当前蛋白身份：Q5MNZ6
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6IYY Crystal structure of human WIPI3,loop deletion mutant 提交 2018-12-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
8–344（337 aa）
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突变：DELETION OF RESIDUES 75-80 and 264-281 | SO4 SULFATE ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 7；289 K；1.6M Ammonium Sulfate, 0.1M Tris-HCl
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分辨率 1.80 Å R-free 0.204 |
| 6KLR Crystal structure of human WIPI3 in complex with the WIR-peptide from ATG2A 提交 2019-07-30 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
8–344（337 aa）
链 B
8–344（337 aa）
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突变：Deletion of 75-80 and Deletion of 264-280 突变：Deletion of 75-80 and Deletion of 264-280 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1M Tirs-HCl, pH 8.5, 20% (v/v) Ethanol
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分辨率 2.21 Å R-free 0.255 |
| 8ZQG Crystal structure of WIPI3 in complex with ATG16L1 提交 2024-06-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
8–344（337 aa）
链 B
8–344（337 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；289 K；0.02 M Citric acid, 0.08 M BIS-TRIS propane (pH 8.8); 16% w/v Polyethylene glycol 3350
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分辨率 2.77 Å R-free 0.233 |
| 9C9I Structure of the TSC1:WIPI3 complex 提交 2024-06-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
12–344（333 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.2 M ammonium tartrate, 20 % PEG3350, and 0.25 M sodium acetate.
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分辨率 3.18 Å R-free 0.255 |
| 9C9I Structure of the TSC1:WIPI3 complex 提交 2024-06-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
12–344（333 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.2 M ammonium tartrate, 20 % PEG3350, and 0.25 M sodium acetate.
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分辨率 3.18 Å R-free 0.255 |
| 9C9I Structure of the TSC1:WIPI3 complex 提交 2024-06-14 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
12–344（333 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.2 M ammonium tartrate, 20 % PEG3350, and 0.25 M sodium acetate.
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分辨率 3.18 Å R-free 0.255 |
| 9C9I Structure of the TSC1:WIPI3 complex 提交 2024-06-14 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
12–344（333 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.2 M ammonium tartrate, 20 % PEG3350, and 0.25 M sodium acetate.
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分辨率 3.18 Å R-free 0.255 |
| 9CE3 Structure of the TSC:WIPI3 lysosomal recruitment complex 提交 2024-06-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 F
12–344（333 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6；20 mM HEPES (pH 7.6), 250 mM NaCl, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.90 Å |