当前蛋白身份：Q6PJF2
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2AGJ Crystal Structure of a glycosylated Fab from an IgM cryoglobulin with properties of a natural proteolytic antibody 提交 2005-07-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
21–235（215 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 15000-20000, sodium chloride, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
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分辨率 2.60 Å R-free 0.279 |
| 4YPG Structural Insights Into the Neutralization Properties of a Human Anti-Interferon Monoclonal Antibody 提交 2015-03-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
21–235（215 aa）
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未记录 | NI NICKEL (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.01 M NiCl2, 0.1 M Tris HCl
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分辨率 3.00 Å R-free 0.272 |
| 4YPG Structural Insights Into the Neutralization Properties of a Human Anti-Interferon Monoclonal Antibody 提交 2015-03-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 L
21–235（215 aa）
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未记录 | NI NICKEL (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.01 M NiCl2, 0.1 M Tris HCl
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.272 |
| 6MYY Germline VRC01 antibody recognition of a modified clade C HIV-1 envelope trimer, 3 Fabs bound, sharpened map 提交 2018-11-02 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 C
127–235（109 aa）
片段：germline VK3-11 with the mature CDR L3 of VRC01
链 F
127–235（109 aa）
片段：germline VK3-11 with the mature CDR L3 of VRC01
链 L
127–235（109 aa）
片段：germline VK3-11 with the mature CDR L3 of VRC01
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.80 Å |
| 6MZJ Germline VRC01 antibody recognition of a modified clade C HIV-1 envelope trimer, 2 Fabs bound, sharpened map 提交 2018-11-05 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 C
127–235（109 aa）
片段：germline VK3-11 with the mature CDRL3 of VRC01
链 L
127–235（109 aa）
片段：germline VK3-11 with the mature CDRL3 of VRC01
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.80 Å |
| 6UDK HIV-1 bNAb 1-55 in complex with modified BG505 SOSIP-based immunogen RC1 and 10-1074 提交 2019-09-19 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 E
122–235（114 aa）
链 L
122–235（114 aa）
链 N
122–235（114 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；0 blot force, 3.5 second blot time, 3 uL sample added to freshly glow-discharged grids
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分辨率 3.90 Å |
| 8QH0 Crystal structure of the SARS-CoV-2 RBD with the antibody Cv2.3194 提交 2023-09-06 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 L
21–234（214 aa）
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未记录 | PRO PROLINE × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；20% PEG 3350, 0.2 M lithium citrate
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分辨率 1.87 Å R-free 0.209 |
| 8QH1 Crystal structure of the SARS-CoV-2 RBD from the Omicron BA4 variant with the antibody Cv2.3194 提交 2023-09-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 L
21–235（215 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG 3350, 0.2 M sodium malonate
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分辨率 2.65 Å R-free 0.232 |