当前蛋白身份：Q63373
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1C4R THE STRUCTURE OF THE LIGAND-BINDING DOMAIN OF NEUREXIN 1BETA: REGULATION OF LNS DOMAIN FUNCTION BY ALTERNATIVE SPLICING 提交 1999-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
81–292（212 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.50
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.279 |
| 1C4R THE STRUCTURE OF THE LIGAND-BINDING DOMAIN OF NEUREXIN 1BETA: REGULATION OF LNS DOMAIN FUNCTION BY ALTERNATIVE SPLICING 提交 1999-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
81–292（212 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.50
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.279 |
| 1C4R THE STRUCTURE OF THE LIGAND-BINDING DOMAIN OF NEUREXIN 1BETA: REGULATION OF LNS DOMAIN FUNCTION BY ALTERNATIVE SPLICING 提交 1999-09-28 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
81–292（212 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.50
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.279 |
| 1C4R THE STRUCTURE OF THE LIGAND-BINDING DOMAIN OF NEUREXIN 1BETA: REGULATION OF LNS DOMAIN FUNCTION BY ALTERNATIVE SPLICING 提交 1999-09-28 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
81–292（212 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.50
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.279 |
| 1C4R THE STRUCTURE OF THE LIGAND-BINDING DOMAIN OF NEUREXIN 1BETA: REGULATION OF LNS DOMAIN FUNCTION BY ALTERNATIVE SPLICING 提交 1999-09-28 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
81–292（212 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.50
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.279 |
| 1C4R THE STRUCTURE OF THE LIGAND-BINDING DOMAIN OF NEUREXIN 1BETA: REGULATION OF LNS DOMAIN FUNCTION BY ALTERNATIVE SPLICING 提交 1999-09-28 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
81–292（212 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.50
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.279 |
| 1C4R THE STRUCTURE OF THE LIGAND-BINDING DOMAIN OF NEUREXIN 1BETA: REGULATION OF LNS DOMAIN FUNCTION BY ALTERNATIVE SPLICING 提交 1999-09-28 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
81–292（212 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.50
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.279 |
| 1C4R THE STRUCTURE OF THE LIGAND-BINDING DOMAIN OF NEUREXIN 1BETA: REGULATION OF LNS DOMAIN FUNCTION BY ALTERNATIVE SPLICING 提交 1999-09-28 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H
81–292（212 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.50
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.279 |
| 2R1B Crystal Structure of rat neurexin 1beta with a splice insert at SS#4 提交 2007-08-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
77–294（218 aa）
片段：LNS/LG domain
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；17% Peg 8000, 0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M MgCl2, 5 mM CaCl2, 0.5% beta-octyl-glucoside, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.225 |
| 2R1B Crystal Structure of rat neurexin 1beta with a splice insert at SS#4 提交 2007-08-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
77–294（218 aa）
片段：LNS/LG domain
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；17% Peg 8000, 0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M MgCl2, 5 mM CaCl2, 0.5% beta-octyl-glucoside, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.225 |
| 2R1D Crystal structure of rat neurexin 1beta in the Ca2+ containing form 提交 2007-08-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
78–302（225 aa）
片段：LNS/LG domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；21% Peg 5000 MME, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 0.2 M AmSO4, 1.86% 1,2,3-heptanetriol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.244 |
| 2R1D Crystal structure of rat neurexin 1beta in the Ca2+ containing form 提交 2007-08-22 | Assembly 10 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 W
78–302（225 aa）
片段：LNS/LG domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；21% Peg 5000 MME, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 0.2 M AmSO4, 1.86% 1,2,3-heptanetriol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.244 |
| 2R1D Crystal structure of rat neurexin 1beta in the Ca2+ containing form 提交 2007-08-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
78–302（225 aa）
片段：LNS/LG domain
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；21% Peg 5000 MME, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 0.2 M AmSO4, 1.86% 1,2,3-heptanetriol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.244 |
| 2R1D Crystal structure of rat neurexin 1beta in the Ca2+ containing form 提交 2007-08-22 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
78–302（225 aa）
片段：LNS/LG domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；21% Peg 5000 MME, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 0.2 M AmSO4, 1.86% 1,2,3-heptanetriol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.244 |
