当前蛋白身份:Q3C1D5 重新检索
本组结构的主要差异维度
配体/离子不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7Q04 Crystal structure of TPADO in a substrate-free state 提交 2021-10-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 1–413(413 aa)
链 E 1–413(413 aa)
链 F 1–413(413 aa)
未记录 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 FE FE (III) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;12.5% MPD, 12.5% PEG 3350, 12.5% PEG 1000, 0.3 M sodium nitrate, 0.3 M sodium phosphate dibasic, 0.3 M ammonium sulfate, 0.1 M buffer Imidazole/MES pH 6.5
分辨率 2.28 Å R-free 0.225
7Q05 Crystal structure of TPADO in complex with TPA 提交 2021-10-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 1–413(413 aa)
链 E 1–413(413 aa)
链 F 1–413(413 aa)
未记录 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SO4 SULFATE ION × 11 UB7 terephthalic acid × 3 FE FE (III) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;12.5% MPD, 12.5% PEG 3350, 12.5% PEG 1000, 0.3 M sodium nitrate, 0.3 M sodium phosphate dibasic, 0.3 M ammonium sulfate, 0.1 M buffer Imidazole/MES pH 6.5
分辨率 2.08 Å R-free 0.214
7Q06 Crystal structure of TPADO in complex with 2-OH-TPA 提交 2021-10-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 1–413(413 aa)
链 E 1–413(413 aa)
链 F 1–413(413 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 FE FE (III) ION × 2 8IB 2-Hydroxyterephthalic acid × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;12.5% MPD, 12.5% PEG 3350, 12.5% PEG 1000, 0.3 M sodium nitrate, 0.3 M sodium phosphate dibasic, 0.3 M ammonium sulfate, 0.1 M buffer Imidazole/MES pH 6.5
分辨率 1.95 Å R-free 0.202