当前蛋白身份:Q56312 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1TMY CHEY FROM THERMOTOGA MARITIMA (APO-I) 提交 1997-05-16 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–120(120 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5;PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 0.1M TRIS BUFFER (PH 8.5) AND 1.8M AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 1.90 Å
1U0S Chemotaxis kinase CheA P2 domain in complex with response regulator CheY from the thermophile thermotoga maritima 提交 2004-07-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 Y 2–119(118 aa) 片段:response regulatory domain, CheY response regulator
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;25-30% PEG 12K, 0.1M Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 1.90 Å R-free 0.253
2LLE Computational design of an eight-stranded (beta/alpha)-barrel from fragments of different folds 提交 2011-11-07 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–11(11 aa)
链 A 34–103(70 aa)
突变:R4I, D78G, I95L, L201A,V213G 突变:R4I, D78G, I95L, L201A,V213G 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.5;313 K;离子强度(mmCIF原始值)350;压力 ambient
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 15N] CheYHisF-sfr_RM, 50 mM potassium phosphate, 300 mM potassium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CheYHisF-sfr_RM, 50 mM potassium phosphate, 300 mM potassium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2TMY CHEY FROM THERMOTOGA MARITIMA (APO-II) 提交 1997-05-19 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–120(120 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.6;0.2M AMMONIUM SULFATE, 0.1M ACETATE BUFFER (PH 4.6), 30% PEG 4000, 15MM MGCL2
分辨率 2.30 Å
3TMY CHEY FROM THERMOTOGA MARITIMA (MN-III) 提交 1997-06-04 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–120(120 aa)
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7;0.2M AMMONIUM SULFATE, 0.1M HEPES BUFFER (PH 7.0), 25% PEG 4000, 15MM MANGANESE CHLORIDE
分辨率 2.20 Å
3TMY CHEY FROM THERMOTOGA MARITIMA (MN-III) 提交 1997-06-04 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–120(120 aa)
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7;0.2M AMMONIUM SULFATE, 0.1M HEPES BUFFER (PH 7.0), 25% PEG 4000, 15MM MANGANESE CHLORIDE
分辨率 2.20 Å
4IGA The crystal structure of an activated Thermotoga maritima CheY with N-terminal region of FliM 提交 2012-12-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–120(120 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;298 K;30% (w/v) PEG 4000, 0.1M TRIS pH 8.5, 0.2M sodium acetate, 0.2M lithium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.73 Å R-free 0.276
4QYW Structure of phosphono-CheY from T.maritima 提交 2014-07-25 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 2–120(119 aa)
突变:D54(CYQ), C81A 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;100mM acetate, pH 5.5, 350 uM Sc(ClO4)3, 0.02% azide, 150 mM sodium malonate, 19% PeEG 6000., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.60 Å R-free 0.268
4TMY CHEY FROM THERMOTOGA MARITIMA (MG-IV) 提交 1997-06-06 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–120(120 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7;0.2M AMMONIUM SULFATE, 0.1M HEPES BUFFER (PH 7.0), 25% PEG 4000, 15MM MAGNESIUM CHLORIDE
分辨率 2.80 Å
4TMY CHEY FROM THERMOTOGA MARITIMA (MG-IV) 提交 1997-06-06 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–120(120 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7;0.2M AMMONIUM SULFATE, 0.1M HEPES BUFFER (PH 7.0), 25% PEG 4000, 15MM MAGNESIUM CHLORIDE
分辨率 2.80 Å
6C40 CheY41PyTyrD54K from Thermotoga maritima 提交 2018-01-11 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 2–119(118 aa)
链 D 2–119(118 aa)
突变:E41PyTyr, D54K 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:E41PyTyr, D54K 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CU COPPER (II) ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;HEPES pH 7, ammonium sulfate, PEG 4000
分辨率 2.70 Å R-free 0.295
8Q52 A PBP-like protein built from fragments of different folds 提交 2023-08-08 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 5–105(101 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;30% PEG 4000, 0.1M Tris.HCl, 0.3M Li sulfate
分辨率 2.15 Å R-free 0.253