| 2R1D Crystal structure of rat neurexin 1beta in the Ca2+ containing form 提交 2007-08-22 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
78–302（225 aa）
片段：LNS/LG domain
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；21% Peg 5000 MME, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 0.2 M AmSO4, 1.86% 1,2,3-heptanetriol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.244 |
| 2R1D Crystal structure of rat neurexin 1beta in the Ca2+ containing form 提交 2007-08-22 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
78–302（225 aa）
片段：LNS/LG domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；21% Peg 5000 MME, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 0.2 M AmSO4, 1.86% 1,2,3-heptanetriol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.244 |
| 2R1D Crystal structure of rat neurexin 1beta in the Ca2+ containing form 提交 2007-08-22 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
78–302（225 aa）
片段：LNS/LG domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；21% Peg 5000 MME, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 0.2 M AmSO4, 1.86% 1,2,3-heptanetriol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.244 |
| 2R1D Crystal structure of rat neurexin 1beta in the Ca2+ containing form 提交 2007-08-22 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
78–302（225 aa）
片段：LNS/LG domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；21% Peg 5000 MME, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 0.2 M AmSO4, 1.86% 1,2,3-heptanetriol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.244 |
| 2R1D Crystal structure of rat neurexin 1beta in the Ca2+ containing form 提交 2007-08-22 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H
78–302（225 aa）
片段：LNS/LG domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；21% Peg 5000 MME, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 0.2 M AmSO4, 1.86% 1,2,3-heptanetriol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.244 |
| 2R1D Crystal structure of rat neurexin 1beta in the Ca2+ containing form 提交 2007-08-22 | Assembly 9 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 I
78–302（225 aa）
片段：LNS/LG domain
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；21% Peg 5000 MME, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 0.2 M AmSO4, 1.86% 1,2,3-heptanetriol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.244 |
| 2WQZ Crystal structure of synaptic protein neuroligin-4 in complex with neurexin-beta 1: alternative refinement 提交 2009-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
80–200（121 aa）
片段：LNS DOMAIN, RESIDUES 80-258
链 D
201–258（58 aa）
片段：LNS DOMAIN, RESIDUES 80-258
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；8% PEG 20000, 0.1M MES PH6.5
|
分辨率 3.90 Å R-free 0.276 |
| 2WQZ Crystal structure of synaptic protein neuroligin-4 in complex with neurexin-beta 1: alternative refinement 提交 2009-08-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
80–200（121 aa）
片段：LNS DOMAIN, RESIDUES 80-258
链 C
201–258（58 aa）
片段：LNS DOMAIN, RESIDUES 80-258
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；8% PEG 20000, 0.1M MES PH6.5
|
分辨率 3.90 Å R-free 0.276 |
| 2XB6 Revisited crystal structure of Neurexin1beta-Neuroligin4 complex 提交 2010-04-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
80–258（179 aa）
片段：LNS DOMAIN, RESIDUES 80-258
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 CL CHLORIDE ION × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.3；100MM MES PH6.3,10% PEG 20000, 2MM CACL2
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.236 |
| 2XB6 Revisited crystal structure of Neurexin1beta-Neuroligin4 complex 提交 2010-04-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
80–258（179 aa）
片段：LNS DOMAIN, RESIDUES 80-258
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 CL CHLORIDE ION × 3 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.3；100MM MES PH6.3,10% PEG 20000, 2MM CACL2
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.236 |
| 3BIW Crystal structure of the Neuroligin-1/Neurexin-1beta synaptic adhesion complex 提交 2007-12-01 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
47–201（155 aa）
片段：extracellular LNS domain of Neurexin-1beta
链 E
232–299（68 aa）
片段：extracellular LNS domain of Neurexin-1beta
链 H
47–201（155 aa）
片段：extracellular LNS domain of Neurexin-1beta
链 H
232–299（68 aa）
片段：extracellular LNS domain of Neurexin-1beta
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；8% PEG6000, 0.1 M MgCl2, 0.1 M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.276 |
| 3BIW Crystal structure of the Neuroligin-1/Neurexin-1beta synaptic adhesion complex 提交 2007-12-01 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
47–201（155 aa）
片段：extracellular LNS domain of Neurexin-1beta
链 F
232–299（68 aa）
片段：extracellular LNS domain of Neurexin-1beta
链 G
47–201（155 aa）
片段：extracellular LNS domain of Neurexin-1beta
链 G
232–299（68 aa）
片段：extracellular LNS domain of Neurexin-1beta
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；8% PEG6000, 0.1 M MgCl2, 0.1 M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.276 |