当前蛋白身份：Q53HL2
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2KDD Solution structure of the conserved C-terminal dimerization domain of Borealin 提交 2009-01-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
207–280（74 aa）
链 B
207–280（74 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.2；299 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成
0.6 mM Borealin, 40 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.8 mM [U-100% 15N] Borealin, 40 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.7 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Borealin, 40 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.7 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Borealin, 40 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.8 mM 50% [U-100% 13C; U-100% 15N], 50% natural abundance Borealin, 40 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 100% D2O | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 2QFA Crystal structure of a Survivin-Borealin-INCENP core complex 提交 2007-06-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
15–76（62 aa）
片段：UNP residues 15-76
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；50mM MES pH6, 10% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
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分辨率 1.40 Å R-free 0.202 |
| 2RAW Crystal structure of the Borealin-Survivin complex 提交 2007-09-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
20–78（59 aa）
片段：N-terminal region (residues 20-78)
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；0.5 ul protein and 0.5 ul well solution (0.1 M Na HEPES, pH 7.5; 0.2 M CaCl2; 28% (w/v) PEG 400), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
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分辨率 2.40 Å R-free 0.298 |
| 2RAX Crystal structure of Borealin (20-78) bound to Survivin (1-120) 提交 2007-09-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
20–78（59 aa）
片段：N-terminal fragment, residues 20-78
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；0.5 ul protein plus 0.5 uL well solution consisting of 0.1 M HEPES, pH 7.5; 10% (w/v) PEG 8000; 8 % (v/v) ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
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分辨率 3.30 Å R-free 0.284 |
| 2RAX Crystal structure of Borealin (20-78) bound to Survivin (1-120) 提交 2007-09-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
20–78（59 aa）
片段：N-terminal fragment, residues 20-78
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；0.5 ul protein plus 0.5 uL well solution consisting of 0.1 M HEPES, pH 7.5; 10% (w/v) PEG 8000; 8 % (v/v) ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.284 |
| 2RAX Crystal structure of Borealin (20-78) bound to Survivin (1-120) 提交 2007-09-17 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Y
20–78（59 aa）
片段：N-terminal fragment, residues 20-78
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；0.5 ul protein plus 0.5 uL well solution consisting of 0.1 M HEPES, pH 7.5; 10% (w/v) PEG 8000; 8 % (v/v) ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.284 |
| 6YIE Structure of a Borealin-INCENP-Survivin complex 提交 2020-04-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
10–109（100 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；298 K；5 % (w/v) PEG 3,350, 50 mM MES pH 6.0
|
分辨率 3.49 Å R-free 0.324 |
| 6YIE Structure of a Borealin-INCENP-Survivin complex 提交 2020-04-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
10–109（100 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；298 K；5 % (w/v) PEG 3,350, 50 mM MES pH 6.0
|
分辨率 3.49 Å R-free 0.324 |
| 6YIF Structure of Chromosomal Passenger Complex (CPC) bound to phosphorylated Histone 3 peptide at 1.8 A. 提交 2020-04-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
10–76（67 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；20 % (w/v) PEG 4,000, 200 mM Lithium sulphate, 50 mM MES pH 6.5
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分辨率 1.81 Å R-free 0.223 |
| 6YIH Structure of Chromosomal Passenger Complex (CPC) bound to phosphorylated Histone 3 peptide at 2.6 A. 提交 2020-04-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
10–76（67 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；291 K；20 % (w/v) PEG 4,000, 100 mM HEPES pH 7.0, 150 mM ammonium sulphate
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分辨率 2.55 Å R-free 0.259 |
| 7U5V Crystal structure of the Mixed Lineage Leukaemia (MLL1) SET Domain with the cofactor product S-Adenosylhomocysteine and Borealin peptide 提交 2022-03-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
137–145（9 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；60% Tacsimate pH 7.0
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分辨率 2.59 Å R-free 0.304 |
| 8RUP Chromosome Passenger Complex (CPC) localization module in complex with H3.T3p-nucleosome 提交 2024-01-31 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric（13） 与全部聚合物一致 |
链 L
1–76（76 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；10 mM TRIS-HCl, pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.3% n-octyl-beta-D-glucoside
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3 s blotting time, -10 force, no wait time.
|
分辨率 2.42 Å |
| 8RUQ Borealin N-terminus in complex with H3.T3p-nucleosome 提交 2024-01-31 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 L
1–76（76 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；10 mM TRIS-HCl, pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.3% n-octyl-beta-D-glucoside
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3 s blotting time, -10 force, no wait time.
|
分辨率 2.29 Å |
| 9D41 Crystal structure of N-terminal domain of Borealin (20-88) in complex with synthetic antibody fragment 提交 2024-08-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
20–88（69 aa）
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未记录 | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 10 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.5；292 K；0.1 M CAPS, 40 % v/v MPD
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.197 |
| 9SI3 Chromosomal Passenger Complex in complex with H3T3ph Nucleosome 提交 2025-08-28 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric（14） 与全部聚合物一致 |
链 L
1–280（280 aa）
链 O
1–280（280 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.83 Å |
| 9SI9 Chromosomal Passenger Complex in complex with H3T3ph Nucleosome (Class0) 提交 2025-08-28 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric（14） 与全部聚合物一致 |
链 L
1–280（280 aa）
链 O
1–280（280 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.86 Å |
| 9SJ5 Chromosomal Passenger Complex in complex with H3T3ph Nucleosome (Class1) 提交 2025-08-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric（14） 与全部聚合物一致 |
链 L
1–280（280 aa）
链 O
1–280（280 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.85 Å |
| 9SLJ Chromosomal Passenger Complex in complex with H3T3ph Nucleosome (Double Occupancy) 提交 2025-09-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric（16） 与全部聚合物一致 |
链 L
1–280（280 aa）
链 O
1–280（280 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |