当前蛋白身份：Q51918
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1HEZ Structure of P. magnus protein L bound to a human IgM Fab. 提交 2000-11-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
476–536（61 aa）
片段：820-880
|
未记录 | IMD IMIDAZOLE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；13-16% MPEG 5000, 100MM IMIDAZOLE MALATE, PH8.5, pH 8.50
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.278 |
| 1YMH anti-HCV Fab 19D9D6 complexed with protein L (PpL) mutant A66W 提交 2005-01-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
474–538（65 aa）
|
突变：A866W | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.1；293 K；9% PEG5K, 100mM Na cacodylate, pH 5.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.302 |
| 1YMH anti-HCV Fab 19D9D6 complexed with protein L (PpL) mutant A66W 提交 2005-01-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
474–538（65 aa）
|
突变：A866W | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.1；293 K；9% PEG5K, 100mM Na cacodylate, pH 5.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.302 |
| 2FS1 solution structure of PSD-1 提交 2006-01-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
798–839（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM；压力 ambient
NMR样品组成
0.2~0.4 mM PSD-1, 50 mM sodium phosphate buffer, pH 7.0, 0.1 mM EDTA, 10% D2O, 90% H2O | 10% D2O, 90% H2O
|
分辨率未提供 |
| 4IOI Meditope-enabled trastuzumab in complex with CQFDLSTRRLKC 提交 2013-01-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
476–537（62 aa）
|
突变：T34I, D55A, Y73N, T74H, I75M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；20% PEG 3350, 25 mM NaCl, 50 mM Hepes, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.204 |
| 5U3D STRUCTURE OF MEDITOPE ENABLED TRASTUZUMAB I83E VARIANT 提交 2016-12-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
477–537（61 aa）
|
未记录 | MRY MESO-ERYTHRITOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；50 MM TRIS, PH 7.2, 50 MM NACL, 20%
PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.185 |
| 5U5F MEDITOPE ENABLED TRASTUZUMAB I83E VARIANT IN COMPLEX WITH (Ac) CQFDA(PH)2STRRLRCGGSK 提交 2016-12-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
477–537（61 aa）
|
突变：YES | MRY MESO-ERYTHRITOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；50 MM TRIS, PH 7.2, 50 MM NACL, 20%
PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.192 |
| 5U5M CRYSTAL STRUCTURE OF I83E MEDITOPE-ENABLED TRASTUZUMAB WITH AZIDO-MEDITOPE 提交 2016-12-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
477–537（61 aa）
|
未记录 | MRY MESO-ERYTHRITOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；18 % PEG 3350, 150 MM NACL, 100 MM
TRIS, PH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.197 |
| 5U6A CRYSTAL STRUCTURE OF I83E MEDITOPE-ENABLED TRASTUZUMAB WITH AZIDO-PEG3-MEDITOPE 提交 2016-12-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
479–537（59 aa）
|
未记录 | MRY MESO-ERYTHRITOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；16% PEG 3350 200 MM NACL, PH 7.2
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.188 |
| 6B9Y Trastuzumab Fab v3 in complex with 5-phenyl meditope variant 提交 2017-10-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
477–537（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris pH 7.5, 15% PEG3350, 24 mM NaCl
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.218 |
| 6B9Z Trastuzumab Fab v3 提交 2017-10-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
477–537（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris, pH 7.5, 24 mM NaCl, 15% PEG3350
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.189 |
| 6BAE Trastuzumab Fab v3 in complex with CQFDLSTRRLKC 提交 2017-10-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
477–537（61 aa）
|
突变：T17I, D38A, Y56N, T57H, I58M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris pH 7.5, 24 mM NaCl, 15% PEG 3350
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.224 |
| 6BAH Trastuzumab Fab v3 with 5-diphenyl meditope variant 提交 2017-10-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
477–537（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris, pH 7.5, 24 mM NaCl, 15% PEG 3350
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.194 |