当前蛋白身份:Q5JVF3
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3T5X PCID2:DSS1 Structure 提交 2011-07-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
201–399(199 aa)
片段:UNP residues 201-399
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;292 K;25.5 % (w/v) PEG 2K MME, 0.95 M sodium formate, and 0.1 M MES (pH 6.5), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.231 |
| 8R7J Cryo-EM structure of the human TREX-2 complex 提交 2023-11-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
1–399(399 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.50 Å |
| 8R7K Cryo-EM structure of the human UAP56 - TREX-2 complex 提交 2023-11-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 B
1–399(399 aa)
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.50 Å |
| 9DLP Cryo-EM structure of human TREX-2 complex bound to DDX39B(UAP56) 提交 2024-09-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 B
1–399(399 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.79 Å |
| 9DLR Cryo-EM structure of the human TREX-2.1 complex (LENG8/PCID2/DSS1) bound to the N-terminal motif of DDX39B(UAP56) 提交 2024-09-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 B
1–399(399 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.08 Å |
| 9DLV Cryo-EM structure of the human TREX-2.1 complex (LENG8/PCID2/DSS1) bound to DDX39B(UAP56) 提交 2024-09-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 B
1–399(399 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.97 Å |
| 9T6L Cryo-EM structure of the human LENG8-PCID2-DSS1 complex bound to UAP56 and RRP1B 提交 2025-11-07 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:pentameric(5) 待复核 |
链 D
1–399(399 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 2.90 Å |
| 9T6N Cryo-EM structure of the human GANP-PCID2-DSS1 complex bound to UAP56 提交 2025-11-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 D
1–399(399 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9UPB Structure of the human TREX-2 bound to UAP56 提交 2025-04-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 B
1–399(399 aa)
片段:3XFlag-PCID2
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未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9;25 mM HEPES-KOH, pH 7.9, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.41 Å |
| 9UPC Structure of human TREX-2 提交 2025-04-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
1–399(399 aa)
片段:3XFlag-PCID2
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9;25 mM HEPES-KOH, pH 7.9, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.14 Å |