当前蛋白身份:Q61234 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1QAV Unexpected Modes of PDZ Domain Scaffolding Revealed by Structure of NNOS-Syntrophin Complex 提交 1999-03-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 75–164(90 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;298 K;VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, PH 8.5, 298K, 25% PEG4000, 0.2M SODIUM ACETATE, 100MM TRIS
分辨率 1.90 Å R-free 0.259
1Z86 Solution structure of the PDZ domain of alpha-syntrophin 提交 2005-03-30 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 79–165(87 aa) 片段:PDZ domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;303 K;压力 ambient
NMR样品组成 1mM PDZ domain of alpha1-syntrophin U-15N, 13C; 100mM potassium phosphate; 90% H2O,10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM PDZ domain of alpha1-syntrophin U-15N; 100mM potassium phosphate; 90% H2O,10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM PDZ domain of alpha1-syntrophin U-15N, 13C; 100mM potassium phosphate; 99.9% D2O | 99.9% D2O
NMR样品组成 1mM PDZ domain of alpha1-syntrophin; 100mM potassium phosphate; 99.9% D2O | 99.9% D2O
分辨率未提供
1Z87 solution structure of the split PH-PDZ Supramodule of alpha-Syntrophin 提交 2005-03-30 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 2–264(263 aa) 片段:the PHN-PDZ-PHC tandem
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;303 K;压力 ambient
NMR样品组成 1mM PHN-PDZ-PHC tandem of alpha1-syntrophin U-15N, 13C; 100mM potassium phosphate; 90% H2O,10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM PHN-PDZ-PHC tandem of alpha1-syntrophin U-15N; 100mM potassium phosphate; 90% H2O,10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM PHN-PDZ-PHC tandem of alpha1-syntrophin U-15N, 13C; 100mM potassium phosphate; 99.9% D2O | 99.9% D2O
NMR样品组成 1mM PHN-PDZ-PHC tandem of alpha1-syntrophin; 100mM potassium phosphate; 99.9% D2O | 99.9% D2O
分辨率未提供
2ADZ solution structure of the joined PH domain of alpha1-syntrophin 提交 2005-07-21 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 2–79(78 aa) 片段:PH domain
链 A 165–264(100 aa) 片段:PH domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;303 K;压力 ambient
NMR样品组成 1mM protein 15N; 100mM potassium phosphate pH 7.0 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM protein 15N, 13C; 100mM potassium phosphate pH 7.0 | 99.9% D2O
NMR样品组成 1mM unlabelled protein; 100mM potassium phosphate pH 7.0 | 99.9% D2O
分辨率未提供
2PDZ SOLUTION STRUCTURE OF THE SYNTROPHIN PDZ DOMAIN IN COMPLEX WITH THE PEPTIDE GVKESLV, NMR, 15 STRUCTURES 提交 1997-12-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 79–164(86 aa) 片段:PDZ DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.2;295 K;离子强度(mmCIF原始值)70mM;压力 1
NMR样品组成 H2O
分辨率未提供
4HOP Crystal structure of the computationally designed NNOS-Syntrophin complex 提交 2012-10-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 77–162(86 aa) 片段:PDZ DOMAIN (RESIDUES 77-162)
突变:H142F 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.25;293 K;0.1M MES, 0.2M LICL, 21.5% PEG 6000. SYNTROPHIN AT 3.6 MG/ML FINAL. NNOS AT 2.6 MG/ML FINAL. 1:1 MIX OF PROTEIN SOLUTION TO PRECIPITANT, pH 5.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.29 Å R-free 0.273
4HOP Crystal structure of the computationally designed NNOS-Syntrophin complex 提交 2012-10-22 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 77–162(86 aa) 片段:PDZ DOMAIN (RESIDUES 77-162)
突变:H142F 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.25;293 K;0.1M MES, 0.2M LICL, 21.5% PEG 6000. SYNTROPHIN AT 3.6 MG/ML FINAL. NNOS AT 2.6 MG/ML FINAL. 1:1 MIX OF PROTEIN SOLUTION TO PRECIPITANT, pH 5.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.29 Å R-free 0.273
4HOP Crystal structure of the computationally designed NNOS-Syntrophin complex 提交 2012-10-22 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 77–162(86 aa) 片段:PDZ DOMAIN (RESIDUES 77-162)
突变:H142F 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.25;293 K;0.1M MES, 0.2M LICL, 21.5% PEG 6000. SYNTROPHIN AT 3.6 MG/ML FINAL. NNOS AT 2.6 MG/ML FINAL. 1:1 MIX OF PROTEIN SOLUTION TO PRECIPITANT, pH 5.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.29 Å R-free 0.273