当前蛋白身份:Q5Y7D3 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4D8P Structural and functional studies of the trans-encoded HLA-DQ2.3 (DQA1*03:01/DQB1*02:01) molecule 提交 2012-01-11 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 33–230(198 aa)
突变:Q26E, Q23E GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;291 K;0.2M Li2So4, 0.1M Tris, 30% PEG 4000, 8% Glycerol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.05 Å R-free 0.283
4D8P Structural and functional studies of the trans-encoded HLA-DQ2.3 (DQA1*03:01/DQB1*02:01) molecule 提交 2012-01-11 Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 33–230(198 aa)
突变:Q26E, Q23E 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;291 K;0.2M Li2So4, 0.1M Tris, 30% PEG 4000, 8% Glycerol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.05 Å R-free 0.283
4OZF JR5.1 protein complex 提交 2014-02-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 B 33–224(192 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;Mother liquor: 0.15 - 0.25M CaOAc, 0.1M Tris/HCl, 12-18% PEG3350, Additives:2-3 mM reduced and oxidised Glutathione
分辨率 2.70 Å R-free 0.238
4OZG D2 protein complex 提交 2014-02-16 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 B 33–224(192 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;Mother liquor: 0.15- 0.25M CaOAc, 0.1 M Tris/HCl, 12-18% PEG3350, Additives: 2-3 mM reduced and oxidised Glutathione
分辨率 3.00 Å R-free 0.241
4OZG D2 protein complex 提交 2014-02-16 Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 D 33–224(192 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;Mother liquor: 0.15- 0.25M CaOAc, 0.1 M Tris/HCl, 12-18% PEG3350, Additives: 2-3 mM reduced and oxidised Glutathione
分辨率 3.00 Å R-free 0.241
4OZH S16 protein complex 提交 2014-02-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 B 33–224(192 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;Mother liquor: 0.15- 0.25M CaOAc, 0.1 M Tris/HCl, 12-18% PEG3350, Additives: 2-3 mM reduced and oxidised Glutathione
分辨率 2.80 Å R-free 0.243
4OZH S16 protein complex 提交 2014-02-16 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 D 33–224(192 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;Mother liquor: 0.15- 0.25M CaOAc, 0.1 M Tris/HCl, 12-18% PEG3350, Additives: 2-3 mM reduced and oxidised Glutathione
分辨率 2.80 Å R-free 0.243
4OZI S2 protein complex 提交 2014-02-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 B 33–224(192 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;Mother liquor: 0.15- 0.25M CaOAc, 0.1 M Tris/HCl, 12-18% PEG3350, Additives: 2-3 mM reduced and oxidised Glutathione
分辨率 3.20 Å R-free 0.243
4OZI S2 protein complex 提交 2014-02-16 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 D 33–224(192 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;Mother liquor: 0.15- 0.25M CaOAc, 0.1 M Tris/HCl, 12-18% PEG3350, Additives: 2-3 mM reduced and oxidised Glutathione
分辨率 3.20 Å R-free 0.243