当前蛋白身份:Q2N0S8 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5WDU HIV-1 Env BG505 SOSIP.664 H72C-H564C trimer in complex with bNAbs PGT122 Fab, 35O22 Fab and NIH45-46 scFv 提交 2017-07-06 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致
链 A 517–663(147 aa)
链 J 517–663(147 aa)
链 R 517–663(147 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;8% (w/v) polyethylene glycol 8000, 0.1 M Tris, pH 8.5
分辨率 7.00 Å R-free 0.363
6DFG BG505 MD39 SOSIP trimer in complex with mature BG18 fragment antigen binding 提交 2018-05-14 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 B 511–663(153 aa)
链 E 511–663(153 aa)
链 F 511–663(153 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;3.5 second blot time
分辨率 4.42 Å
7T9A ApexGT2 in complex with GT2-d42.16 and RM20A3 Fabs 提交 2021-12-18 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric(14) 与蛋白数一致
链 B 511–663(153 aa)
链 D 511–663(153 aa)
链 F 511–663(153 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 42 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
8T4K MD64 N332-GT5 SOSIP 提交 2023-06-09 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 B 511–663(153 aa)
链 E 511–663(153 aa)
链 F 511–663(153 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9F02 HIV-1 envelope glycoprotein (BG505 gp140 SOSIP.664) trimer in complex with three copies of ELC07 broadly neutralizing antibody. 提交 2024-04-15 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致
链 A 511–663(153 aa)
链 C 30–512(483 aa)
链 E 511–663(153 aa)
链 F 511–663(153 aa)
链 G 30–512(483 aa)
链 N 30–512(483 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;150 mM NaCl, 50 mM Tris-HCl, pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.02 Å
9PIT HIV-1 bnAb 1-23 in complex with BG505 MD39 SOSIP and RM19R 提交 2025-07-11 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:18-meric(18) 与蛋白数一致
链 A 511–663(153 aa)
链 C 511–663(153 aa)
链 D 511–663(153 aa)
突变:F519S, I559P, A561P, L568D, V570H, R585H, T605C 突变:F519S, I559P, A561P, L568D, V570H, R585H, T605C 突变:F519S, I559P, A561P, L568D, V570H, R585H, T605C NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9PIV HIV-1 bnAb 9-71 in complex with BG505 MD39 SOSIP and RM19R 提交 2025-07-11 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:18-meric(18) 与蛋白数一致
链 A 511–663(153 aa)
链 C 511–663(153 aa)
链 D 511–663(153 aa)
突变:F519S, I559P, A561P, L568D, V570H, R585H, T605C 突变:F519S, I559P, A561P, L568D, V570H, R585H, T605C 突变:F519S, I559P, A561P, L568D, V570H, R585H, T605C NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å