当前蛋白身份：Q5MQD0
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5GNB Crystal Structure of the Receptor Binding Domain of the Spike Glycoprotein of Human Betacoronavirus HKU1 (HKU1 1A-CTD, 2.3 angstrom, native-SAD phasing) 提交 2016-07-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
307–677（371 aa）
片段：UNP residues 307-677
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.1M Tris, 24%PEG4000, 0.2M MgCl2, 4% v/v Pentaerythritol ethoxylate (3/4 EO/OH)
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.219 |
| 5KWB Crystal Structure of the Receptor Binding Domain of the Spike Glycoprotein of Human Betacoronavirus HKU1 (HKU1 1A-CTD, 1.9 angstrom, molecular replacement) 提交 2016-07-17 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
307–677（371 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 MG MAGNESIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.1M Tris, 24%PEG4000, 0.2M MgCl2
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.201 |
| 8DGW Crystal structure of HCoV-HKU1 spike stem helix peptide in complex with Fab of broadly neutralizing antibody CC95.108 isolated from a vaccinated COVID-19 convalescent 提交 2022-06-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 G
1226–1250（25 aa）
片段：stem helix domain, residues 1226-1250
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M Ammonium formate, 20% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.248 |
| 8DGW Crystal structure of HCoV-HKU1 spike stem helix peptide in complex with Fab of broadly neutralizing antibody CC95.108 isolated from a vaccinated COVID-19 convalescent 提交 2022-06-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
1226–1250（25 aa）
片段：stem helix domain, residues 1226-1250
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M Ammonium formate, 20% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.248 |
| 8DGW Crystal structure of HCoV-HKU1 spike stem helix peptide in complex with Fab of broadly neutralizing antibody CC95.108 isolated from a vaccinated COVID-19 convalescent 提交 2022-06-24 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 J
1226–1250（25 aa）
片段：stem helix domain, residues 1226-1250
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M Ammonium formate, 20% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.248 |
| 8DGW Crystal structure of HCoV-HKU1 spike stem helix peptide in complex with Fab of broadly neutralizing antibody CC95.108 isolated from a vaccinated COVID-19 convalescent 提交 2022-06-24 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 K
1226–1250（25 aa）
片段：stem helix domain, residues 1226-1250
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M Ammonium formate, 20% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.248 |
| 8VGT Structure of the HKU1 RBD bound to the human TMPRSS2 receptor 提交 2023-12-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
320–614（295 aa）
片段：RBD
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8Y7X Structure of HCoV-HKU1A spike in the functionally anchored-3up conformation with 3TMPRSS2 提交 2024-02-05 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1281（1268 aa）
链 B
14–1281（1268 aa）
链 C
14–1281（1268 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.09 Å |
| 8Y7Y Local structure of HCoV-HKU1A spike in complex with TMPRSS2 and glycan 提交 2024-02-05 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1281（1268 aa）
链 B
14–1281（1268 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 MJJ methyl 9-O-acetyl-5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosidonic acid × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.24 Å |
| 8YOY Structure of HKU1A RBD with TMPRSS2 提交 2024-03-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
307–677（371 aa）
片段：RBD domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.21 Å |
| 9BSW Cryo-EM structure of HCoV-HKU1 Spike glycoprotein (DDA state) 提交 2024-05-14 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
链 B
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
链 C
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.06 Å |
| 9BSX Cryo-EM structure of HCoV-HKU1 glycoprotein in complex with 9O-acetyl GD3 sialoglycan (DAA state) 提交 2024-05-14 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
链 B
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
链 C
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 A1AR1 5-acetamido-8-O-(5-acetamido-9-O-acetyl-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranonosyl)-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosonic acid × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.37 Å |
| 9BSY Cryo-EM structure of HCoV-HKU1 glycoprotein in complex with 9O-acetyl GD3 sialoglycan (DAU state) 提交 2024-05-14 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
链 B
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
链 C
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 A1AR1 5-acetamido-8-O-(5-acetamido-9-O-acetyl-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranonosyl)-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosonic acid × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.58 Å |
| 9BSZ Cryo-EM structure of HCoV-HKU1 glycoprotein in complex with 9O-acetyl GD3 sialoglycan (AUU state) 提交 2024-05-14 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
链 B
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
链 C
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32 A1AR2 5-acetamido-9-O-acetyl-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranonosyl-(2->8)-5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranonosyl-(2->3)-beta-D-galactopyranose × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.49 Å |
| 9BT0 Cryo-EM structure of HCoV-HKU1 Spike glycoprotein (DDD state) 提交 2024-05-14 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
链 B
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
链 C
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.23 Å |
| 9BT1 Cryo-EM structure of HCoV-HKU1 glycoprotein in complex with 9O-acetyl GD3 sialoglycan (UUU state) 提交 2024-05-14 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
链 B
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
链 C
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 A1AR1 5-acetamido-8-O-(5-acetamido-9-O-acetyl-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranonosyl)-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosonic acid × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.22 Å |
| 9BT2 Cryo-EM structure of HCoV-HKU1 glycoprotein D1 (Down State, locally refined) 提交 2024-05-14 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.93 Å |
