当前蛋白身份:Q6EDY6 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2KZ7 Solution structure of the CARMIL CAH3a/b domain bound to capping protein (CP) 提交 2010-06-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 965–1039(75 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;305 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 ambient
NMR样品组成 0.35 mM [U-99% 15N; U-80% 2H] CPalpha subunit, 0.35 mM [U-99% 15N; U-80% 2H] CPbeta subunit, 0.39 mM [U-2H] CARMIL CAH3a/b domain, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.35 mM [U-99% 15N; U-80% 2H] CARMIL CAH3a/b domain, 0.39 mM [U-2H] CPalpha subunit, 0.39 mM [U-2H] CPbeta subunit, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.35 mM [U-99% 15N; U-80% 2H] CPalpha subunit, 0.35 mM [U-99% 15N; U-80% 2H] CPbeta subunit, 0.39 mM [U-2H; spin labeled at 1 or 5 postions] CARMIL CAH3a/b domain, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
分辨率未提供
3AA0 Crystal structure of Actin Capping Protein in complex with the Cp-binding motif derived from CARMIL 提交 2009-11-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 985–1005(21 aa) 片段:CP-BINDING MOTIF, recidues 985-1005
未记录 CO3 CARBONATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;18% PEG 400, 40MM BACL2, 100MM MES-NAOH, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 1.70 Å R-free 0.239
3AAE Crystal structure of Actin capping protein in complex with CARMIL fragment 提交 2009-11-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 X 971–1002(32 aa) 片段:CP-BINDING MOTIF, residues 971-1002
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;14% PEG 3350, 180MM TRI-AMMONIUM CITRATE, 100MM MES-NAOH, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.271
3AAE Crystal structure of Actin capping protein in complex with CARMIL fragment 提交 2009-11-16 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 Y 971–1002(32 aa) 片段:CP-BINDING MOTIF, residues 971-1002
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;14% PEG 3350, 180MM TRI-AMMONIUM CITRATE, 100MM MES-NAOH, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.271
3AAE Crystal structure of Actin capping protein in complex with CARMIL fragment 提交 2009-11-16 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 Z 971–1002(32 aa) 片段:CP-BINDING MOTIF, residues 971-1002
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;14% PEG 3350, 180MM TRI-AMMONIUM CITRATE, 100MM MES-NAOH, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.271
3AAE Crystal structure of Actin capping protein in complex with CARMIL fragment 提交 2009-11-16 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 W 971–1002(32 aa) 片段:CP-BINDING MOTIF, residues 971-1002
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;14% PEG 3350, 180MM TRI-AMMONIUM CITRATE, 100MM MES-NAOH, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.271
3AAE Crystal structure of Actin capping protein in complex with CARMIL fragment 提交 2009-11-16 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 V 971–1002(32 aa) 片段:CP-BINDING MOTIF, residues 971-1002
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;14% PEG 3350, 180MM TRI-AMMONIUM CITRATE, 100MM MES-NAOH, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.271
4K17 Crystal Structure of mouse CARMIL residues 1-668 提交 2013-04-04 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–668(668 aa) 片段:PH and LRR domains (UNP residues 1-668)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.7;293 K;16 % PEG3350, 130 mM lithium sulfate, 0.25 % w/v salicylamide, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.259
4K17 Crystal Structure of mouse CARMIL residues 1-668 提交 2013-04-04 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–668(668 aa) 片段:PH and LRR domains (UNP residues 1-668)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) OHB salicylamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.7;293 K;16 % PEG3350, 130 mM lithium sulfate, 0.25 % w/v salicylamide, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.259
4K17 Crystal Structure of mouse CARMIL residues 1-668 提交 2013-04-04 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 1–668(668 aa) 片段:PH and LRR domains (UNP residues 1-668)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.7;293 K;16 % PEG3350, 130 mM lithium sulfate, 0.25 % w/v salicylamide, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.259
4K17 Crystal Structure of mouse CARMIL residues 1-668 提交 2013-04-04 Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 D 1–668(668 aa) 片段:PH and LRR domains (UNP residues 1-668)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.7;293 K;16 % PEG3350, 130 mM lithium sulfate, 0.25 % w/v salicylamide, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.259