acetate, pH 8.5, microbatch under oil, temperature 289K
分辨率 2.21 Å R-free 0.295
2QWR Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)R171C and bovine Auxilin (810-910aa)D876C in the AMPPNP intact form 提交 2007-08-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 813–904(92 aa)
突变:D876C ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ACY ACETIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 microbatch under oil;pH 8.5;289 K;PEG3350, Ammonium Acetate, pH 8.5, microbatch under oil, temperature 289K
分辨率 2.21 Å R-free 0.294
3N0A Crystal structure of auxilin (40-400) 提交 2010-05-13 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 40–400(361 aa) 片段:UNP residues 40-400
未记录 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;15.5% PEG 4000, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 0.01 M CaCl2, 0.8 M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.200