当前蛋白身份:Q6MX01 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7KIF Mycobacterium tuberculosis WT RNAP transcription open promoter complex with WhiB7 transcription factor 提交 2020-10-23 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:undecameric(11) 与全部聚合物一致
链 Z 1–92(92 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
7KIM Mycobacterium tuberculosis WT RNAP transcription closed promoter complex with WhiB7 transcription factor 提交 2020-10-23 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:undecameric(11) 与全部聚合物一致
链 Z 1–92(92 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
7KUF Transcription activation subcomplex with WhiB7 bound to SigmaAr4-RNAP Beta flap tip chimera and DNA 提交 2020-11-24 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 A 1–92(92 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;291 K;0.2-0.3 M NH4H2PO4
分辨率 2.60 Å R-free 0.255
7KUG Fe-S cluster-bound transcription activator WhiB7 in complex with the SigmaAr4-RNAP Beta flap tip chimera 提交 2020-11-24 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–79(79 aa)
突变:L27M, L42M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;291 K;0.1 M Tris pH 8.0, 10-15% PEG8000, 2-5% PGA
分辨率 1.55 Å R-free 0.200
7KUG Fe-S cluster-bound transcription activator WhiB7 in complex with the SigmaAr4-RNAP Beta flap tip chimera 提交 2020-11-24 Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–79(79 aa)
突变:L27M, L42M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;291 K;0.1 M Tris pH 8.0, 10-15% PEG8000, 2-5% PGA
分辨率 1.55 Å R-free 0.200