当前蛋白身份：Q5ZSQ3
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3JZ9 Crystal structure of the GEF domain of DrrA/SidM from Legionella pneumophila 提交 2009-09-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
340–533（194 aa）
片段：GEF domain: UNP residues 340-533
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；0.25 M Sodium sulfate, 21% w/v PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
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分辨率 1.80 Å R-free 0.198 |
| 3JZA Crystal structure of human Rab1b in complex with the GEF domain of DrrA/SidM from Legionella pneumophila 提交 2009-09-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
340–533（194 aa）
片段：GEF domain: UNP residues 340-533
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未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.75；292 K；0.1 M Sodium citrate, 35% v/v PEG 600, pH 5.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
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分辨率 1.80 Å R-free 0.234 |
| 3N6O Crystal structure of the GEF and P4M domain of DrrA/SidM from Legionella pneumophila 提交 2010-05-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
340–647（308 aa）
片段：GEF and P4M domains (UNP residues 340-647)
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.8；298 K；20% (w/v) PEG4000, 0.16 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, 20% glycerol, pH 4.8, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
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分辨率 2.50 Å R-free 0.236 |
| 3N6O Crystal structure of the GEF and P4M domain of DrrA/SidM from Legionella pneumophila 提交 2010-05-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
340–647（308 aa）
片段：GEF and P4M domains (UNP residues 340-647)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.8；298 K；20% (w/v) PEG4000, 0.16 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, 20% glycerol, pH 4.8, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.236 |
| 4MXP Structural Basis for PI(4)P-Specific Membrane Recruitment of the Legionella pneumophila Effector DrrA/SidM 提交 2013-09-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
330–647（318 aa）
片段：GEF and P4M domains, UNP residues 330-647
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未记录 | DB4 (2R)-3-{[(R)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5S,6R)-2,3,5,6-tetrahydroxy-4-(phosphonooxy)cyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propane-1,2-diyl dibutanoate × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；4-6% PEG 3350, 100 mM Tris, 0.5 M NaCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 1.83 Å R-free 0.208 |