当前蛋白身份:Q6MX01
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7KIF Mycobacterium tuberculosis WT RNAP transcription open promoter complex with WhiB7 transcription factor 提交 2020-10-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:undecameric(11) 与全部聚合物一致 |
链 Z
1–92(92 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.94 Å |
| 7KIM Mycobacterium tuberculosis WT RNAP transcription closed promoter complex with WhiB7 transcription factor 提交 2020-10-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:undecameric(11) 与全部聚合物一致 |
链 Z
1–92(92 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.38 Å |
| 7KUF Transcription activation subcomplex with WhiB7 bound to SigmaAr4-RNAP Beta flap tip chimera and DNA 提交 2020-11-24 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–92(92 aa)
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;291 K;0.2-0.3 M NH4H2PO4
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.255 |
| 7KUG Fe-S cluster-bound transcription activator WhiB7 in complex with the SigmaAr4-RNAP Beta flap tip chimera 提交 2020-11-24 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–79(79 aa)
|
突变:L27M, L42M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;291 K;0.1 M Tris pH 8.0,
10-15% PEG8000,
2-5% PGA
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.200 |
| 7KUG Fe-S cluster-bound transcription activator WhiB7 in complex with the SigmaAr4-RNAP Beta flap tip chimera 提交 2020-11-24 | Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
1–79(79 aa)
|
突变:L27M, L42M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;291 K;0.1 M Tris pH 8.0,
10-15% PEG8000,
2-5% PGA
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.200 |