| 9BT9 Cryo-EM Structure of HKU1 spike D1 Domain (Active state, locally refined) 提交 2024-05-14 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.11 Å |
| 9BTA Cryo-EM density map of HKU1 spike glycoprotein D1 domain in complex with 9O-acetyl GD3 sialoglycan (Down_alt state, locally refined) 提交 2024-05-14 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 A1AR1 5-acetamido-8-O-(5-acetamido-9-O-acetyl-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranonosyl)-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosonic acid × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.39 Å |
| 9BTB Cryo-EM density map of HKU1 spike glycoprotein D1 domain in complex with 9O-acetyl GD3 sialoglycan (Active state, locally refined) 提交 2024-05-14 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 A1AR1 5-acetamido-8-O-(5-acetamido-9-O-acetyl-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranonosyl)-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosonic acid × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.33 Å |
| 9BTC Cryo-EM density map of HKU1 spike glycoprotein D1 domain in complex with 9O-acetyl GD3 sialoglycan (Up state, locally refined) 提交 2024-05-14 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1223（1210 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 A1AR1 5-acetamido-8-O-(5-acetamido-9-O-acetyl-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranonosyl)-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosonic acid × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.41 Å |
| 9BTD Cryo-EM structure of HCoV-HKU1 glycoprotein in complex with 9O-acetyl GD3 sialoglycan (DDA state) 提交 2024-05-14 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
链 B
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
链 C
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 37 A1AR1 5-acetamido-8-O-(5-acetamido-9-O-acetyl-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranonosyl)-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosonic acid × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.43 Å |
| 9IZN Crystal structure of HKU1A RBD bound to TMPRSS2 提交 2024-08-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
307–677（371 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；2% v/v Tacsimate pH 7.0, 5% v/v 2-Propanol, 0.1 M Imidazole (pH 7.0) and 8% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.261 |
| 9JCX Crystal structure of the HCoV-HKU1 RBD and TMPRSS2 提交 2024-08-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
323–609（287 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；0.2 M Tris pH 7.0, 0.2 M MgCl2, 10% (w/v) Polyethylene glycol 8,000
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.237 |
| 9JCY Crystal structure of the HCoV-HKU1 RBD in complex with Fab 提交 2024-08-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
323–609（287 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；0.2% (w/v) Ala-Ala, 0.2% (w/v) Ala-Gln, 0.2% (w/v) Gly-Glu, 0.2% (w/v) Gly-L-Ala, 0.2% (w/v) Gly-L-Asp, 0.2% (w/v) Gly-Sar, 0.2% (w/v) L-Carnosine, 0.2% (w/v) Leu-Ala hydrate, 0.1 M Buffer System 3 [Tris (base); BICINE] pH 8.5, 20% (v/v) PEG 500* MME, 10 % w/v PEG 20,000; for TMPRSS2:VHH77, 0.2 M sodium malonate pH 6.0, 10% (w/v) Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.203 |
| 9N12 Cryo-EM structure of HCoV-HKU1 glycoprotein (mutant T31VPR34 to GGGG) 提交 2025-01-24 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1298（1285 aa）
链 B
14–1298（1285 aa）
链 C
14–1298（1285 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.18 Å |
| 9N13 Cryo-EM structure of HCoV-HKU1 glycoprotein D1 Domain (mutant T31VPR34 to GGGG) 提交 2025-01-24 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
14–1298（1285 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.34 Å |
| 9N14 Cryo-EM structure of HCoV-HKU1 glycoprotein in complex with 9OAc-GD3(mutant T31VPR34 to GGGG) 提交 2025-01-24 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
链 B
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
链 C
14–1298（1285 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 14-1298)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 35 A1AR1 5-acetamido-8-O-(5-acetamido-9-O-acetyl-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranonosyl)-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosonic acid × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.08 Å |
| 9N15 Cryo-EM structure of HCoV-HKU1 glycoprotein D1 Domain in complex with 9OAc-GD3(mutant T31VPR34 to GGGG) 提交 2025-01-24 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1298（1285 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 A1AR1 5-acetamido-8-O-(5-acetamido-9-O-acetyl-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranonosyl)-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosonic acid × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9N16 Cryo-EM structure of HCoV-HKU1 glycoprotein (Deletion 33Pro34Arg) 提交 2025-01-24 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1298（1285 aa）
链 B
14–1298（1285 aa）
链 C
14–1298（1285 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 9N17 Cryo-EM structure of HCoV-HKU1 glycoprotein D1 Domain (Deletion 33Pro34Arg) 提交 2025-01-24 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1298（1285 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.09 Å |
| 9N18 Cryo-EM structure of HCoV-HKU1 spike glycoprotein in complex with 9OAc-GD3 tetrasacchride (Deletion 33Pro34Arg) 提交 2025-01-24 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1298（1285 aa）
链 B
14–1298（1285 aa）
链 C
14–1298（1285 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 A1AR1 5-acetamido-8-O-(5-acetamido-9-O-acetyl-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranonosyl)-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosonic acid × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.02 Å |
| 9N19 Cryo-EM structure of HCoV-HKU1spike glycoprotein D1 Domain in complex with 9OAc-GD3 tetrasacchride (Deletion 33Pro34Arg) 提交 2025-01-24 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
14–1298（1285 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 A1AR1 5-acetamido-8-O-(5-acetamido-9-O-acetyl-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranonosyl)-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosonic acid × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.02 Å |
| 9OPQ TMPRSS2 (S441A) bound to the HCoV-NL63 S2'region genetically fused to the HCoV-HKU1 RBD 提交 2025-05-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
320–509（190 aa）
链 A
511–614（104 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.30 Å |