当前蛋白身份:Q27974
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1N4C NMR Structure of the J-Domain and Clathrin Substrate Binding Domain of Bovine Auxilin 提交 2002-10-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
737–910(174 aa)
片段:Residues (737-845), J-Domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 4.5;300 K;离子强度(mmCIF原始值)60mM NaCl;压力 ambient
NMR样品组成
1.5mM Auxilin (20kD C-terminal construct) U-15N | 90% H20, 10% D2O
NMR样品组成
1.5mM Auxilin (20kD C-terminal construct) U-15N,13C | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1NZ6 Crystal Structure of Auxilin J-Domain 提交 2003-02-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
810–910(101 aa)
片段:J-Domain
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
microbatch under oil;pH 8;277 K;PEG 8000, Tris-Cl, TCEP, Glycerol, pH 8.0, microbatch under oil, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.268 |
| 1NZ6 Crystal Structure of Auxilin J-Domain 提交 2003-02-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
810–910(101 aa)
片段:J-Domain
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
microbatch under oil;pH 8;277 K;PEG 8000, Tris-Cl, TCEP, Glycerol, pH 8.0, microbatch under oil, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.268 |
| 1XI5 Clathrin D6 coat with auxilin J-domain 提交 2004-09-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 216 PDB 声明:216-MERIC(216) 与蛋白数一致 |
链 J
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
链 K
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
链 L
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
链 M
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
链 N
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
链 O
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
链 P
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
链 Q
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
链 R
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20MM HEPES;pH 7;20MM HEPES
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;VITRIFIED
|
分辨率 12.00 Å |
| 1XI5 Clathrin D6 coat with auxilin J-domain 提交 2004-09-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致 |
链 J
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
链 K
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
链 L
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
链 M
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
链 N
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
链 O
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
链 P
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
链 Q
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
链 R
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20MM HEPES;pH 7;20MM HEPES
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;VITRIFIED
|
分辨率 12.00 Å |
| 1XI5 Clathrin D6 coat with auxilin J-domain 提交 2004-09-21 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致 |
链 J
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
链 K
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
链 L
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
链 M
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
链 N
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
链 O
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
链 P
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
链 Q
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
链 R
797–910(114 aa)
片段:residues 797-910
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20MM HEPES;pH 7;20MM HEPES
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;VITRIFIED
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分辨率 12.00 Å |
| 2QWN Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-386aa)R171C and bovine Auxilin (810-910aa)D876C in the ADP*Pi state 提交 2007-08-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
812–905(94 aa)
|
突变:D876C | PO4 PHOSPHATE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
microbatch under oil;pH 8;289 K;PEG3350, Ammonium Acetate, pH 8.0, microbatch under oil, temperature 289K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.279 |
| 2QWO Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)R171C and bovine Auxilin (810-910aa)D876C in the ADP*Pi form #1 提交 2007-08-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
813–904(92 aa)
|
突变:D876C | PO4 PHOSPHATE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACY ACETIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
microbatch under oil;pH 8.5;289 K;PEG3350, Ammonium Acetate, pH 8.5, microbatch under oil, temperature 289K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.222 |
| 2QWP Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)R171C and bovine Auxilin (810-910aa)D876C in the ADP*Pi form #2 提交 2007-08-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
813–904(92 aa)
|
突变:D876C | PO4 PHOSPHATE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACY ACETIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
microbatch under oil;pH 8.5;289 K;PEG3350, Ammonium Acetate, pH 8.5, microbatch under oil, temperature 289K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.243 |
| 2QWQ Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)R171C and bovine Auxilin (810-910aa)D876C in the AMPPNP hydrolyzed form 提交 2007-08-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
813–904(92 aa)
|
突变:D876C | PO4 PHOSPHATE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACY ACETIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
microbatch under oil;pH 8.5;289 K;PEG3350, Ammonium Acetate, pH 8.5, microbatch under oil, temperature 289K
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.295 |
| 2QWR Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)R171C and bovine Auxilin (810-910aa)D876C in the AMPPNP intact form 提交 2007-08-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
813–904(92 aa)
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突变:D876C | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ACY ACETIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
microbatch under oil;pH 8.5;289 K;PEG3350, Ammonium Acetate, pH 8.5, microbatch under oil, temperature 289K
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.294 |
| 3N0A Crystal structure of auxilin (40-400) 提交 2010-05-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
40–400(361 aa)
片段:UNP residues 40-400
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未记录 | CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;15.5% PEG 4000, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 0.01 M CaCl2, 0.8 M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.20 Å R-free 0.200 |